Revista de la Facultad de Medicina

Alcohol abuse: a major invisible pandemic

Concordance analysis between noninvasive prenatal testing (NIPT) and prenatal karyotyping for detecting fetal aneuploidies

Abstract Introduction: Noninvasive prenatal testing (NIPT) is a screening test for fetal aneuploidy with higher specificity and sensibility rates compared to traditional biochemical prenatal screening. Objective: To evaluate concordance between NIPT and prenatal karyotyping testing for detecting fetal aneuploidies in pregnancies with high risk of such disorders. Materials and methods: Prospective pilot study conducted between September 2019 and December 2020 in 20 pregnant patients classified as high risk of aneuploidy based on ultrasound findings and treated in Bogotá and Medellín, Colombia. Each patient underwent a confirmatory invasive test (karyotyping) and a NIPT and an invasive confirmatory test (prenatal karyotyping). Concordance between both methods was determined using Cohen's kappa coefficient (significance level p<0.05), where values >0.7 were considered as a good level of agreement. Results: Aneuploidies were detected in 3 of the 20 pregnancies (15%) by means of invasive cytogenetic testing, namely, trisomy 21, trisomy 18, and monosomy X. NIPT detected the trisomy 21 and monosomy X cases but failed to detect trisomy 18. Regarding the concordance analysis between NIPT and prenatal karyotype testing in the detection of aneuploidies, Cohen's kappa coefficient was 0.77. As for their concordance for the detection of trisomy 21 and X monosomy, Cohen's kappa coefficient was 1.0, while it was 0 for the detection of trisomy 18. In addition, NIPT detected 67% of aneuploidies. Conclusion: The results of this study, the first of its kind to be conducted in Colombia, showed good concordance between NIPT and prenatal invasive testing (karyotyping) for detecting fetal aneuploidies. However, the results obtained stress the recommendation of using NIPT only as a screening test and not as a diagnostic test.

Resumen Introducción. La prueba prenatal no invasiva (NIPT, por su sigla en inglés) es una prueba de tamización de aneuploidías fetales con una mayor sensibilidad y especificidad que la tamización bioquímica prenatal tradicional. Objetivo. Evaluar la concordancia entre la NIPT y el cariotipo prenatal para la detección de aneuploidías fetales en embarazos de alto riesgo de dichas anomalías. Materiales y métodos. Estudio piloto prospectivo realizado entre septiembre de 2019 y diciembre de 2020 en 20 pacientes con gestaciones clasificadas como de alto riesgo para aneuploidías fetales con base en los hallazgos ecográficos y atendidas en Bogotá y Medellín, Colombia. A cada paciente se le realizó una NIPT y una prueba invasiva confirmatoria (cariotipo prenatal). La concordancia entre ambos métodos se determinó mediante el coeficiente kappa de Cohen (nivel de significancia p<0.05), donde valores >0.7 se consideraron como un buen nivel de concordancia. Resultados. En 3 de las 20 gestaciones (15%) se detectaron aneuploidías mediante estudio citogenético invasivo: trisomía 21, trisomía 18 y monosomía X. La NIPT detectó la trisomía 21 y la monosomía X, pero falló en detectar la trisomía 18. En lo que respecta a la concordancia entre la NIPT y el cariotipo prenatal para la detección de aneuploidías, el coeficiente de kappa de Cohen fue 0.77; en el caso de su concordancia para la detección de la trisomía 21 y la monosomía X el coeficiente de kappa de Cohen fue 1, mientras que para la detección de la trisomía 18 fue 0. Además, la NIPT detectó 67% de las aneuploidías. Conclusión. En el presente estudio, primero en realizarse en Colombia, se observó una buena concordancia entre la NIPT y la prueba invasiva (cariotipo prenatal) para la detección de aneuploidías. Sin embargo, los resultados aquí reportados enfatizan la recomendación de utilizar la NIPT como prueba de tamización y no como prueba diagnóstica.

Factors associated with mortality in COVID-19 patients admitted to an intensive care unit in Medellín, Colombia. March-December 2020

Abstract Introduction: COVID-19 is mild in 80% of cases; however, it progresses to severe disease in 5% of patients, thus requiring intensive care unit (ICU) admission. Objective: To identify demographic, clinical, and treatment-related factors associated with mortality in patients with COVID-19 treated at the ICU of a quaternary care hospital in Medellín, Colombia. Materials and methods: Retrospective cohort study. The medical records of 182 patients admitted to the ICU between March and December 2020 due to COVID-19 were analyzed. Bivariate analyses (chi-square, Fisher's exact, unpaired Student's t test, or Mann-Whitney U test) were performed to evaluate the association between demographic characteristics, presence of coexisting diseases, laboratory results, therapeutic interventions, ventilatory and hemodynamic support requirement, and mortality. In addition, a multivariate analysis was performed, in which simple and multiple binary logistic regressions were used, calculating crude and adjusted relative risks (RR). A significance level of p<0.05 was considered. Results: Mortality was reported in 47.80% of patients. In the multivariate analysis model, the following factors were protective factors: age <60 years (aRR: 0.154, 95%CI: 0.059-0.401; p=0.000), use of vasopressors (aRR: 0.082, 95%CI: 0.021-0.319; p<0.001), and use of renal replacement therapy (aRR: 0.205 95%CI 0.059 - 0.716; p=0.013). On the other hand, not performing tracheostomy was an independent protective factor for mortality (aRR: 14.959, 95%CI: 4.865-45.998; p<0.001). A lower platelet count during the ICU stay had a neutral effect, although it was a significantly associated quantitative variable (aRR: 0.999, 95%CI: 0.990-0.999; p=0.003). Conclusions: In the present study, age <60 years, the use of vasopressors, and renal replacement therapy were protective factors, while not performing tracheostomy was a risk factor for mortality. Furthermore, a lower platelet count during ICU stay was a significantly associated quantitative variable.

