Scielo RSS <![CDATA[Revista de la Academia Colombiana de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales]]> http://www.scielo.org.co/rss.php?pid=0370-390820160001&lang=e vol. 40 num. 154 lang. e <![CDATA[SciELO Logo]]> http://www.scielo.org.co/img/en/fbpelogp.gif http://www.scielo.org.co <link>http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0370-39082016000100001&lng=e&nrm=iso&tlng=e</link> <description/> </item> <item> <title/> <link>http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0370-39082016000100002&lng=e&nrm=iso&tlng=e</link> <description>El origen, la función y el repertorio de las células B de memoria IgM humanas (caracterizadas por ser positivas para CD27 IgM e IgD) son controvertidos, y se ha propuesto que esta población es heterogénea. Aunque algunas veces contradictorias, las evidencias actuales apuntan a la existencia de por lo menos dos subpoblaciones de dichas células en sangre: por un lado, células B circulantes de la zona marginal del bazo, con algunas características similares a las células innatas y probablemente responsables de las respuestas de activación independiente de los linfocitos T, que protegen contra bacterias encapsuladas como Streptococcus sp, y, por otro lado, células B con indicios de haber pasado por centros germinales que se asemejan a las células B de la respuesta adaptativa, y que serían un reservorio de células B de larga vida a partir del cual se reconstituirían continuamente las células B de memoria conmutadas. Aunque se ha propuesto que la expresión diferencial de IgM e IgD en las células B de memoria IgM serviría para distinguir estas dos subpoblaciones de células B, se requieren más estudios fenotípicos y funcionales para sustentar esta clasificación<hr/>The origin, function and repertoire of human IgM memory B cells (IgM mBc, characterized by the expression of CD27+ IgM+ IgD+) are controversial, and it has been proposed that this population is heterogeneous. Although contradictory in some cases, available evidence suggests that at least two subpopulations of IgM mBc circulate in blood. On the one hand, circulating B cells from the marginal zone of the spleen with innate-like characteristics, probably responsible for protective responses against encapsulated bacteria like Streptococcus sp. On the other hand, B cells with markers that suggest they have undergone transit in germinal centers, typical of adaptive immunity, and that may represent a reservoir of long-lived mBc capable of reconstituting switched mBc. It has been proposed that the differential expression of IgM and IgD on circulating IgM mBc may be useful to distinguish these subpopulations, but more phenotypic and functional studies are needed for this purpose</description> </item> <item> <title/> <link>http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0370-39082016000100003&lng=e&nrm=iso&tlng=e</link> <description>La vía de entrada y el principal sitio de replicación de los rotavirus es el intestino delgado. En este órgano el TGF-beta juega un papel muy importante para mantener la tolerancia a los alimentos y microorganismos comensales. Por esta razon, es probable que esta citocina juegue un papel modulador en esta infección. Experimentos in vitro de nuestro laboratorio han mostrado que células humanas epiteliales infectadas por rotavirus aumentan la secreción de TGF-beta y promueven una baja respuesta de linfocitos T, la que es necesaria para la inmunidad antiviral. En este artículo de revisión se analiza en forma crítica la hipótesis que los rotavirus inducen la producción de TGF-beta como mecanismo de evasión inmune<hr/>Rotavirus enter their host and predominantly replicates in the small intestine. In this organ, TGF-beta plays an important role in maintaining tolerance to commensal microorganisms and food. For this reason, it is probable that this citokine plays a role in modulating viral infection. Results from our laboratory have shown that in vitro human cells infected with rotavirus secrete increased levels of TGF-beta and promote an attenuated T cell response, which is necessary for protective cellular immunity. In this review article, I will critically evaluate the hypothesis that rotavirus induce the production of TGF-beta as an immune evasion mechanism</description> </item> <item> <title/> <link>http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0370-39082016000100004&lng=e&nrm=iso&tlng=e</link> <description>Este artículo presenta un método de modelado, simulación e implementación de un sistema fotovoltaico autónomo. El modelo está basado en un circuito equivalente del panel fotovoltaico; teniendo en cuenta la interacción de éste con los elementos que componen el sistema y con los parámetros medioambientales (radiación solar, velocidad del viento y temperatura ambiente) que influencian su funcionamiento. Este circuito equivalente esta descrito en términos de fotocorriente, un diodo, una resistencia en serie y una resistencia de juntura. La simulación del desempeño de este modelo se realiza teniendo en cuenta parámetros medioambientales recolectados en un periodo de un año y se valida comparando sus resultados con los de un modelo experimental. Los resultados obtenidos son comparables entre sí en términos de potencia.