Acta Biológica Colombiana

Morpho-agronomic and molecular comparison of fourteen varieties of rice (Oryza sativa) with the lines that gave them the origin

RESUMEN Con el objetivo de determinar las diferencias morfo-agronómicas y de calidad, y la diversidad genética entre 14 variedades de arroz de América Latina con sus respectivas líneas de origen, se estableció un estudio (Bloques completos al azar, con 28 genotipos, tres repeticiones y dos siembras en el tiempo), en el cual se midieron 25 variables morfo-agronómicas y de calidad de grano. El análisis molecular se hizo mediante un arreglo de 96 marcadores tipo SNP de alta capacidad de discriminación para arroces Indica. El análisis estadístico se hizo combinando los datos de las dos siembras porque no hubo diferencias estadísticas entre ellas. Además, se analizaron en conjunto los datos moleculares con los morfo-agronómicos y de calidad, usando el índice de Gower para generar una matriz de similitud. Mediante el programa SAS se analizaron los datos agronómicos y moleculares tanto en forma independiente como en conjunto. Los resultados mostraron que, de las 14 variedades, ocho se agruparon con su línea de origen y hubo una variedad que se agrupó con una línea hermana de su ancestro. Los resultados fueron consistentes cuando el análisis de datos se hizo independientemente o combinado. Dada la amplia diversidad encontrada dentro de las variedades y que ninguna fue homocigota al 100 % no se pudieron establecer los perfiles genéticos distintivos de ellas, por lo que se debe hacer la purificación de las variedades para establecer su huella genética.

ABSTRACT This research aimed to determine the morpho-agronomic, grain quality, and molecular differences between 14 rice varieties and their ancestors. These rice varieties from Latin America were tested for 25 variables in a randomized complete block design with 28 genotypes, two planting dates, and three replications. The molecular analysis was done using an array of 96 SNP markers with a high discrimination capacity for Indica rice. A combined statistical analysis was done because there were no statistical differences between the planting dates. Also, molecular, morpho-agronomic, and grain quality data were analyzed together, using the Gower index to generate a similarity matrix. Agronomic and molecular data were analyzed both, together and independently, through the SAS program. Results showed that eight varieties were grouped with their respective ancestor, and one variety was grouped with a sibling of their ancestor and was consistent in all the analyses. However, given the wide heterozygosity found within the varieties, distinctive genetic profiles could not be established; the varieties must be purified to establish their genetic footprint.

BLOOD CELL MORPHOLOGY AND LEUKOCYTE DIFFERENTIAL OF MORELET'S CROCODILE (Crocodylus moreletii) (CROCODYLIDAE)

ABSTRACT The objective of the study was to determine the morphological characteristics of peripheral blood cells (erythrocytes, leukocytes, thrombocytes) and the leukocyte differential count (heterophils, eosinophils, basophils, lymphocytes, monocytes, azurophils) of captive Morelet's crocodiles (Crocodylus moreletii) from Veracruz, Mexico. Peripheral blood from 80 apparently healthy farmed crocodiles (39 subadults [19 females, 20 males] and 41 adults [18 females, 23 males]) was examined for morphology through stained blood smears and manual count was used for the leukocyte differential. Blood was collected during the non-breeding (n = 42) and breeding (n = 38) seasons. Blood examination indicated similar morphological characteristics of blood cells in subadult and adult individuals and in females and males in both seasons. Erythrocytes were the largest blood cells and lymphocytes the smallest. The leukocyte differential count showed that lymphocytes were the most abundant leukocytes and basophils the least numerous. The percentages of some leukocytes showed difference by season (non-breeding and breeding) in subadult and adult males (p < 0.05) and by size (subadults and adults) in males and females but only in the non-breeding season (p < 0.05). The leukocytes that showed the greatest variation were lymphocytes, heterophils and eosinophils. The knowledge of blood cell morphology and the leukocyte differential count in healthy farmed Morelet's crocodiles will allow the accurate diagnosis of some diseases of captive and wild individuals.

RESUMEN El objetivo del estudio fue determinar las características morfológicas de células sanguíneas periféricas (eritrocitos, leucocitos, trombocitos) y el conteo diferencial de leucocitos (heterófilos, eosinófilos, basófilos, linfocitos, monocitos, azurófilos) del cocodrilo de Morelet (Crocodylus moreletii) mantenido en cautiverio en Veracruz, México. Se examinó sangre periférica de 80 cocodrilos aparentemente sanos criados en granja (39 subadultos [19 hembras, 20 machos] y 41 adultos [18 hembras, 23 machos]) mediante frotis sanguíneos teñidos para determinar la morfología celular y mediante conteo manual para el diferencial de leucocitos. La sangre se recolectó durante las temporadas no reproductiva (n = 42) y reproductiva (n = 38). El examen sanguíneo indicó similar morfología de células sanguíneas en individuos subadultos y adultos, así como en hembras y machos, en ambas temporadas. Los eritrocitos fueron las células sanguíneas más grandes y los linfocitos las más pequeñas. El conteo diferencial de leucocitos mostró que los linfocitos fueron los leucocitos más abundantes y los basófilos los menos numerosos. Los porcentajes de algunos leucocitos mostraron diferencia por época (no reproductiva y reproductiva) en machos subadultos y adultos (p < 0,05) y por talla (subadultos y adultos) en machos y hembras sólo en temporada no reproductiva (p < 0,05). Los leucocitos que tuvieron la mayor variación fueron linfocitos, heterófilos y eosinófilos. El conocer la morfología de las células sanguíneas y el conteo diferencial de leucocitos en individuos sanos de cocodrilo de Morelet criados en granja permitirá diagnosticar con precisión algunas enfermedades de individuos manejados en cautiverio y también de individuos silvestres.