Resumen Introducción. La COVID-19 se manifiesta en el 80% de los casos de forma leve; sin embargo, en el 5% progresa a enfermedad severa con necesidad de manejo en unidad de cuidados intensivos (UCI). Objetivo. Identificar los factores demográficos, clínicos y de tratamiento asociados a la mortalidad en pacientes con COVID-19 atendidos en la UCI de un hospital de cuarto nivel de atención de Medellín, Colombia. Materiales y métodos. Estudio de cohorte retrospectivo. Se analizaron las historias clínicas de 182 pacientes admitidos a UCI por COVID-19 entre marzo y diciembre de 2020. Se realizaron análisis bivariados (pruebas de chi-cuadrado, exacta de Fisher, t-Student no pareada o U de Mann-Whitney) para evaluar la asociación entre, por un lado, características demográficas, presencia de enfermedades coexistentes, resultados de laboratorio, intervenciones terapéuticas, requerimiento de soporte ventilatorio y hemodinámico, y, por otro, mortalidad. Además, se realizó un análisis multivariado en el que se construyeron regresiones logísticas binarias simples y múltiples, calculando riesgos relativos (RR) crudos y ajustados. Se consideró un nivel de significancia de p<0.05. Resultados. La mortalidad fue de 47.80%. En el análisis multivariado, los siguientes factores se comportaron como protectores para mortalidad: edad <60 años (RRa: 0.154, IC95%: 0.059-0.401; p=0.000), uso de vasopresores (RRa 0.082, IC95%: 0.021-0.319; p<0.001) y uso de terapia de remplazo renal (RRa: 0.205, IC95%: 0.059-0.716; p=0.013). La realización de traqueostomía se comportó como un factor protector independiente para mortalidad (RRa: 0.073, IC95%: 0.012-0.827; p<0.001). El conteo más bajo de plaquetas registrado durante la estancia en UCI tuvo un efecto neutro, aunque fue una variable cuantitativa significativamente asociada (RRa: 0.999, IC95%: 0.990-0.999; p=0.003). Conclusiones. En el presente estudio, la edad <60 años y el uso de vasopresores y de terapia de remplazo renal se comportaron como factores protectores, mientras que la no realización de traqueostomía se comportó como factor de riesgo para mortalidad. Además, el conteo más bajo de plaquetas registrado durante la estancia en UCI fue una variable cuantitativa significativamente asociada.

Clinical factors associated with extubation failure and post-extubation laryngeal stridor in adult patients on invasive mechanical ventilation

Abstract Introduction: Orotracheal intubation is a procedure that implies risks such as extubation failure and laryngeal stridor, which increase the risk of morbidity. Objective: To identify factors associated with early extubation failure (≤24 hours) and the development of post-extubation laryngeal stridor in adult patients on invasive mechanical ventilation (IMV). Materials and methods: Case-control study conducted in the intensive care unit (ICU) of a quaternary care hospital in Bogotá, Colombia, between April 2019 and February 2020, in which information was collected prospectively. A total of 180 patients with IMV ≥24 hours and at least >1 extubation attempt were included: 30 cases defined as patients with early extubation failure (≤24 hours to extubation), and 150 controls. Differences between cases and controls regarding the variables considered were determined using the Student's t test and the Chi-squared or Fisher's exact tests. In addition, a multivariate analysis (unconditional logistic regression model) was performed to establish the factors associated with extubation failure and post-extubation laryngeal stridor, calculating the odds ratio (OR) and the respective 95% confidence intervals (95%CI). A significance level of p<0.05 was considered. Results: Early extubation failure and laryngeal stridor had a prevalence of 16.66% (n=30) and 3.89% (n=7), respectively. In the multivariate analysis, having a history of intubation (OR=4.27, 95%CI: 1.44-12.66), the presence of active cancer (OR=2.92, 95%CI: 1.08-7.90), and being diagnosed with pneumonia (OR=2.84, 95%CI: 1.15-6.99) were significantly associated with extubation failure, while the duration of IMV (OR=1.53, 95%CI: 1.18-1.99) and history of intubation (OR=37.99, 95%CI: 2.22-650.8) were significantly associated with post-extubation laryngeal stridor. Conclusions: Based on the results reported here, it is suggested to consider factors such as history of intubation, comorbidity with cancer, and diagnosis of pneumonia in the stratification of critically ill patients to increase the likelihood of successful extubation.

Resumen Introducción. La intubación orotraqueal es un procedimiento que conlleva riesgos como la extubación fallida y el estridor laríngeo, los cuales aumentan el riesgo de morbilidad. Objetivo. Identificar los factores asociados a extubación fallida temprana (≤24 horas) y al desarrollo de estridor laríngeo post-extubación en pacientes adultos con ventilación mecánica invasiva (VMI). Materiales y métodos. Estudio de casos y controles con recolección prospectiva de información realizado en la unidad de cuidados intensivos (UCI) de un hospital de IV nivel de Bogotá, Colombia, entre abril de 2019 y febrero de 2020. Se incluyeron 180 pacientes con VMI ≥24 horas y al menos 1 intento de extubación: 30 casos definidos como pacientes con extubación fallida temprana (≤24 horas a la extubación) y 150 controles. Las diferencias en las variables consideradas entre casos y controles se determinaron mediante las pruebas t de Student y Chi-cuadrado o exacta de Fisher. Además, se realizó un análisis multivariado (modelo de regresión logística no condicional) para determinar los factores asociados con extubación fallida y estridor laríngeo post-extubación, calculando los Odds ratio (OR) con sus respectivos intervalos de confianza al 95% (IC95%). Se consideró un nivel de significancia de p<0.05. Resultados. La extubación fallida temprana y el estridor laríngeo tuvieron una prevalencia de 16.66% (n=30) y 3.89% (n=7), respectivamente. En el análisis multivariado, el antecedente de intubación (OR=4.27, IC95%: 1.44-12.66), la presencia de cáncer activo (OR=2.92, IC95%: 1.08-7.90) y ser diagnosticado con neumonía (OR=2.84, IC95%: 1.15-6.99) se asociaron significativamente con extubación fallida, mientras que la duración de la VMI (OR=1.53, IC95%: 1.18-1.99) y el antecedente de intubación (OR=37.99, IC95%: 2.22-650.8), con estridor laríngeo post-extubación. Conclusiones. Con base en los resultados aquí obtenidos, se sugiere considerar factores como antecedente de intubación, comorbilidad con cáncer y diagnóstico de neumonía en la estratificación de los pacientes críticamente enfermos para aumentar la probabilidad de una extubación exitosa.