<hr/>This paper presents a method of modelling, simulation and implementation of a stand-alone photovoltaic system. This model is based on the elements of an equivalent circuit of photovoltaic panel keeping in mind the interaction with elements of the system and environmental parameters (irradiation, temperature). The equivalent circuit is described in terms of photocurrent, a diode, a series resistor and a resistance shunt. The performance simulation this model are done taking into account environmental parameters collected over a period of one year and is validated with an experimental model which was built and comparable results were obtained in terms of power.</description> </item> <item> <title/> <link>http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0370-39082016000100005&lng=e&nrm=iso&tlng=e</link> <description>La interacción de las ondas de espín y los portadores electrónicos en un medio magnético es descrita desde la aproximación semiclásica de Landau-Lifshitz-Gilbert-Bazaliy (LLGB), adaptando el formalismo del propagador de difusión en sistemas infinitamente extendidos y confinados. La corrección estática y termodinámica de las fluctuaciones transversales en la susceptibilidad magnética es obtenida en términos de la densidad de corriente de portadores de carga Je y la intensidad del campo magnético externo H0Z, encontrándose una relación crítica del tipo Je ~ H½OZ en sistemas unidimensionales. La respuestan de la distribución de la densidad de portadores de espín en función de Je, así como su correlación con la corriente de espín (J S) en estado estacionario, son discutidas para diferentes valores del campo aplicado y la diferencia de fase en la magnetización sobre las fronteras. El diagrama de fases asociado al tiempo de vida medio de la emisión de ondas de espín estimuladas térmicamente es calculado. El rôle del factor del Gilbert en la estabilidad térmica de los estados de ondas de espín es analizado cuantitativamente en este escenario.<hr/>Spin waves - electron carrier interaction in a magnetic medium is described from the Landau-Lifshitz-Gilbert-Bazaliy (LLGB) approximation, by adapting the diffusion propagator formalism on both infinitely extended and confined systems. The static and thermal correction due to the transverse fluctuations on the magnetic susceptibility are obtained in terms of the carrier density current Je and the externally applied field H0Z, providing a critical relationship giving by Je ~ H½OZ, which is valid for 1D systems. The spin density distribution response as a function of Je, as well as its correlation with the spin current (J S) in steady state, are discussed for different values of the applied field and boundary magnetization phase difference. Average lifetime phase diagram for thermally stimulated spin waves is also calculated. The Gilbert factor rôle on the thermal stability for the spin waves states is also quantitatively analyzed in this scenario.</description> </item> <item> <title/> <link>http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0370-39082016000100006&lng=e&nrm=iso&tlng=e</link> <description>En este estudio se exploró el problema que entraña calcular un conjunto preliminar de parámetros orbitales para asteroides a partir de la observación de sus posiciones relativas en la esfera celeste. Se implementó un método computacional basado en las integrales de Kepler en una variante geocéntrica y en una topocéntrica. El método se aplicó para cinco cuerpos pertenecientes a la familia de asteroides MBA (main belt asteroids) y cinco de la familia NEO (near Earth object). Además, se analizaron los resultados y los errores en ambas versiones del algoritmo. Los resultados mostraron que el método implementado es adecuado para obtener órbitas preliminares. En general, la versión más precisa para ambas familias de asteroides fue la topocéntrica. También se encontró que la corrección topocéntrica fue más notable para los NEO, puesto que la diferencia entre los errores geocéntricos y topocéntricos expresada como promedio casi dobló la diferencia para los MBA, lo que implica que en el caso de estos cuerpos, la versión del algoritmo utilizada debe ser la topocéntrica debido a la dificultad de hacerles seguimiento si existen incertidumbres muy altas.