Methylmercury concentrations in Prochilodus magdalenae (Teleostei: Curimatidae) and Hoplias malabaricus (Teleostei: Erythrinidae) in the lower Cauca-Magdalena river system, northern Colombia

RESUMEN Las emisiones de mercurio (Hg) a partir de actividades de minería afectan los recursos pesqueros, los cuales son importantes en la alimentación proteínica de las poblaciones humanas. El objetivo de este estudio fue analizar las concentraciones de MeHg (metilmercurio) en Prochilodus magdalenae (Bocachico) y Hoplias malabaricus (Moncholo) en hábitats continentales de la región de La Mojana y en la parte baja del río Cauca (Norte de Colombia), sitios que han sido afectados por actividades de minería aurífera. Un total de 160 ejemplares fueron colectados para su respectivo análisis, 130 en el grupo expuesto: Mojana 1 (n=36), Mojana 2 (n=56) y El Bajo Cauca (n=38), y n=30 en el grupo control. Se realizaron las determinaciones de MeHg mediante análisis directo con un Analizador Directo de Mercurio DMA 80, cromatografía líquida y espectrometría de absorción atómica. Las concentraciones de MeHg encontradas en muestras de tejido del músculo dorsal de los peces procedentes de los lugares expuestos, fueron significativamente mayores comparados con el grupo control (p < 0.05), siendo la región del Bajo Cauca la más afectada por altas concentraciones de MeHg. Los resultados indican que la presencia de MeHg en los peces es consecuencia de las actividades de minería aurífera ampliamente desarrolladas en la zona. Estas concentraciones MeHg representan un riesgo mortal para la salud humana y animal.

ABSTRACT Mercury (Hg) pollution from mining activities influence fishing resources, which are important for human populations' nutrition. The aim of this research was to explore MeHg (methylmercury) concentrations in Prochilodus magdalenae (bocachico) and Hoplias malabaricus (moncholo) in freshwater habitats of the Mojana region and in the Bajo Cauca river (Northern Colombia), which have been affected by gold mining activities. A total of 160 individuals were collected, 130 in the exposed group: Mojana 1 (36), Mojana 2 (56) and El Bajo Cauca (38); and 30 individuals in the control group (Cereté). After fish sampling, MeHg determinations were done by direct analysis with a Direct Mercury Analyser DMA 80, liquid chromatography, and atomic absorption spectrometry. The results show that MeHg found in the dorsal muscle tissue is significantly higher than in the control group (p < 0.05), the Bajo Cauca region being the most affected due to the high concentrations of MeHg. The results show that the presence of MeHg in fish may be related to gold mining activities, which are widely developed in the area. The toxic concentrations found represent a risk to human health.

NATIVE AMAZONIAN FUNGI TO CONTROL TERMITES Nasutitermes sp. (BLATTODEA: TERMITIDAE)

ABSTRACT Termites of the Nasutitermes genus are considered one of the main urban and agroforestry pests in Brazil, where the main method of control is the application of pesticides. The uso of entomopathogenic fungi to reduce the population of this plague in the environment could be use as an alternative. The goal of this study was to evaluate the virulence of isolates native Amazonian fungi belonging to the Tolypocladium endophyticum, Metarhizium anisopliae and Metarhizium marquandii species for the control of Nasutitermes sp. The strains of T. endophyticum (4.439), M. anisopliae (4.443) and M. marquandii (4.472) with their respective isolation codes, were evaluated using suspensions at concentrations of 105, 106, 107 and 108 conidia/mL against the termites. The fungi were characterized to species level by molecular analysis. The greatest virulence was registered with T. endophyticum (4.439), with a mortality of 100 % on the 4th day of treatment for all analyzed concentrations. The M. anisopliae strain (4.443) proved to be efficient, causing a mortality of 100 % on the 7th and 6th days at dilutions of 107 and 108 conidia/mL, respectively. Rates lower than 100 % were registered with M. marquandii (4.472). Therefore, the three fungal strains showed virulence against the termites Nasutitermes sp. In this study, the fungi Tolypocladium endophyticum and Metarhizium marquandii are reported for the first time for the biological control of pests, indicating the potential of native Amazonian fungi for the biological control of thermites Nasutitermes sp.

RESUMEN Las termitas del género Nasutitermes son consideradas una de las principales plagas urbanas y agroforestales de Brasil, donde el principal método de control es la aplicación de pesticidas. Los hongos entomopatógenos pueden ser usados como alternativa para reducir la población de esta plaga en el medio ambiente. Por tanto, el objetivo de este estudio fue evaluar la virulencia de aislados de hongos nativos de suelo amazónico pertenecientes a las especies Tolypocladium endophyticum, Metarhizium anisopliae y Metarhizium marquandii para el control de Nasutitermes sp. Las cepas de T. endophyticum (4,439), M. anisopliae (4,443) y M. marquandii (4,472) con sus respectivos códigos de aislamiento, fueron evaluadas utilizando suspensiones a concentraciones de 105, 106, 107 y 108 conidios/mL contra las termitas. Los hongos se caracterizaron mediante análisis moleculares para confirmar la especie. La mayor virulencia se registró con el hongo T. endophyticum (4,439), con una mortalidad del 100 % al cuarto día de tratamiento para todas las concentraciones analizadas. La cepa M. anisopliae (4,443) demostró ser eficiente, causando una mortalidad del 100 % al sexto y septimo días a las diluciones de 107 y 108 conidios / mL, respectivamente. Se registraron tasas inferiores al 100 % con M. marquandii (4,472). Por tanto, las tres cepas de hongos mostraron virulencia contra las termitas Nasutitermes sp. En este estudio, los hongos Tolypocladium endophyticum y Metarhizium marquandii son reportados por primera vez para el control biológico de plagas, indicando el potencial de hongos nativos de suelo amazónico para el control biológico de termitas Nasutitermes sp.