Clinical, imaging, and laboratory characteristics of patients with COVID-19 according to ICU admission requirement in Cali, Colombia

Abstract Introduction: At present, few studies conducted in Latin America have addressed the demographic, clinical, and laboratory characteristics of patients with COVID-19 and intensive care unit (ICU) admission requirement. Objective: To compare the sociodemographic, clinical, imaging, and laboratory characteristics of patients diagnosed with COVID -19 and treated in the emergency department of a hospital in Cali, Colombia, based on ICU admission requirement. Materials and methods: Retrospective and descriptive single cohort study conducted in 49 adults with COVID-19 treated in the emergency department of a quaternary care hospital in Cali (Colombia) between March and April 2020. Patients were divided into two groups: ICU admission requirement (n=24) and non-ICU admission requirement (n=25). Bivariate analyses were performed to determine differences between groups (chi-square, Fisher's exact, Student's t, and Mann-Whitney U tests), with a significance level of p<0.05. Results: Participants' mean age was 53 years (SD=13) and 29 patients were men. Significant differences were found between groups in the following variables: mean age (ICU x̅ =58 vs. Non-ICU x̅ =49; p=0.020), presence of diabetes (8 vs. 1; p=0.010); presence of respiratory distress (20 vs. 11; p=0.007) ; unilateral or bilateral presence of areas of consolidation (12 vs. 3; p=0.005); median leukocyte (Med=7 570/mm3 vs. Med=5 130/mm3; p=0.0013), neutrophil (Med=5 980/mm3 vs. Med=3 450/mm3; p=0.0001) and lymphocyte (Med=865/mm3 vs. Med=1 400/mm3; p<0.0001) count; median C-reactive protein (Med=141,25mg/L vs. Med=27.95mg/L; p<0.001), ferritin (Med=1038ng/L vs. Med=542.5ng/L; p=0.0073) and lactate dehydrogenase (Med=391U/L vs. Med=248.5U/L, p=0.0014) levels. Finally, 15 patients required invasive mechanical ventilation, 2 presented with extubation failure, and 5 died. Conclusions. Significant differences were observed in the values of several inflammatory markers, cellular damage and complete blood count parameters between patients who required admission to the ICU and those who did not, so these variables could be used to develop tools that contribute to establishing the prognosis of this disease.

Resumen Introducción. Actualmente hay pocos estudios en Latinoamérica sobre las características demográficas, clínicas y de laboratorio de pacientes con COVID-19 y con requerimiento de ingreso a la unidad de cuidados intensivos (UCI). Objetivo. Comparar las características sociodemográficas, clínicas, imagenológicas y de laboratorio de pacientes diagnosticados con COVID-19 atendidos en el servicio de urgencias de una clínica en Cali, Colombia, según requerimiento de ingreso a UCI. Materiales y métodos. Estudio retrospectivo descriptivo de cohorte única realizado en 49 adultos con COVID-19 atendidos en el servicio de urgencias de un hospital de cuarto nivel de atención de Cali entre marzo y abril de 2020, los cuales se dividieron en dos grupos: requerimiento de ingreso a UCI (n=24) y no requerimiento de ingreso a UCI (n=25). Se realizaron análisis bivariados para determinar las diferencias entre ambos grupos (pruebas de chi-cuadrado, exacta de Fisher, t de Student y U de Mann-Whitney), con un nivel de significancia de p<0.05. Resultados. La edad promedio fue 53 años (DE=13) y 29 pacientes fueron hombres. Se encontraron diferencias significativas entre ambos grupos en las siguientes variables: edad promedio (UCI x̅ =58 vs. No UCI x̅=49; p=0.020); presencia de diabetes (8 vs. 1; p=0.010); presencia de dificultad respiratoria (20 vs. 11; p=0.007); presencia uni o bilateral de áreas de consolidación (12 vs. 3; p=0.005), y mediana del conteo de leucocitos (Med=7 570/mm3 vs. Med=5 130/mm3; p=0.0013), neutrófilos (Med=5 980/mm3 vs. Med=3 450/mm3; p=0.0001), linfocitos (Med=865/mm3 vs. Med=1 400/mm3; p<0.0001), proteína C reactiva (Med=141.25 mg/L vs. Med=27.95 mg/L; p<0.001), ferritina (Med=1038 ng/L vs. Med=542.5 ng/L; p=0.0073) y lactato-deshidroge-nasa (Med=391 U/L vs. Med=248.5 U/L; p=0.0014). Finalmente, 15 pacientes requirieron ventilación mecánica invasiva, 2 presentaron extubación fallida y 5 fallecieron. Conclusiones. Se observaron diferencias significativas en los valores de varios marcadores inflamatorios, daño celular y parámetros del hemograma entre los pacientes que requirieron admisión a la UCI y los que no, por lo que estas variables podrían emplearse para desarrollar herramientas que contribuyan a establecer el pronóstico de esta enfermedad.