<hr/>This paper dealt with the problem of computing an initial set of orbital parameters for asteroids from observations of their relative positions on the celestial sphere. A method based on the two-body integrals was computationally implemented in a geocentric and a topocentric version. This method was applied to five MBA asteroids and five NEO asteroids. The results and errors obtained for both versions of the algorithm were analyzed. The results showed that for both asteroid families, generally the most precise version of the algorithm was the topocentric version. The topocentric correction appears to be better suited for estimating orbit parameters for NEO asteroids in our sample, as, in average, the difference between the geocentric and topocentric errors almost doubled the differences for the MBA asteroids. This means that for these objects the version of the algorithm used should be the topocentric version due to the difficulty of tracking these objects if the uncertainties are high.</description> </item> <item> <title/> <link>http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0370-39082016000100007&lng=e&nrm=iso&tlng=e</link> <description>En este trabajo se presentan los resultados de una campaña observacional de tres años durante la cual se realizaron medidas de la calidad del cielo in-situ en seis sitios de interés astronómico en los departamentos de Santander, Boyacá, Tolima, Huila, Cesár y La Guajira. Se realizaron excursiones esporádicas y de corta duración a estos seis lugares con el fin de realizar mediciones de temperatura y humedad a lo largo de la noche, del nivel de turbulencia en la vecindad del telescopio ó Seeing, del brillo del cielo y de la extinción atmosférica. La metodología utilizada en las medidas del Seeing se validó a través del uso de imágenes satelitales simultáneas a nuestras visitas, obtenidas de la base de datos del satelite geoestacionario GOES 13. El Seeing es altamente variable a lo largo de la noche en todos los sitios, con valores entre 1" y 4". Las difíciles condiciones climatológicas en especial la elevada humedad registrada durante la campaña, impidieron obtener una estadística mínima de datos fotométricos por lo que el análisis comparativo de los lugares visitados está basado en las medidas de Seeing. Una prueba de Kolmogorov-Smirnov confirma que los valores más bajos se registraron en los lugares de mayor altura en el Oriente colombiano, en particular en el sitio La Bricha, una vereda del municipio de Macaravita en Santander en donde la variabilidad registrada fué la menor con un rms = 0,59''. Este hecho sumado a la humedad inferior a 85% incluso durante la madrugada y el bajo nivel observado en el brillo de cielo sugieren que de los lugares visitados durante la campaña, La Bricha puede considerarse como un sitio apropiado para la ubicación de instrumentación astronómica en el rango óptico. No obstante, se recomienda realizar un monitoreo a largo plazo con el fin de caracterizar completamente el lugar.<hr/>In this work we present the results obtained from an observational campaign aimed to conduct measurements in-situ of the quality of the sky at six sites with astronomical interest in Santander, Boyacá, Tolima, Huila, Cesár and La Guajira. Short and sporadic expeditions were done to those places with the main goal to conduct measurements of temperature, humidity during the night, the level of turbulence in the vicinity of the telescope, the Seeing, the sky brightness and the atmospheric extinction. The adopted methodology for the Seeing measurements was validated with satellite data simultaneous to our visits, obtained from the data archive of the geostationary satellite GOES 13. All sites present Seeing highly variable along the night with values between 1'' and 4''. The bad weather and specially, the high humidity registered during the campaign limited the quality of photometric data and subsequently, the comparative analysis of the visited sites is based on the Seeing measurements. An statistical Kolmogorov-Smirnov test confirm that the lowest values are observed in high altitude sites over the Eastern Andes in particular at La Bricha in Macaravita-Santander where we get the lowest variability with rms = 0,59''. This fact together with the low humidity, less than 85% even during the dawn and the low level of the sky brightness suggest that La Bricha is a suitable place for location of astronomical instrumentation in the visible range. However, it is highly recommended to conduct a long-term monitoring of the place with the aim to characterize the site properly.</description> </item> <item> <title/> <link>http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0370-39082016000100008&lng=e&nrm=iso&tlng=e</link> <description>Se estudió la actividad antimicrobiana de películas delgadas de dióxido de titanio (TiO2) solo y modificado con plata. Las películas de TiO2 solo se sintetizaron con el método Doctor Blade y las modificadas con plata con el método de fotorreducción química bajo irradiación UV. Las propiedades de las películas se midieron por espectroscopia Raman y microscopía electrónica de barrido; también se determinó el efecto de la incorporación de las partículas de plata en las propiedades antimicrobianas de las películas de TiO2 frente a Staphylococcus aureus. Los resultados de la caracterización indicaron que las partículas de plata se aglomeraban sobre la superficie del TiO2 generando agregados del orden de los 200 nm; en el análisis por espectroscopia Raman se vio que los agregados de plata depositados sobre las películas de TiO2 podrían presentar el fenómeno de resonancia de plasmones superficiales localizada. El ensayo preliminar de la actividad antimicrobiana indicó que la modificación de las películas de TiO2 con partículas de plata aumentó en 2,18 veces la eficiencia del proceso.