Gillnet selectivity for catching bocachico (Prochilodus magdalenae, Prochilodontidae) In Zarate Swamp

RESUMEN La estimación precisa de curvas de selectividad de redes de enmalle en una población de peces es un requisito importante para la sostenibilidad de los stocks explotados. Sin embargo, los trabajos de selectividad para artes de pesca que operan en ecosistemas continentales de Colombia son muy escasos. Este estudio determinó los parámetros de selectividad de redes de enmalle utilizadas en la captura del bocachico (Prochilodus magdalenae). El diseño experimental evaluó tres tamaños de malla (5,72; 6,35 y 8,89 cm) y las capturas se realizaron en diferentes sitios de pesca de la ciénaga de Zárate. Con la utilización del método SELECT se estimaron los parámetros de selectividad y mediante un análisis de Kruskall Wallis se determinaron las diferencias en la captura por unidad de esfuerzo. Además, el tamaño de malla óptimo fue calculado a partir del principio de similaridad geométrica de Baranov. Los resultados muestran que el modelo normal con varianza proporcional al tamaño de malla es el que mejor ajuste presentó para la captura de bocachico. Las longitudes modales calculadas con el modelo normal con varianza proporcional al tamaño de malla fueron 22,90, 25,45 y 35,63 cm para tamaños de malla de 5,72, 6,35 y 8,89 cm, respectivamente. El tamaño de malla óptimo calculado fue 6,99 cm. Los resultados indican que las redes con tamaños de malla de 5,72 cm e inferiores tienen un efecto sobre la estructura de tamaños del bocachico. Estas redes requieren ser priorizadas en la formulación de medidas de manejo basadas en la ordenación de este arte de pesca, lo que permitirá la sostenibilidad de la pesquería.

ABSTRACT Accurate estimation of gillnet selectivity curves in a fish population is an important requirement for the sustainability of exploited stocks. However, selectivity studies for fishing gear operating in Colombia's inland ecosystems is very rare. This study determined the gillnet selectivity parameters used in the catch of the bocachico (Prochilodus magdalenae). The experimental design evaluated three mesh sizes (5.72, 6.35 and 8.89 cm) and the catches were made in different fishing sites at the Zárate swamp. With the use of the SELECT method, the selectivity parameters were estimated and the Kruskall Wallis test determined the differences in the catch per unit effort. Furthermore, the optimal mesh size was calculated from Baranov's principle of geometric similarity. The results show that the normal model (scale) presented the best fit for the catch of bocachico. The modal lengths calculated with the normal scale model were 22.90, 25.45, and 35.63 cm for mesh sizes of 5.72, 6.35, and 8.89 cm, respectively. The calculated optimal mesh size was 6.99 cm. The results indicate that nets with mesh sizes of 5.72 cm and lower influences the size structure of the bocachico. These nets need to be prioritized in the formulation of management measures based on the regulation of this fishing gear, which will allow the sustainability of the fishery.

Diversity of the epiphytic liverworts (Marchantiophyta) of the Suasie sector in the Chingaza National Natural Park.

RESUMEN Los briófitos forman un grupo conspicuo de la flora del planeta. Su contribución ecológica en términos de riqueza de especies y cobertura en muchos hábitats es fundamental para el equilibrio de los servicios ecosistémicos. En Colombia se tiene el registro aproximado de 715 especies de Marchantiophyta (hepáticas), las cuales presentan su mayor riqueza en la región Andina. El estudio se realizó en el Parque Nacional Natural Chingaza - sector Suasie dada su importancia ecológica e hídrica para los municipios aledaños. El objetivo principal de este estudio fue determinar la diversidad de la comunidad de hepáticas en el sector de Suasie del PNN Chingaza. Para ello, se hicieron tres levantamientos en transectos de 2x50 m en un gradiente altitudinal, en cada transecto se muestrearon las hepáticas presentes en cuatro forófitos escogidos al azar. Las muestras recolectadas fueron identificadas para el análisis de composición y diversidad de la comunidad. Como resultado, fue posible evidenciar la variación de la composición y abundancia de hepáticas a lo largo del gradiente, basados no solo en los índices estimados, sino también en la asociación con la cobertura vegetal de cada sitio de muestreo. Con un total de 47 especies registradas, se soporta la alta diversidad del sector en estudio. De esta manera, la riqueza encontrada en este gradiente aporta a las actuales y futuras estrategias de conservación del parque.