Factors associated with the intention to reduce alcohol consumption among people who drink at risky levels in a university hospital in Bogotá D.C., Colombia

Abstract Introduction: Interventions to reduce risky alcohol use are a priority in all clinical settings, including the hospital setting. Objectives: To describe the sociodemographic, family, and clinical characteristics of people who drink at risky levels in a university hospital, and to evaluate the association between these factors and their intention to reduce alcohol use, measured according to the stage of behavioral change they are at, which is referred to in this study as "intention to change". Materials and methods: Descriptive cross-sectional study conducted in 176 patients between 19 and 64 years-old classified as risky drinkers (according to AUDIT score) who underwent a surgical or a diagnostic procedure in a quaternary care hospital in Bogotá, Colombia, between April 2018 and March 2020. Bivariate (chi-square) and multivariate (ordinal logistic regression) analyses were performed to evaluate associations between independent variables (sociodemographic, family, clinical, and alcohol use-related characteristics) and intention to change. Adjusted odds ratios (aOR) were calculated, and a significance level of p<0.05 was considered. Results: The prevalence of risky alcohol use was 4.88% (95%CI: 4.17-5.58) (176/3 609). Most participants were male (82.95%), over 30 years old (71.02%), and in the "preparation" stage of behavior change (63.63%). In the multivariate analysis, being older than 30 years was associated with a greater intention to change (31-45 years: aOR=3.68; 95%CI:1.56-9.06; 46-64 years: aOR=2.63; 95%CI:1.20-5.86), while having a high socioeconomic level was associated with a lower intention to change (aOR=0.06; 95%CI:0.01-0.50). Conclusions. A greater intention to reduce alcohol use was observed in individuals over 30 years of age, as well as in those with a greater perception of the benefits of such reduction, those with a better perception of self-efficacy, and patients with previous attempts to reduce their alcohol use. In contrast, having a high socioeconomic level was associated with a lower intention to change.

Resumen Introducción. Las intervenciones para reducir el consumo riesgoso de alcohol son una prioridad en todos los escenarios clínicos, incluido el hospitalario. Objetivos. Describir las características sociodemográficas, familiares y clínicas en personas con consumo riesgoso de alcohol en un hospital universitario y evaluar la asociación entre estos factores y la intención de disminuir el consumo, medida según la etapa de cambio comportamental y denominada en este estudio como "intención de cambio". Materiales y métodos. Estudio descriptivo transversal realizado en 176 pacientes entre 19 y 64 años con consumo riesgoso de alcohol (según puntaje AUDIT) sometidos a una intervención quirúrgica o procedimiento diagnóstico entre abril de 2018 y marzo de 2020 en un hospital de cuarto nivel de Bogotá, Colombia. Se realizó un análisis bivariado (Chi-cuadrado) y uno multivariado (regresión logística ordinal) para evaluar las asociaciones entre las variables independientes (características sociodemográficas, familiares, clínicas y relacionadas con el consumo de alcohol) y la intención de cambio. Se calcularon Odds Ratio ajustados (ORa) y se consideró un nivel de significancia de p<0.05 Resultados. La prevalencia de consumo riesgoso de alcohol fue de 4.88% (IC95%: 4.17-5.58) (176/3 609). La mayoría de participantes eran hombres (82.95%), tenían más de 30 años (71.02%) y estaban en la etapa "preparación" de cambio comportamental (63.63%). En el análisis multivariado, ser mayor de 30 años se asoció con mayor intención de cambio (31-45 años: ORa=3.68, IC95%:1.56-9.06; 46-64 años: ORa=2.63; IC95%: 1.20-5.86) y, por el contrario, ser de un estrato socioeconómico alto se asoció con menor intención (ORa=0.06; IC95%: 0.01-0.50). Conclusiones. Se observó una mayor intención de disminuir el consumo de alcohol en los participantes mayores de 30 años, aquellos con mayor percepción de los beneficios de dicha disminución, aquellos con mayor percepción de autoeficacia, y en los pacientes con intentos previos de disminución; en contraposición, el estrato socioeconómico alto se asoció con menor intención de cambio.

Prevalence of extended-spectrum ß-lactamase-producing Escherichia coll and Klebsiella pneumoniae isolates in outpatients with urinary tract infection in a Cuban municipality

Abstract Introduction: Community- acquired urinary tract infections (CA-UTI) caused by extended-spectrum ß-lactamases (ESBL) -producing Enterobacteriaceae are a growing phenomenon worldwide. Objective: To determine the prevalence of ESBL-producing Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae isolates obtained from urine samples of outpatients with CA-UTI in a Cuban municipality, as well as the antibiotic resistance profiles associated with the ESBL phenotype. Materials and methods: Retrospective descriptive study. A total of 304 isolates of E. coli and 34 of K. pneumoniae obtained from urine cultures of patients with CA-UTI treated between January 1, 2019, and December 31, 2020, at the Hospital Clínico-Quirúrgico Docente Aleida Fernández Chardiet, in the municipality of Güines, Mayabeque province, Cuba, were analyzed. A bivariate analysis (chi-square test) was performed to determine differences in antibiotic resistance rates between ESBL-producing and non-producing bacteria. Results: 16.77% (51/304) and 17.64% (6/34) of E. coli and K. pneumoniae isolates were classified as ESBL-producing bacteria. In the case of ESBL-producing E. coli isolates, ESBL+ciprofloxacin was the most frequent antibiotic resistance pattern (22/51; 43.13%), followed by ESBL+ciprofloxacin and amikacin (14/51; 27.45%). Moreover, 41.17% (21/51) were multidrug-resistant. In the case of ESBL-producing K. pneumoniae, ESBL+ciprofloxacin, amikacin and nitrofurantoin was the predominant antimicrobial resistance pattern (2/6; 33.33%), and 50 % (3/6) were multidrug resistant. Conclusions: The results reported confirm the presence of ESLB-producing E. coli and K. pneumoniae, with a high prevalence of multidrug resistance in patients with CA-UTI in the municipality of Güines, Cuba.