<hr/>We studied titanium dioxide (TiO2) thin films and silver-modified titanium dioxide thin films antimicrobial activity. The TiO2 thin films were synthesized using Doctor Blade method. The synthesis of silver-modified films was done by chemical photoreduction under UV irradiation. Materials were characterized by Raman spectroscopy and scanning electron microscopy (SEM) measurements. We determined the antimicrobial effect against Staphylococcus aureus of the incorporation of silver particles on TiO2. Results indicated silver particles agglomerated on the surface of TiO2 generating aggregates of around 200 nm. Raman spectroscopy suggested that silver aggregates may present the plasmon resonance superficial phenomenon. The antimicrobial activity assay indicated that the TiO2 films modification with silver increased by 2.18 times the efficiency of the process.</description> </item> <item> <title/> <link>http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0370-39082016000100009&lng=e&nrm=iso&tlng=e</link> <description>Los bosques secos tropicales en América del Sur son uno de los ecosistemas menos conocidos y presenta una de las mayores pérdidas de cobertura anual. Con el objetivo de entender la dinámica estacional de estos remanentes de bosque y generar herramientas de conservación, se ha propuesto la utilización de grupos indicadores como el de los escarabajos coprófagos. Durante las épocas de sequía y de lluvias en el 2012 se hizo un muestreo con el fin de conocer la estructura del ensamblaje de escarabajos coprófagos (Coleoptera: Scarabaeinae) en una parcela permanente de bosque seco tropical en la Universidad del Magdalena, distrito de Santa Marta (Magdalena, Colombia). Se instalaron tres transectos en la parcela con trampas de caída cebadas con excremento humano. Se registraron 5.001 individuos pertenecientes a 13 especies y siete géneros. Cabe resaltar la abundancia de la especie Canthon variabilis en las dos épocas. No se encontraron diferencias significativas en la abundancia entre las dos épocas, pero sí en la riqueza. De las 13 especies encontradas, 11 se registraron en la época de sequía y ocho en la de lluvias, en tanto que siete se encontraron exclusivamente en una u otra de las dos épocas. No se registró la presencia de Malagoniella astyanax ni de Digitonthophagus gazella, lo cual indica que el fragmento tiene un grado intermedio de conservación. El nómero de especies y la estructura del ensamblaje concordaron con lo registrado para la región Caribe, y se evidenció una marcada dinámica estacional. Es necesario continuar con este tipo de estudios y analizar el efecto funcional de la fragmentación y el tamaño de los fragmentos en los procesos y servicios ecosistémicos.<hr/>Tropical dry forests in South America are one of the less known ecosystems and they exhibit one of the biggest annual losses in forest cover. From a conservationist perspective, it has been proposed to use indicator groups such as dung beetles to try to understand the seasonal dynamics of the species community structure of these forest remnants. Sampling was performed during the dry and rainy seasons in 2012 to characterize the species composition of the dung beetle assemblage (Coleoptera: Scarabaeinae) in a permanent plot of dry forest located in the University of Magdalena, Santa Marta district (Magdalena - Colombia). Three sampling transects were set up in the parcel using pitfall traps baited with human dung. A total of 5,001 individuals, corresponding to 13 species and seven genera were registered. The abundance of the species Canthon variabilis during the two seasons was noteworthy. Although no significant differences in abundance between seasons were found, they were registered for species richness. Of the 13 species that we found, eight appeared exclusively in one season. The absence of Malagoniella astyanax and Digitonthophagus gazella indicates that the parcel has an intermediate degree of conservation. The number of species and the structure of the assemblage matched with values of other studies carried out in the Caribbean region showing a strong seasonal dynamic. Our results highlight that it is necessary to continue with this type of studies, analyzing the functional effects of fragmentation and fragment size in ecosystem services and processes.