ABSTRACT The bryophytes form a conspicuous group of the planet's flora, their ecological contribution in terms of species richness and coverage in many habitats is essential for the balance of ecosystem. In Colombia there is an approximate record of 715 species of Marchantiophyta (liverworts), which present their greatest richness in the Andean region. The study was carried out in the Chingaza National Natural Park - Suasie sector given its ecological and water importance for the surrounding municipalities. The main objective of this study was to determine the diversity of the liverwort community in the Suasie sector of the Chingaza NNP. For this, three surveys were made in transects of 2x50 m in an altitude gradient, in each transect the liverworts present from four phorophytes (trees and shrubs), chosen at random were sampled. The collected samples were identified for analysis of composition and diversity of the community. As a result, it was possible to demonstrate the variation in the composition and abundance of liverworts along the gradient, based not only on the estimated indices, but also on the association with the vegetation cover of each sampling site. With a total of 47 registered species, the high diversity of the sector under study is supported. In this way, the richness found in this gradient contributes to current and future conservation strategies for the park.

Nesting substrates and nest density of stingless bees in the Petenes Biosphere Reserve, Mexico.

RESUMEN Las abejas sin aguijón (ASA) son organismos relevantes en los ecosistemas por su desempeño como polinizadores. En México, la mayor diversidad de ASA se encuentra en el sureste. En este estudio se determinaron las especies de ASA y densidad de nidos en dos sitios con diferente perturbación dentro de la Reserva de la Biósfera de los Petenes (RBLP) Campeche (México). Asimismo, se identificaron los sustratos y las especies arbóreas de nidificación. En total se realizaron diez muestreos en transectos entre los meses de enero a mayo de 2018. Se registraron 56 nidos pertenecientes a ocho especies diferentes de ASA (Cephalotrigona zexmeniae, Frieseomelitta nigra, Lestrimellita niitkib, Nannotrigona perilampoides, Partamona bilineata, Plebeia frontalis, Scaptotrigona pectoralis y Trígona fulviventris). Las especies con mayor número de nidos correspondieron a F. nigra (41,07 %) y S. pectoralis (28,57 %). No se encontraron diferencias significativas en la densidad de nidos entre los sitios Hecelchakán (2,15 nidos/ha) y Calkiní (0,19 nidos/ha). El sustrato preferido para anidación son las cavidades en árboles vivos (78,57 %). En total 15 especies arbóreas fueron identificadas como sustrato de nidificación y la especie más abundante correspondió a Crescentia cujete (n = 18, 40,9 %). El grado de perturbación tuvo poco efecto en el número y densidad de nidos de ASA, sin embargo, en general, la RBLP presentó una composición de especies y densidad de nidos reducida. Por lo tanto, este estudio permitió establecer las bases para futuros estudios sobre estrategias de manejo y conservación de estas especies para evitar su desaparición en la RBLP.

ABSTRACT Stingless bees (ASA) are relevant organisms in ecosystems because of their performance as pollinators. In Mexico, the higher diversity of ASA is found in the southeast. In this study, the ASA species and nest density of nests were identified at two sites with different disturbances (Hecelchakán and Calkiní) within the Petenes Biosphere Reserve (RBLP), Campeche (Mexico). Also, the substrates and the nesting tree species were identified. In total, ten sampling transects were performed between January and May 2018. In total 56 nests belonging to eight different species of ASA (Cephalotrigonazexmeniae, Frieseomelitta nigra, Lestrimellita niitkib, Nanotrigonaperilampoides, Partamona bilineata, Plebeia frontalis, Scaptotrigona pectoralis and Trigona fulviventris) were found. The species with the highest number of nests corresponded to F. nigra (41.07 %) and S. pectoralis (28.57 %). No significant differences were found in nest density between the Hecelchakán (2.15 nests/ha) and Calkiní (0.19 nests/ha) site. The preferred substrate for nesting is cavities in living trees (78.57 %). In total 15 tree species were identified as nesting substrate and the most abundant species corresponded to Crescentia cujete (n = 8, 40.90 %). The degree of disturbance had little effect on the number and density of ASA nest, however, in general, the RBLP presented low species composition and nest density. Therefore, this study allowed to establish the bases for future studies on management and conservation strategies of these species to avoid their loss in the RBLP.

IN VITRO GERMINATION AND VEGETATIVE PROPAGATION THROUGH BUD DEVELOPMENT OF SACHA INCHI (Plukenetia volubilis)

ABSTRACT This study describes the in vitro seed germination and micropropagation of Plukenetia volubilis (sacha inchi), an oilseed crop rich in omega-3 fatty acids, with health benefits and several industrial applications. Seed germination was evaluated in different culture media (MS and 1/2 MS), seed coat presence/absence and culture temperature (18 °C and 28 °C). Micropropagation was performed using axillary bud development (ABD) on nodal segments from in vitro seedlings. KIN, BAP and 2-ip were evaluated for ABD, and the effect of modified MS in 453 mg L-1 CaCl2 and 351.62 mg L-1 MgSO4 on ABD and shoot survival was assessed to improve the process. Finally, six treatments were evaluated to optimize ABD and shoot leaf formation. Seed germination of 91.6 % was achieved in MS at 28 °C when the seed coat was removed. ABD was obtained in 45 % and 40 % with 0.4 mg L-1 KIN and 0.6 mg L-1 2-ip, respectively, with the least CAL. The modification in 453 mg L-1 CaCl2 then allowed 76 % ABD and 82 % explant survival. ABD response was optimized to 95 % and 2.45 leaves with MS medium + CaCl2 modification + 10 % coconut water + 0.4 mg L-1 KIN. The same results were obtained by replacing the latter with 0.6 mg L-1 2-ip. Rooting was achieved in MS without PGR, and acclimatization was successful. The results indicate that plant production via germination and vegetative propagation is effective for commercial purposes.