Resumen Introducción. Las infecciones del tracto urinario (ITU) adquiridas en la comunidad y causadas por enterobacterias productoras de ß-lactamasas de espectro extendido (BLEE) son un fenómeno creciente a nivel mundial. Objetivo. Determinar en un municipio de Cuba la prevalencia de aislamientos de Escherichia coli y Klebsiella pneumoniae productoras de BLEE obtenidos de muestras de orina de pacientes ambulatorios con ITU adquirida en la comunidad, así como los perfiles de resistencia a antibióticos asociados al fenotipo BLEE. Materiales y métodos. Estudio descriptivo retrospectivo. Se analizaron 304 aislamientos de E. coli y 34 de K. pneumoniae obtenidos de urocultivos de pacientes con ITU adquirida en la comunidad atendidos entre enero 1 de 2019 y diciembre 31 de 2020 en el Hospital Clínico-Quirúrgico Docente Aleida Fernández Chardiet del municipio de Güines, provincia Mayabeque, Cuba. Se realizó un análisis bivariado (prueba chi-cuadra-do) para determinar diferencias en las tasas de resistencia antibiótica entre las bacterias productoras de BLEE y las no productoras. Resultados. El 16.77% (51/304) y el 17.64 % (6/34) de los aislamientos de E. coli y K. pneumoniae se clasificaron como bacterias productoras de BLEE, respectivamente. En el caso de los aislados de E. coli productoras de BLEE, BLEE+ciprofloxacina fue el patrón de resistencia más frecuente (22/51; 43.13%), seguido por BLEE+-ciprofloxacino y amikacina (14/51; 27.45%). Además, 41.17% (21/51) fueron multirresistentes. En el caso de K. pneumoniae productoras de BLEE, predominó el patrón de resistencia BLEE+ciprofloxacino, amikacina y nitrofurantoina (2/6; 33.33%), y 50% (3/6) fueron multirresistentes. Conclusiones. Los resultados confirman la presencia de E. coli y K. pneumoniae productoras de BLEE, con una alta prevalencia de multirresistencia en pacientes con ITU adquirida en la comunidad en el municipio de Güines.

Altitude and its correlation with COVID-19 incidence, case fatality, and mortality rates in Peru: 2020-2021

Abstract Introduction: Incidence, case fatality, and mortality rates of COVID-19 are not the same in the different regions of Peru, a situation that may be related to factors that have been little studied, such as altitude. Likewise, environmental characteristics typical of altitude (atmospheric pressure, relative humidity, etc.) could explain the dynamics of COVID-19 transmission. Objective: To determine the correlation between altitude and COVID-19 incidence, case fatality, and mortality rates in Peru. Materials and methods: Multiple-group ecological study. A secondary analysis of official COVID-19 data from 1 874 districts of Peru reported until February 2021 was performed. The variable altitude was categorized as low (0-999 m.a.s.l.), medium (1 000-2 499 m.a.s.l.), and high (>2 500 m.a.s.l.). Cumulative incidence, case fatality, and mortality rates of COVID-19 were calculated as the number of cases among the total population of each district multiplied by 10 000, the number of deaths among the number of cases multiplied by 100, and the number of deaths among the total population of each district multiplied by 100 000, respectively. Bivariate (Spearman's rank correlation and Kruskal-Wallis test) and multivariate analyses (multiple linear regression) were used for data analysis, with a confidence level of 95%. Results: An inverse correlation between cumulative incidence rate (1 823 districts) and altitude (Rho: -0.355; p<0.001) was observed, i.e., it decreased at a higher altitude. In turn, there was a direct correlation between case fatality rate (1 526 districts) and altitude (Rho: 0.131; p<0.001), i.e., it increased at a higher altitude. Although mortality rate showed an inverse correlation with altitude (Rho: -0.310; p<0.000), it varied heterogeneously depending on altitude levels. In the multivariate analysis, after adjusting the model for poverty and population density, altitude was associated with incidence (p<0.001) and case fatality rates (p=0.009), but not with mortality rate (p=0.179). Conclusion: During the study period, an inverse correlation between altitude and COVID-19 cumulative incidence rate, as well as a direct correlation between altitude and case fatality rate, were observed in Peru.

Resumen Introducción. La incidencia, la letalidad y la mortalidad por COVID-19 no han sido iguales en las regiones del Perú, situación que puede estar relacionada con factores pocos estudiados como la altitud; asimismo, características ambientales propias de la altura (presión atmosférica, humedad relativa, etc.) podrían explicar la dinámica de transmisión de la COVID-19. Objetivo. Determinar la relación entre altitud e incidencia, letalidad y mortalidad por COVID-19 en Perú. Materiales y métodos. Estudio ecológico de grupos múltiples. Se realizó un análisis secundario de datos oficiales sobre COVID-19 de 1 874 distritos del Perú reportados hasta febrero de 2021. La variable altitud se categorizó como baja (0-999m s.n.m.), media (1 000-2 499m s.n.m.) y elevada (>2 500m s.n.m.). Las tasas de incidencia acumulada, letalidad y mortalidad por COVID-19 se calcularon como el número de casos entre la población total de cada distrito multiplicado por 10 000, el número de defunciones entre el número de casos multiplicado por 100 y el número de defunciones entre la población total de cada distrito multiplicado por 100 000, respectivamente. Para el análisis de los datos se empleó estadística bivariada (coeficiente de correlación de Spearman y prueba de Kruskal-Wallis) y multivariada (regresión lineal múltiple), con un nivel de confianza del 95%. Resultados. Se observó una correlación inversa entre la tasa de incidencia acumulada (1 823 distritos) y la altitud (Rho: -0.355; p<0.001), es decir, se redujo a mayor altitud, y una correlación directa entre la tasa de letalidad (1526 distritos) y la altitud (Rho: 0.131; p<0.001), es decir, aumentó a mayor altitud. Aunque la tasa de mortalidad mostró una correlación inversa con la altitud (Rho: -0.310; p<0.000), esta varía heterogéneamente según niveles altitudinales. En el análisis multivariado, luego de ajustar el modelo por pobreza y densidad poblacional, la altitud se asoció con las tasas de incidencia (p<0.001) y letalidad (p=0.009), pero no con la de mortalidad (p=0.179). Conclusión. Se observó una correlación inversa entre la altitud y la tasa de incidencia de COVID-19 y una correlación directa entre la altitud y la tasa de letalidad en Perú durante el periodo de estudio. No se encontró una correlación entre altitud y tasa de mortalidad.