</description> </item> <item> <title/> <link>http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0370-39082016000100010&lng=e&nrm=iso&tlng=e</link> <description>From one of the most complete Lower Cretaceous rock sequences in the world (in Villa de Leiva region, central Colombia), we describe a new genus and species of pliosaurid plesiosaur Stenorhynchosaurus munozi. Stenorhynchosaurus displays a series of features which differentiate it from all the other Cretaceous pliosaurid genera: the anterior of the vomer, in ventral view, posterior of the palatal premaxilla-maxilla suture, contacting the posterior palatal process of the premaxilla level with the third maxillary alveolus; rostrum narrow and elongated with straight sides in dorsal view; lacrimal forming the anterior border and greater part of the ventral border of the orbit and broadly borders the maxilla anteriorly; anterior interpterygoid vacuity present; internal nares located between vomer and maxilla at the level of 13th-15th maxillary alveoli; anterior of rostrum and mandible without lateral expansion or marked increase in size of the functional alveoli; penultimate premaxillary alveolus slightly larger than adjacent premaxillary alveoli; homodont maxillary functional alveoli, with fourth tooth positions very slightly enlarged with respect to the neighboring alveoli; homodont dentary dentition; and epipodials extremely short. Based on morphological analysis of phylogenetic characters, Stenorhynchosaurus most likely nests within the increasingly inclusive Pliosauridae and Pliosauroidea, however, as currently defined, firm inference for referral of Stenorhynchosaurus to Thalassophonea is much more problematic, but ultimately seems likely based on characters shared with Pliosaurus and Brachaucheninae. However, this uncertainty indicates Thalassophonea requires rigorous redefinition. As to whether Stenorhynchosaurus is a member of the currently exclusively Jurassic genus Pliosaurus, or the Cretaceous sub-family Brachaucheninae, remains equivocal.<hr/>Se describe un nuevo género y especie de pliosáurido, Stenorhynchosaurus munozi, procedente de una de las secuencias de rocas del Cretácico Inferior más completas del mundo (en la región de Villa de Leiva, centro de Colombia). Stenorhynchosaurus exhibe una serie de características que lo diferencian de los demás géneros de pliosáuridos cretácicos: extremo anterior del vómer en vista ventral en posición posterior a la sutura palatal premaxilar-maxilar, contactando al proceso palatal del premaxilar al nivel del tercer alveolo maxilar; rostro angosto y alargado con lados rectos en vista dorsal; lagrimal formando el borde anterior y gran parte del borde ventral de la órbita y limitando ampliamente el maxilar anteriormente; cavidad inter-pterigoidea presente; narinas internas ubicadas entre el vómer y el maxilar, al nivel de los alvéolos 13 y 15; parte anterior del rostro y de la mandíbula sin expansión lateral o incremento marcado en el tamaño de los alvéolos funcionales; penóltimo alvéolo premaxilar ligeramente más grande que los adyacentes; alvéolos funcionales maxilares homodontes, el cuarto apenas más grande que los adyacentes; dentición dentaria homodonte; y epipodios extremadamente cortos. Con base en un análisis de caracteres filogenéticos, Stenorhynchosaurus corresponde con mayor seguridad a los cada vez más incluyentes Pliosauridae and Pliosauroidea, mientras la inferencia para referir Stenorhynchosaurus a Thalassophonea es más problemática, pero finalmente parece probable basada en caracteres compartidos con Pliosaurus y Brachaucheninae. Esta incertidumbre indica que Thalassophonea require de una redefinición rigurosa. Decir si Stenorhynchosaurus es un miembro del género Pliosaurus, por ahora exclusivamente jurásico, o de la subfamilia Brachaucheninae, es equívoco.</description> </item> <item> <title/> <link>http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0370-39082016000100011&lng=e&nrm=iso&tlng=e</link> <description>Plagiochila is the largest genus of bryophytes of Colombia. A total of 175 species have been recorded from the country but the majority of these are synonyms. In this paper 57 species are accepted for Colombia. A key to the Colombian species of Plagiochila is provided and each species is briefly described, with data on types, synonyms, published illustrations, morphology, geographical distribution and habitat, as well as a brief discussion of differentiating characters and taxonomic affinity. Among the countries of tropical America, Colombia has the highest diversity of Plagiochila followed by Ecuador (53 species) and Costa Rica (50 species). More than half of the Colombian species are widely distributed throughout tropical America and seven of them occur also in Africa and/or Western Europe. About one fourth of the species are restricted to the northern Andes, which is the centre of diversity of Plagiochila in the New World. The majority of the species grow as epiphytes in humid Andean forests. Diversity peaks in the upper montane forest belt between 2000-3000 m. Sixteen species occur in the páramo belt and five are exclusive to páramo. Eighteen species occur in lowland rainforest. Plagiochila eggersii, recorded from lowland rainforest of the Chocó, is new to Colombia. Key words: Andean forest, bryophytes, Colombia, elevational distribution, liverworts, páramo, Plagiochila, taxonomy.