RESUMEN Este estudio describe la germinación in vitro y micropropagación de Plukenetia volubilis, un cultivo oleaginoso rico en omega-3 benéfico para la salud y con múltiples aplicaciones industriales. Se evaluó en la germinación diferentes medios de cultivo (MS y 1/2 MS), presencia-ausencia de testa y temperatura de cultivo (18 ° C y 28 ° C). La micropropagación se realizó vía yemas axilares (ABD) de plántulas in vitro. Se evaluó el efecto de KIN, BAP y 2-ip sobre ABD, seguidamente, para mejorar el proceso se evaluó el efecto de MS modificado en 453 mg L-1 CaCl2 y 351.62 mg L-1 MgSO4 sobre ABD y supervivencia del brote. Finalmente, se evaluaron seis tratamientos para optimizar ABD y la formación de hojas. Se logró una germinación 91,6 % en MS a 28 °C cuando se retiró la testa. Se obtuvo 45 % y 40 % de ABD con 0,4 mg L-1 KIN y 0,6 mg L-1 2-ip respectivamente, ambos con la menor CAL. Posteriormente, la modificación de CaCl2 permitió 76 % ABD y 82 % de supervivencia. Se optimizó ABD al 95 % con 2,45 hojas por brote con el medio: MS + modificación de CaCl2 + 10 % de agua de coco + 0.4 mg L-1 KIN, los mismos resultados se obtuvieron cambiando este último con 0,6 mg L-1 2-ip, se logró enraizamiento en MS sin PGR, y la aclimatización fue exitosa. Los resultados indican que la producción de plantas vía germinación y propagación vegetativa es efectiva con fines comerciales.

Diversity and annual fluctuation of cerambicids (Coleoptera: Cerambycidae) in a tropical forest of southeast Mexico

RESUMEN Se estimó la diversidad y fluctuación anual de cerambícidos asociados al borde e interior de una selva tropical. La captura de insectos se realizó con trampas de intercepción cebadas con alcohol etílico y luz ultravioleta como atrayente. Se recolectaron 295 especímenes de tres subfamilias, pertenecientes a 56 especies de 38 géneros. Lamiinae fue la subfamilia con mayor riqueza, con 40 especies distribuidas en 20 géneros, para Cerambycinae se recolectaron 14 especies de 12 géneros y para Parandrinae dos especies de un género. El género con mayor abundancia fue Leptostylus con ocho especies. Se identificaron seis especies como nuevos registros para México y 29 para Tabasco. En el borde de la selva se recolectaron 155 especímenes de dos subfamilias, pertenecientes a 37 especies de 26 géneros. En el interior se recolectaron 140 especímenes de tres subfamilias pertenecientes a 36 especies de 26 géneros. Se determinó que las comunidades comparten 17 especies. El mayor valor de diversidad verdadera se obtuvo en el borde con 15,96 y la menor en el interior con 12,69. Se determinó que los valores de A, A* y A+ implican una baja separación filogenética entre las especies de cerambícidos en ambas comunidades. La fluctuación temporal de la comunidad de cerambícidos presentó los máximos valores de abundancia en febrero, mayo y agosto, meses donde se registra una reducción en la precipitación. Finalmente, la curva de acumulación de especies aún no presenta una asíntota, por lo que se podría incrementar los nuevos registros.

ABSTRACT The diversity and annual fluctuation of cerambicids associated with the rain forest edge and interior was estimated. The capture of insects was performed with interception traps baited with ethyl alcohol and ultraviolet light traps used as attractants. 295 specimens from three subfamilies, belonging to 56 species of 38 genera were collected. Lamiinae was the richest subfamily, with 40 species distributed in 20 genera, for Cerambycinae 14 species from 12 genera were collected and for Parandrinae two species of one genus. The most abundant genus was Leptostylus with eight species. Six species were identified as new records for Mexico and 29 for Tabasco. In the forest edge, 155 specimens from two subfamilies, belonging to 37 species from 26 genera, were collected. In the forest interior 140 specimens were collected from three subfamilies, belonging to 36 species from 26 genera. It was determined that the communities have 17 shared species. The maximum value of true diversity was obtained in the forest edge with 15.96 and the minimum value in the forest interior with 12.69. The values of A, A * and A+ were determined and implied a low phylogenetic separation between the cerambycid species in both communities. The temporal fluctuation of the Cerambycidae community presented the maximum values abundance in February, May and August, months where there is a reduction in the precipitation. Finally, the species accumulation curve does not present an asymptote, so new records may increase.

The total water hardness affects molting, calcification, growth and survival of Cryphiops caementarius (Palaemonidae)

RESUMEN El objetivo de este estudio fue evaluar los efectos de diferentes niveles de dureza total del agua en la muda, calcificación del exoesqueleto, crecimiento y supervivencia de Cryphiops caementarius. Los camarones machos fueron colectados del río Pativilca (Lima, Perú) y cultivados en recipientes individuales dentro de acuarios (55 L). Se emplearon cuatro niveles de dureza total del agua (100, 200, 300 y 400 mg CaCO3 L-1), con tres repeticiones, respectivamente. Los camarones cultivados en agua con dureza de 300 mg L-1 tuvieron menor periodo de muda (26,7 días) y mayor frecuencia de mudas (tres mudas). El contenido de calcio del exoesqueleto del camarón incrementó (p < 0,05) de 25 a 31 % en agua con dureza de 100 y 400 mg L-1, respectivamente. El mayor grosor del exoesqueleto (144 |jm en cefalotórax y 131 μm en abdomen) fue obtenido en agua con dureza de 400 mg L-1 y el menor grosor (93 |jm en cefalotórax y abdomen) en 100 mg L-1. El crecimiento en longitud fue mayor (p < 0,05) en agua con durezas de 200 y 300 mg L-1. El crecimiento en peso fue similar (p > 0,05) entre tratamientos. La mayor supervivencia (> 94,4 %) se mantuvo en agua con durezas de hasta 300 mg L-1 y la menor supervivencia (77,8 %) fue con 400 mg L-1. La dureza total del agua de 200 y 300 mg L-1 es conveniente para el cultivo del camarón, pero dureza del agua mayor o menor a este rango afectan la muda, el crecimiento y la supervivencia por deficiencia o exceso de calcio acumulado, respectivamente en el exoesqueleto del camarón.