Psychometric evaluation of the "Sleep Apnea Quality of Life Index" (SAQLI) questionnaire for the assessment of quality of life in people with obstructive sleep apnea syndrome in Colombia

Abstract Introduction: The Sleep Apnea Quality of Life Index (SAQLI) is the most comprehensive specific instrument for assessing quality of life in patients with obstructive sleep apnea (OSA). However, there is no cross-cultural adaptation, nor a psychometric validation, of this questionnaire in Colombia, so its performance is unknown. Objective: To perform a psychometric evaluation of the Spanish version of the SAQLI questionnaire culturally adapted to the Colombian context. Materials and methods: Scale validation study conducted in 173 patients who attended the Clínica Universidad de la Sabana (Chía, Colombia) or the Fundación Neumológica Colombiana (Bogotá, Colombia) between June 2017 and April 2019 to undergo a polysomnography (PSG). The culturally adapted version of the SAQLI questionnaire was administered 3 times: before the PSG, 15 days later, and 3 months after initiating continuous positive airway pressure (CPAP) treatment (the latter in 22 patients). Internal consistency, reliability, and sensitivity to change were assessed using Cronbach's alpha coefficient (α), intraclass correlation coefficient (ICC), and paired samples t-test, respectively. Results: Differences were observed in the scores obtained in the 4 domains evaluated (A-D) before and after starting treatment, being statistically significant in A (4.92 vs. 5.70; p=0.038) and C (4.61 vs. 5.52; p=0.003). In addition, adequate internal consistency and reliability were found in domains A, B, and C (α=0.884-0.935 and ICC=0.793-0.826, respectively). Conclusion: The Spanish version of the SAQLI questionnaire adapted to the Colombian cultural and linguistic context is adequate for the objective assessment of quality of life in patients with OSA and is sensitive to change after initiating CPAP treatment.

Resumen Introducción. El cuestionario Sleep Apnea Quality of Life Index (SAQLI) es el instrumento específico más completo para evaluar la calidad de vida en pacientes con apnea obstructiva del sueño (AOS); sin embargo, no existe una adaptación cultural en Colombia, ni su validación psicométrica y, por tanto, se desconoce su rendimiento. Objetivo. Realizar la evaluación psicométrica de la versión en español del cuestionario SAQLI adaptada culturalmente al contexto colombiano. Materiales y métodos. Estudio de validación de escala realizado en 173 pacientes que, entre junio de 2017 y abril de 2019, asistieron a la Clínica Universidad de la Sabana (Chía, Colombia) o a la Fundación Neumológica Colombiana (Bogotá, Colombia) para realizarse una polisomnografía (PSG). La versión del cuestionario SAQLI adaptada culturalmente se administró 3 veces: antes de la PSG; 15 días después, y 3 meses después de iniciar tratamiento con presión positiva continua de las vías respiratorias (CPAP), esta última en 22 pacientes. La consistencia interna, la fiabilidad y la sensibilidad al cambio fueron evaluadas mediante el coeficiente alfa de Cronbach (α), el coeficiente de correlación intraclase (CCI) y la prueba T-Student para muestras pareadas, respectivamente. Resultados. Se observaron diferencias en las puntuaciones obtenidas en los 4 dominios evaluados (A-D) antes y después de iniciar el tratamiento, siendo estadísticamente significativas en A (4.92 vs. 5.70; p=0.038) y C (4.61 vs. 5.52; p=0.003). Además, se observó una adecuada consistencia interna y fiabilidad en los dominios A, B y C (α =0.884-0.935 y CCI=0.793-0.826, respectivamente). Conclusión. La versión en español del cuestionario SAQLI adaptada al contexto cultural y lingüístico colombiano es adecuada para la evaluación objetiva de la calidad de vida en pacientes con AOS y es sensible al cambio luego de iniciar el tratamiento con CPAP.

Predictive factors for perforated appendicitis in a pediatric population treated at a referral hospital in Bogotá D.C., Colombia

Abstract Introduction: Acute appendicitis is the leading cause of abdominal surgical emergencies in pediatrics. Between 30% and 75% of cases progress to perforated appendicitis; however, timely diagnosis before perforation occurs remains a challenge. Objective: To identify predictive factors for perforated appendicitis in a pediatric population (<18 years) at the time of admission to the emergency department. Materials and methods: Prospective cohort study conducted in 193 patients (perforated appendicitis=98; non-perforated appendicitis=95) admitted to the emergency department of a pediatric referral hospital in Bogotá D.C., or referred to such hospital, who underwent appendectomy between November 1 and December 31, 2013. Bivariate analyses were performed (Student's t-tests, Mann-Whitney U, chi-square or Fisher's exact), calculating the odds ratios (OR) with their respective 95%CI. In the multivariate analysis (logistic regression), the stepwise regression method was used to select variables according to their statistical significance, and regression models were performed. The explanatory power of the models was verified by calculating the areas under the ROC curve. Results: The mean age of the participants was 9.8 years, and the prevalence of perforated appendicitis was 50.78%. The following predictive factors for perforated appendicitis were identified in the multivariate analysis: presence of emesis on admission to the emergency department (OR=4.28, 95%CI: 1.63-11.21), presence of tachycardia on physical examination (OR=3.38, 95%CI:1.69-6.59), temperature >38.3°C on physical examination (OR=3.36, 95%CI: 1.29-8.70), and duration of symptoms until surgery (OR=1.95, 95%CI: 1.37-2.77). Conclusions: In the present study, duration of symptoms until surgery, presence of emesis during questioning on admission to the emergency department, and presence of tachycardia and fever (>38.3°) on physical examination behaved as predictive factors for acute perforated appendicitis in pediatric patients.