<hr/>Plagiochila es el mayor género de briófitos de Colombia. Un total de 175 especies han sido registradas para el país, pero la mayoría de estos nombres son sinónimos. En este trabajo se aceptan 57 especies para Colombia. Se proporciona una clave para las especies colombianas de Plagiochila y cada especie se describe brevemente con datos sobre los tipos, sinónimos, ilustraciones publicadas, morfología, distribución y hábitat, así como un breve análisis de sus caracteres principales y afinidad taxonómica. Entre los países de la América tropical, Colombia tiene la mayor diversidad de Plagiochila seguido de Ecuador (53 especies) y Costa Rica (50 especies). Más de la mitad de las especies colombianas están ampliamente distribuidas en América tropical y siete de ellas se presentan también en África y / o Europa occidental. Alrededor de una cuarta parte de las especies están restringidas para los Andes del norte, que es el centro de diversidad de Plagiochila en el Nuevo Mundo. La mayoría de las especies crecen como epífitas en bosques hómedos andinos. La mayor diversidad se encuentra entre 2000-3000 m. Dieciséis especies se encuentran en los páramos y cinco son exclusivas de páramo. Dieciocho especies se encuentran en la selva tropical. Plagiochila eggersii, encontrada en la selva del Chocó, es nueva para Colombia.</description> </item> <item> <title/> <link>http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0370-39082016000100012&lng=e&nrm=iso&tlng=e</link> <description>Silica structures were analyzed in three species used by both pre-Hispanic and present-day populations in central Colombia: squash, common bean, and achira. In squash (Cucurbita ficifolia Bouché), structures were found in leaves and fruit epidermis, with undulated scalloped phytoliths and trichome forms. In achira (Canna indica L.), globular phytoliths with circular ornamentation in the center were found in leaves and corresponded to the Globulolita morpho-tribe. In common bean (Phaseolus vulgaris L.), elongated phytoliths with hooked ends were found on leaves and belonged to the Capilusita morpho-tribe. Through the standardization of the phytolith extraction protocol (dry ashing method), we established that leaves are the structures with the highest content of phytoliths in the species studied.<hr/>Se analizaron las estructuras silíceas en tres especies consideradas de uso prehispánico y actual en el centro de Colombia: calabaza, fríjol y achira. En la calabaza (Cucurbita ficifolia Bouché) se encontraron fitolitos festoneados, con ondulaciones, en forma de tricoma en hojas y epidermis del fruto. En las hojas de achira (Canna indica L.) se encontraron fitolitos globulares con ornamentación circular en el centro que correspondían a la morfotribu Globulolita. En las hojas de fríjol (Phaseolus vulgaris L.) se encontraron fitolitos de cuerpos alargados con terminación en forma de gancho pertenecientes a la morfotribu Capilusita. Mediante la estandarización del protocolo de extracción de fitolitos (dry ashing method) se estableció que la hoja fue la estructura donde se encontró el mayor contenido de fitolitos en estas especies.</description> </item> <item> <title/> <link>http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0370-39082016000100013&lng=e&nrm=iso&tlng=e</link> <description>The lack of organisation of monophyletic lineages in the phylogeny and taxonomy of the group formerly known as protists has precluded the understanding of the group's evolutionary history and trait comparison among members of the group. We used a phylogenomic approach to establish phylogenetic hypotheses of this group of organisms. We used an automatic orthologous clustering (OrthoMCL)-based strategy to recover 72 clusters of orthologues from 73 eukaryotic species. A maximum likelihood tree was inferred from the supermatrix. Overall, we obtained consistent inferences with previous published ones, but some unexpected phylogenetic relationships were poorly supported. Despite the large quantity of genes from the Opisthokonta groups, this clade was recovered as polyphyletic. We failed to recover a monophyletic Excavata group, most likely because of long- branch attraction artefacts. A second dataset was constructed after removing the fast-evolving/saturated sites, and a Shimodaira-Hasegawa test was performed to verify whether our data allowed us to reject relationships in previous hypotheses. The results of these tests suggested that the competing tree topologies were not significantly better than our recovered topologies. Novel relationships were shown inside the Opisthokonta, for two species, Thecamonas trahens and Capsaspora owczarzaki. Additionally, some controversial phylogenetic positions among several eukaryotic groups were found. We discuss the relative positions of the Alveolata and Stramenopila groups, the latter being of special interest in our research group.