ABSTRACT The aim of this work was to evaluate the effects of different levels of total hardness on the molting, calcification of exoskeleton, growth and survival of Cryphiops caementarius prawn. Male prawns were collected from Pativilca river (Lima, Peru) and cultivated in individual containers inside aquariums (55 L). Four levels of the total hardness of water (100, 200, 300 and 400 mg CaCO3 L-1) were used, with three repetitions, respectively. Prawns cultured in water with hardness of 300 mg L-1 has a shorter molting period (26.7 days) and a higher frequency of molts (three molts). The calcium content of the prawn exoskeleton increased (p < 0.05) from 25 to 31 % in water with hardness of 100 and 400 mg L-1, respectively. The greatest thickness of the exoskeleton (144 |jm cephalothorax and 131 |jm abdomen) was obtained in water with a hardness of400 mg L-1 and the smallest thickness (93 |jm in the cephalothorax and abdomen) in 100 mg L-1. The growth in length was greater (p < 0.05) in water with hardness of 200 and 300 mg L-1. The weight growth was similar (p > 0.05) between treatments. The highest survival (> 94.4 %) was maintained in water with hardness up to 300 mg L-1 and the lowest survival (77.8 %) was at 400 mg L-1. The total hardness of 200 and 300 mg L-1 is suitable for prawn farming, but hardness high or lower than this range affects the molting, growth and survival due to deficiency or excess of accumulated calcium, respectively, in the prawn exoskeleton.

Application of the model of DNA loss for desing of primers in Potamotrygon magdalenae (Potamotrygonidae)

RESUMEN El diseño de cebadores es fundamental para amplificar regiones de genes debido a que la especificidad que mantienen cebador-secuencia de interés puede causar el éxito o fracaso en la reacción de PCR. En relación a Potamotrygon magdalenae (especie de interés de acuerdo al PAN Tiburones-Colombia), existe poca información disponible de aspectos relacionados con la genética poblacional de esta Raya. El objetivo del presente trabajo consistió en diseñar cebadores bajo los criterios del Modelo de Pérdida de ADN (DNA-LM), que permitan evaluar el estado genético de las poblaciones de P. magdalenae. Alineamos secuencias de la superfamilia Dayastoidea, disponibles en el NCBI, de los genes mitocondriales Citocromo C Oxidasa 1 (MT-CO1) y Citocromo b (MT-CYB). Seguimos los parámetros Gap open penalty (5), Gap extension penalti (0,2) y Terminalgap penalties (0,1) y seleccionamos dos pares de cebadores de acuerdo con el DNA-LM. Estimamos el producto amplificado del gen MT-CO1 en 916 pb y del gen MT-CYB en 774 pb, en muestras de P. magdalenae procedentes de diferentes ciénagas del Magdalena medio. Discutimos los resultados desde la perspectiva de validar la especificidad de los cebadores diseñados, teniendo en cuenta la correspondencia e identidad de las secuencias de los genes considerados. Los cebadores aquí reportados pueden contribuir a ampliar el conocimiento de la genética poblacional, biogeografía y filogenética de la raya de agua dulce P. magdalenae.

ABSTRACT The primer design is critical for amplifying gene regions because the specificity that primer-sequence maintain can cause success or failure in the PCR reaction. Concerning Potamotrygon magdalenae (a species of interest according to the PAN Tiburones-Colombia), there is little information available about aspects related to population genetics of this river stingray. This study aimed to design primers under DNA Loss Model (DNA-LM) criteria, which will allow assessing the genetics status of populations of P. magdalenae. We aligned sequences from the superfamily Dayastoidea, available in the NCBI, of the mitochondrial genes Cytochrome C Oxidase 1 (MT-CO1) and Cytochromeb (MT-CYB). We followed the parameters Gap open penalty (5), Gap extension penalty (0.2) and Terminal gap penalties (0.1) and selected two pairs of primers according to the DNA-LM. We calculated the amplified product of the MT-CO1 gene in 916 pb and the MT-CYB gene in 774 pb in samples from different swamps of the middle Magdalena. We discussed the results from the perspective of validating the specificity of the primers designed, considering the correspondence and identity of gene sequences considered. The primers reported here will contribute to broadening the knowledge of population genetics, biogeography and phylogenetic of the river stingray P. magdalenae.