Resumen Introducción. La apendicitis aguda es la principal causa de urgencia quirúrgica abdominal en población pediátrica. Entre 30% y 75% de los casos progresan a apendicitis perforada; sin embargo, el diagnóstico oportuno de esta condición antes de que ocurra la perforación continúa siendo un reto. Objetivo. Identificar los factores predictores de apendicitis perforada en población pediátrica (<18 años) al momento de ingreso al servicio de urgencias. Materiales y métodos. Estudio de cohortes prospectivo realizado en 193 pacientes (apendicitis perforada=98; no perforada=95) admitidos al servicio de urgencias de un hospital pediátrico de referencia en Bogotá D.C., Colombia, o remitidos a dicho hospital y a los que se les realizó apendicectomía entre noviembre 1 y diciembre 31 de 2013. Se realizaron análisis bivariados (pruebas t-Student, U de Mann-Whitney, chi cuadrado o exacta de Fisher), calculando Odds ratio (OR) con sus respectivos IC95%. En el análisis multivariado (regresión logística) se utilizó el método de regresión paso a paso para seleccionar las variables según su significancia estadística y se realizaron modelos de regresión. La capacidad de explicación de los modelos se verificó con el cálculo de áreas bajo la curva ROC. Resultados. La edad promedio de los participantes fue 9.8 años y la prevalencia de apendicitis perforada fue 50.78%. En el análisis multivariado se identificaron los siguientes factores predictores para apendicitis perforada: presencia de vómito en el interrogatorio al ingreso a urgencias (OR=4.28, IC95%: 1.63-11.21), presencia de taquicardia en el examen físico (OR=3.38, IC95: 1.69-6.59), temperatura >38.3°C en el examen físico (OR=3.36, IC95%: 1.29-8.70) y la duración de los síntomas hasta la cirugía (OR=1.95, IC95%: 1.37-2.77). Conclusiones. En este estudio, la duración de los síntomas hasta la cirugía, la presencia de vómito en el interrogatorio al ingreso a urgencias y la presencia de taquicardia y de fiebre (>38.3°C) al examen físico se comportaron como factores predictores de apendicitis aguda perforada en pacientes pediátricos.

Effectiveness and safety of probiotics as adjuvants in the eradication of Helicobacter pylori. Systematic review and meta-analysis

Abstract Introduction: Adding probiotics to triple and quadruple therapies has been proposed to improve their effectiveness in the eradication of Helicobacter pylori, but there is controversy about their usefulness. Objective: To assess the effectiveness and safety of probiotics as adjuvants in triple or quadruple therapies for H. pylori eradication in adults. Materials and methods: Systematic review and meta-analysis. Randomized clinical trials (RCTs) assessing the effectiveness and safety of probiotics as adjuvant therapy in combination with triple and quadruple therapies for the eradication of H. pylori in adults and published in English or Spanish between January 2010 and May 2020 were searched in the Embase, Ovid Medline, Cochrane Library, and LILACS databases. Regarding the meta-analysis, a fixed-effects model was used to calculate the pooled measure (OR and RR) of the effectiveness and safety of using adjuvant probiotics in triple and quadruple therapy. Results: Twelve RCTs were included (1 091 patients in total): 9 assessed triple therapy, 2 assessed quadruple therapy, and 1 assessed both triple and quadruple therapy. In the case of triple therapy, the use of adjuvant probiotics was more effective than placebo: 79.4% vs. 71.1%, (OR=1.42; 95%CI: 1.05-2.09), but in the case of quadruple therapy, their use did not increase effectiveness. The most widely used probiotic was Lactobacillus reuteri, with an eradication rate of 77.9% (95%CI: 70.5-84.19) versus 66.8% (95%CI: 58.8-74.2) for placebo. Probiotics decreased the occurrence of adverse effects in both triple therapy (OR=0.50; 95%CI: 0.28-0.90) and quadruple therapy (OR=0.26; 95%CI: 0.09-0.74). Conclusions. Adjuvant probiotics improve the effectiveness of triple therapy to eradicate H. Pylori by 8.5%, but the final effectiveness is <90%. Furthermore, their use does not increase the effectiveness of quadruple therapy. However, the use of these microorganisms reduces the adverse effects of these therapies.

Resumen Introducción. Se ha propuesto agregar probióticos a las terapias triples y cuádruples para mejorar su efectividad en la erradicación de Helicobacter pylori, pero existe controversia sobre su utilidad. Objetivo. Evaluar la efectividad y seguridad del uso adyuvante de probióticos en la terapia triple o cuádruple para la erradicación de H. pylori en adultos. Materiales y métodos. Revisión sistemática y metaanálisis. Se realizó una búsqueda en Embase, Ovid Medline, Cochrane Library y LILACS de ensayos clínicos aleatorizados (ECA) publicados en inglés o español entre enero de 2010 y mayo de 2020 que evalúan la efectividad y seguridad de usar probióticos como terapia coadyuvante en combinación con la terapia triple o cuádruple en la erradicación de H. pylori en adultos. En el metaanálisis se utilizó un modelo de efectos fijos para calcular la medida combinada (OR y RR) de efectividad y seguridad de los probióticos coadyuvantes en terapia triple y cuádruple. Resultados: Se incluyeron 12 ECA (1 091 pacientes en total): 9 evaluaron terapia triple; 2, terapia cuádruple, y I, terapia triple y cuádruple. En la terapia triple el uso coadyuvante de probióticos fue más efectivo que el uso de placebo: 79.4% vs. 71.1% (OR=1.42; IC95%: 1.05-2.09), pero en la terapia cuádruple, su uso no aumentó la efectividad. El probiótico más utilizado fue Lactobacillus reuteri, con una tasa de curación de 77.9% (IC95%: 70.5-84.19) versus 66.8% (IC95%: 58.8-74.2) del placebo. Los probióticos disminuyeron la ocurrencia de efectos adversos tanto en terapia triple (OR=0.50; IC95%: 0.28-0.90) como en cuádruple (OR=0.26; IC95%: 0.09-0.74). Conclusiones. El uso coadyuvante de probióticos mejora la efectividad de la terapia triple para erradicar H. Pylori en un 8.5%, pero la efectividad final es <90%. Además, su uso no aumenta la efectividad de la terapia cuádruple. No obstante, el uso de estos microorganismos disminuye los efectos adversos de estas terapias.