<hr/>La falta de organización en linajes discretos en la filogenia y la taxonomía del grupo anteriormente llamado protistas ha retrasado la comprensión de la historia evolutiva del grupo y la comparación de rasgos entre los miembros del mismo. En este estudio usamos una aproximación filogenómica para plantear hipótesis filogenéticas del grupo mencionado. Usamos una estrategia basada en el agrupamiento automático de ortólogos (OrthoMCL) para recuperar 72 grupos de ortólogos de 73 especies. Un árbol obtenido con el método de maxima verosimilitud fue estimado a partir de una supermatriz de datos. De manera general obtuvimos inferencias filogenéticas consistentes con publicaciones previas pero se observaron algunos patrones de ramificación inesperados con valores bajos de soporte. A pesar de la gran cantidad de genes de los grupos Opisthokonta, este clado aparece polifilético. No pudimos demostrar la monofilia de Excavata, muy probablemente debido a artefactos de atracción de ramas largas. Un segundo conjunto de datos fue construido luego de eliminar los sitios de rápida evolución/saturados. El test de Shimodaira-Hasegawa se calculó con el fin de verificar si nuestros datos e inferencias filogenéticas controvertían patrones de ramificación reportados previamente. Los resultados de los tests sugieren que las topologías propuestas en estudios previos no son significativamente mejores que las topologías propuestas en este estudio. Nuevas relaciones fueron encontradas dentro de los Opisthokonta, para dos especies, Thecamonas trahens y Capsaspora owczarzaki. Adicionalmente, algunas posiciones filogenéticas controversiales se encontraron para varios grupos eucariotas con nuestra aproximación filogenómica. En el estudio se discuten las relaciones de los grupos Alveolata y Stramenopila, siendo este ultimo grupo de especial interés para nuestro grupo de investigación.</description> </item> <item> <title/> <link>http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0370-39082016000100014&lng=e&nrm=iso&tlng=e</link> <description>Mineralogy and microstructure are key variables defining the physical properties of a rock. Mudstones show inherently heterogeneous matrix pore-size distributions. They can show organic and inorganic pores and the transport mechanism through pores is different, and, therefore, it is necessary to describe their organic and inorganic porosity. This work uses Field Emission Gun Scanning Electron Microscopy to characterize the Galembo Member mudstones, Cretaceous La Luna Formation, Middle Magdalena Valley Basin, Colombia. There are several pore types in mudstones, including interparticle pores due to flocculation of clay minerals, organoporosity due to burial and thermal maturity of organic matter, intraparticle pores from organisms, intraparticle pores within mineral grains, and microchannels and microfractures, including dissolution, fillings and interlayer fractures. The existence of interconnected pores in such complex fracture-pore system provides effective pathways for primary gas migration and it also provides a storage space for the residual petroleum in mudstones, which is important for the primary migration and storage for mudstone gas resources. The pore connectivity is high and increases towards the top of the Galembo Member.<hr/>La mineralogía y la microestructura son variables claves que definen las propiedades físicas de una roca. Las lodolitas muestran distribuciones de tamaño de poro en la matriz inherentemente heterogéneas. Ellos pueden mostrar poros orgánicos e inorgánicos y el mecanismo de transporte a través de poros es diferente, y, por lo tanto, es necesario describir su porosidad orgánica e inorgánica. Este trabajo utiliza Microscopía Electrónica de Barrido de Fuente de Emisión de Campo para caracterizar las lodolitas del Miembro Galembo de la Formación La Luna del Cretácico, Cuenca del Valle Medio del Magdalena, Colombia. Hay varios tipos de poros en las lodolitas, incluyendo poros interpartículas debido a la floculación de minerales de arcilla, porosidad orgánica debida al enterramiento y madurez térmica de la materia orgánica, poros intrapartıculas de organismos, poros intrapartículas dentro de granos minerales, y microcanales y microfracturas, incluyendo disolución, relleno y fracturas entre capas. La existencia de poros interconectados en tal complejo sistema de poros-fracturas ofrece vías eficaces para la migración primaria de gas y también proporciona un espacio de almacenamiento para el petróleo residual en las lodolitas, lo cual es importante para la migración primaria y almacenamiento de los recursos de gas asociado a lodolitas. La conectividad entre poros es alta y aumenta hacia la parte superior del Miembro Galembo.</description> </item> </channel> </rss> <!--transformed by PHP 07:06:34 24-06-2024-->