Genetic diversity of soursop populations (Annona muricata L.) in Nayarit, Mexico using SSR and SRAP markers

RESUMEN La guanábana (Annona muricata L.) es un cultivo de importancia económica para Nayarit, México. Los frutos han tenido una excelente aceptación en el mercado regional, dificultando su comercialización a lugares lejanos porque la producción es altamente perecedera, aunado a que los árboles de los huertos de guanábana son en su mayoría ecotipos o fenotipos sin ningún plan de mejoramiento genético. Debido a la falta de variedades comerciales y de un banco de germoplasma, es importante conocer la diversidad genética para identificar y seleccionar genotipos; una de las herramientas para este propósito es el uso de marcadores moleculares. El objetivo de esta investigación fue analizar la diversidad genética de guanábana de las principales zonas productoras de Nayarit. Se extrajo ADN genómico de hojas de guanábana, las cuales fueron recolectadas de 11 huertos (poblaciones) de las siguientes zonas: Compostela (cinco poblaciones), Tepic (tres poblaciones) y San Blas (tres poblaciones). Posteriormente, se realizó un análisis mediante marcadores moleculares SSR y SRAP. Los resultados indicaron que los SSR no mostraron polimorfismo entre las poblaciones. Por otro lado, en los marcadores SRAP se obtuvieron 116 loci polimórficos con un promedio de porcentaje de loci polimórfico (P) entre las zonas productoras de 29,55 %. Asimismo, se realizó un AMOVA, el cual mostró que el mayor porcentaje de varianza se encuentra dentro de las poblaciones. Además, los análisis de agrupamiento demostraron la formación de tres grupos independientes. Por tanto, se obtuvo una alta homocigocidad y baja diversidad genética de guanábana entre las zonas y poblaciones estudiadas.

ABSTRACT Soursop (Annona muricata L.) is a crop of economic importance for Nayarit, Mexico. Soursop fruits have had an excellent acceptance in the regional market, making it difficult its commercialization to distant places because the production is highly perishable, in addition to the fact that the trees in the soursop orchards are mostly ecotypes or phenotypes without any genetic improvement plan. Due to the lack of commercial varieties and a germplasm bank, it is important to know the genetic diversity to identify and select genotypes; one of the tools for this purpose is the use of molecular markers. The objective of this research was to analyze the genetic diversity of soursop in the main producing areas of Nayarit. Genomic DNA was extracted from soursop leaves from 11 orchards (populations) in the following areas: Compostela (five populations), Tepic (three populations) and San Blas (three populations). Subsequently, we performed molecular analysis using SSR and SRAP molecular markers. The results indicated that the SSRs showed no polymorphism between the populations. On the other hand, we found 116 polymorphic loci in the SRAP markers with an average percentage of polymorphic loci (P) among the producing areas of 29.55 %. Likewise, an AMOVA was performed, showing that the highest percentage of variance is found within the populations. Furthermore, cluster analyzes demonstrated the formation of three independent groups. Therefore, a high homozygosity and low genetic diversity of soursop were obtained between the areas and populations studied.

Ambystoma mexicanum, A MODEL ORGANISM IN DEVELOPMENTAL BIOLOGY AND REGENERATION: A COLOMBIAN EXPERIENCE

ABSTRACT Ambystoma mexicanum is a urodele amphibian endemic to Xochimilco Lake in Mexico, it belongs to the salamander family Ambystomatidae. This species has frequently been used as model organism in developmental biology and regeneration laboratories around the world due to its broad regenerative capacities and adaptability to laboratory conditions. In this review we describe the establishment of the first colony of axolotls in Colombia to study tissue regeneration and our perspectives on the use A. mexicanum as a model organism in Colombia are discussed emphasizing its possible uses in regeneration and developmental biology.

RESUMEN Ambystoma mexicanum es un anfibio urodelo endémico del lago Xochimilco en México, perteneciente a la familia de salamandras Ambystomatidae. Esta especie se ha empleado frecuentemente como organismo modelo en laboratorios de biología del desarrollo y regeneración alrededor del mundo, dadas sus amplias capacidades regenerativas y adaptabilidad en condiciones de laboratorio. En esta revisión, se describe el establecimiento de la primera colonia de ajolotes en Colombia, para adelantar estudios de regeneración de tejidos, y se discuten las perspectivas de A. mexicanum como organismo modelo en el país, enfatizando sus posibles usos en regeneración y biología del desarrollo.

NEW DATA ON THE THREATENED Cerradomys goytaca (RODENTIA, CRICETIDAE)

ABSTRACT Cerradomys goytaca is a cricetid rodent endemic to "Restinga" formations from southeastern Atlantic Forest. It is known from only five localities, and it is considered endangered of extinction. Herein, we furnish new data on C. goytaca from an additional locality in Rio de Janeiro state. The present record provides new data on habitat and represents the westernmost geographic limit of this poorly known species.

RESUMEN Cerradomys goytaca es un roedor cricetideo endémico de las formaciones de Restinga del sureste de la Selva Atlantica. Es conocido solo en cinco localidades, y se considera en peligro de extinción. Aquí, proporcionamos nuevos datos sobre C. goytaca de una localidad adicional en el estado de Río de Janeiro. El presente registro proporciona nuevos datos del hábitat y representa el límite geográfico más occidental de esta especie poco conocida.

Saurochory in crocodiles does not favor seed dispersai and viability

RESUMEN La dispersión de semillas por reptiles (saurocoría) ha recibido atención recientemente y se ha reportado el consumo de frutos y semillas en cocodrilianos, actuando como potenciales dispersores de semillas. Evaluamos si la saurocoría en Crocodylus actus y C. moreletii afecta la viabilidad de tres especies de plantas Delonixregia, Inga sp. y Citrullus lanatus. Se Utilizaron tres individuos juveniles de cada especie de cocodrilo y se alimentaron con 22 semillas por especie de planta, para un total de 66 semillas por recinto (132 para ambos). Las semillas se mezclaron con la dieta habitual cada semana, las semillas no consumidas y las excretadas se recolectaron y sembraron en suelo tratado con composta para evaluar la tasa de germinación relativa. Un total de 99 semillas fueron consumidas pero solo se recuperaron de las heces 14 semillas de C. lanatus, y germinando solo una de ellas (7, 14 %) con respecto al 50 % en el grupo control. Los resultados indican que la saurocoría de C. acutus y C. moreletii tiene un efecto negativo sobre la viabilidad de las semillas de las especies vegetales estudiadas, concordando con otros estudios realizados en diferentes especies.