Tracheal laceration following intubation with a C-MAC^® videolaryngoscope. Case Report

Abstract Introduction: Post-intubation tracheal laceration is a complication with a low incidence, but due to its clinical relevance and high mortality risk, it must be suspected in cases of endotracheal intubation. Case presentation: A 74-year-old woman with a history of high blood pressure and mitral and tricuspid insufficiency underwent a laparoscopic cholecystectomy under general anesthesia in a tertiary care hospital in Zaragoza, Spain, a procedure in which a C-MAC® videolaryngoscope was used to perform the intubation. The patient, 20 minutes after extubation, presented hemoptysis, dyspnea and a decrease in oxygen saturation, so a fibrobronchoscopy was performed and a 1.5 cm bleeding tracheal laceration was observed. Intravenous antibiotic treatment was started, and chest X-ray and computed axial tomography ruled out serious complications such as pneumothorax, pneumomediastinum, or tracheal rupture. During the observation period, the patient had a normal blood oxygen level and remained hemodynamically stable. She was discharged after 72 hours. Conclusions: Since tracheal lacerations are associated with high mortality rates, a high index of clinical suspicion is required, particularly in patients with risk factors for this type of injury in difficult intubation cases, in order to avoid the delay of timely diagnostic and therapeutic measures, thus decreasing possible complications and improving prognosis. Furthermore, these injuries require individualized treatment by a multidisciplinary team.

Resumen Introducción. La laceración traqueal post-intubación es una complicación con una baja incidencia, pero que, debido a su relevancia clínica y alto riesgo de mortalidad, debe ser sospechada en casos de intubación endotraqueal. Presentación del caso. Mujer de 74 años con antecedentes médicos de hipertensión arterial e insuficiencias mitral y tricuspídea que fue sometida a colecistectomía laparoscópica bajo anestesia general en un hospital de tercer nivel de Zaragoza, España, procedimiento en el cual se utilizó un videolaringoscopio C-MAC® para realizar la intubación. La paciente, 20 minutos después de la extubación, presentó hemoptisis, disnea y disminución de la saturación de oxígeno, por lo que se le realizó una fibrobroncoscopia en la que se evidenció una laceración traqueal sangrante de 1.5cm. Se inició tratamiento antibiótico endovenoso y mediante radiografía de tórax y tomografía axial computarizada se descartaron complicaciones graves como neumotórax, neumomediastino o rotura traqueal. Durante el período de observación, la paciente tuvo un nivel normal de oxígeno en la sangre y su condición hemodinámica permaneció estable, por lo que recibió el alta hospitalaria a las 72 horas. Conclusiones. Debido a la alta mortalidad asociada a las laceraciones traqueales, se requiere un alto índice de sospecha clínica, en particular en pacientes con factores de riesgo para este tipo de lesiones y en casos de intubación difícil, para no demorar el inicio de medidas diagnósticas y terapéuticas oportunas, disminuyendo así las posibles complicaciones y mejorando el pronóstico. Además, estas lesiones requieren un manejo individualizado por parte de un equipo multidisciplinario.

Pseudoaneurysm of the breast following a core needle biopsy: report of two cases

Abstract Introduction: Core needle biopsy (CNB) is the gold standard for histopathological diagnosis of breast masses. However, rare complications may occur after undergoing CNB, including hematoma and pseudoaneurysm (PA) of the breast. Cases presentation: Case 1: 66-year-old woman with a mass in the left breast who underwent CNB without complications. After approximately eleven months, she noticed a palpable and pulsatile mass in her left breast. She was diagnosed with a PA (1.6x1.3cm) by means of a Doppler ultrasound (US) and breast magnetic resonance imaging, which was surgically resected without any complication using local anesthesia. Case 2: 44-year-old woman with a mass in the left breast. After undergoing CNB, she developed ecchymosis and a palpable and pulsatile mass in her left breast. A Doppler US showed a 1.4x0.7cm cystic lesion suggestive of a breast PA. The mass was surgically resected without complications using local anesthesia and sedation. Conclusion: Breast PA is an extremely rare complication of CNB, with only 17 cases reported in PubMed to date. However, it should be highly suspected in the presence of warning signs such as bleeding, hematoma, and a palpable and/or pulsatile breast mass after undergoing CNB.

Resumen Introducción. La biopsia por punción con aguja gruesa (CNB, por su sigla en inglés) es el estándar de oro para el diagnóstico histopatológico de las masas mamarias. No obstante, complicaciones raras como hematomas y pseudoaneurisma (PA) de la mama pueden ocurrir después de este procedimiento. Presentación de los casos. Caso 1: mujer de 66 años con una masa mamaria izquierda y a la que se le realizó una CNB sin complicaciones. Aproximadamente 11 meses después la paciente notó una masa pulsátil palpable en el seno izquierdo. Mediante ecografía Doppler y resonancia magnética de las mamas se diagnosticó un PA (1.6x1.3cm). La masa fue extirpada quirúrgicamente sin complicaciones bajo anestesia local. Caso 2: mujer de 44 años con una masa mamaria izquierda. Después de realizarse una CNB, la paciente desarrolló equimosis y una masa pulsátil palpable en su mama izquierda. Mediante una ecografía Doppler se observó una lesión cística de 1.4x0.7cm sugestiva de PA mamario. La masa fue extirpada quirúrgicamente sin complicaciones bajo anestesia local y sedación. Conclusión. El PA mamario es una complicación extremadamente rara de la CNB; tan solo 17 casos han sido reportados en PubMed hasta la fecha. Sin embargo, esta entidad debe ser altamente sospechada ante la presencia de signos de alarma como dolor, sangrado, hematoma y una masa mamaria palpable y/o pulsátil tras la realización de una CNB.

Automatic undergraduate degree awarding: a threat to scientific research in Peruvian undergraduate medical programs