ABSTRACT Seed dispersal by reptiles (saurochory) has recently received attention, and the consumption of fruits and seeds has been reported in crocodilians despite being mainly carnivores, acting as potential seed dispersers. We evaluate whether saurochory by Crocodylus acutus and C. moreletii affect the seed viability of three species of plants (Delonix regia, Inga sp., and Citrullus lanatus). We performed feeding trials, using three juvenile individuals of each species of crocodile, and fed them 22 seeds per plant species for a total of 66 seeds per enclosure (132 for both species). Seeds were combined with the usual diet each week. The unconsumed and excreted seeds were collected and planted in soil treated with compost to evaluate the relative germination rate. A total of 99 seeds were consumed, of which only 14 seeds of C. lanatus were recovered from the faeces, and only one of those germinated (7.14 %) with respect to 50 % in the control group. The results indicate that saurochory by C. acutus and C. moreletii has a negative effect on seed viability and germination of the plant species studied, as found in other studies using different species.

Leptodactylus vastos (LEPTODACTYLIDAE) PREDATION ON AN ENDEMIC FROG, AND A COMPILATION OF ITS DIET

RESUMEN La composición de la dieta constituye información básica sobre la historia natural de la especie. A pesar de la cantidad de datos adquiridos en los últimos años, aún queda mucho por conocer, especialmente para especies geográficamente extendidas. Aquí compilamos los elementos dietéticos disponibles de Leptodactylus vastus y reportamos el primer evento de depredación de Rupirana cardosoi por un juvenil de L. vastus. El hecho de que estas especies sean sintópicas en la región probablemente resultó en este nuevo evento de depredación. A diferencia de las observaciones previas de depredación de L. vastus, los especímenes que observamos no presentan una diferencia notable en el tamaño corporal, pero L. vastus fue capaz de casi tragar R. cardosoi, en coherencia con los hallazgos de que el tamaño de la boca está relacionado con la selección de presas en los anuros. Además, nuestra revisión de la literatura mostró que L. vastus es un depredador generalista y oportunista, que se alimenta de pequeños vertebrados (Amphibia, Squamata y Mammalia).

ABSTRACT Diet composition constitutes basic information on the natural history of the species. Despite the amount of data acquired in the last years, much remains to be known specially for geographically widespread species. Here we compiled the available dietary items of Leptodactylus vastus and report the first predation event upon Rupirana cardosoi by a juvenile L. vastus. The fact these species are syntopic in the region probably resulted in this novel predation event. Different from previous L. vastus predation observations, the specimens we observed do not present a striking difference in body size, but L. vastus was able to almost swallow L. cardosoi, coherent with findings that mouth size is related to prey selection in anurans. Also, our literature review showed that L. vastus is a generalist and opportunistic predator, that prey upon small vertebrates (Amphibia, Squamata, and Mammalia).

PCR detection of Haemoproteus archilochus in Rufous-tailed Hummingbird Amazilia tzacatl (Trochilidae) in Colombia.

RESUMEN La infección causada por haemosporidios en colibríes no ha sido estudiada en zonas agroforestales o urbanas de la vertiente occidental de la Cordillera Oriental de los Andes en el departamento de Santander, pese a existir evidencia de esta en otros grupos de aves. Con el fin de detectar e identificar los parásitos causales de infecciones por haemosporidios, se tomaron muestras de sangre de la vena yugular de colibríes en seis localidades. La presencia de infección se llevó a cabo por PCR y la identificación de los parásitos se hizo a partir de secuencias del gen mitocondrial Citocromo b (Cyt b). Se obtuvieron 86 muestras de sangre de 20 especies de colibríes. La prevalencia de infección en general fue del 43 % y en el 18 % de las muestras infectadas del colibrí Amazilia colirufa (Amazilia tzacatl) se identificaron secuencias de Haemoproteus archilochus correspondientes al linaje HUMHA4. Se reporta por primera vez para Colombia la presencia de H. archilochus en A. tzacatl, por medio de técnicas de biología molecular. Este parásito podría estar implicado en la haemoproteosis de colibríes en el país.

ABSTRACT Haemosporidian infection in hummingbirds has not been studied in agroforestry or urban areas of the Eastern Andes' western slope, in the department of Santander, despite the existence of evidence of this in other groups of birds. To detect and identify the causative parasites of haemosporidium infections, we took blood samples from the jugular vein of hummingbirds in six locations. PCR carried out the diagnosis of the infection, and the identification of the parasites was made from sequences of the mitochondrial gene Cytochrome b (Cyt b). 86 blood samples were obtained from 20 species of hummingbirds. The prevalence of infection, in general, was 43 %, and in 18 % of the infected samples of Rufous-tailed Hummingbird (Amazilia tzacatl), sequences of HUMHA4 lineage from Haemoproteus archilochus were identified. The presence of H. archilochus in A. tzacatl is reported for the first time in Colombia using molecular biology techniques. This parasite could be implicated in the haemoproteosis of hummingbirds in the country.