Infectio

In memoriam: Professor Manuel Elkin Patarroyo Murillo (1946-2025): Lessons of a monumental legacy for the Colombian and Latin-American science

Characterization of patients with Covid-19 and Community Acquired Pneumonia, in a high complexity hospital, during the Covid-19 pandemic

Resumen Introducción: La neumonía adquirida en la comunidad (NAC) es una de las infecciones más frecuentes del mundo, aportando una gran carga de morbimortalidad e impacto económico. El objetivo de este estudio fue caracterizar pacientes con Neumonía Adquirida en Comunidad (NAC) y Covid-19, en un hospital de alta complejidad del suroccidente Colombiano. Materiales y métodos: Se realizó un estudio retrospectivo de pacientes con NAC y Covid-19, atendidos en el Hospital Universitario del Valle (HUV) entre enero de 2020 a enero de 2021, que cumplían con los criterios diagnósticos establecidos por las guías del Ministerio de Salud y Protección Social de Colombia. Las variables cuantitativas se presentaron como media y desviación estándar o mediana y rango intercuartílico, y las cualitativas en frecuencias. En el análisis bivariado se usaron las pruebas t de Student, Mann-Whitney, Fisher exacta y chi-cuadrado. Valores de p < 0.05 se consideraron significativos. Resultados: Se incluyeron 275 pacientes; 75 pacientes tenían NAC y 200 tenían Covid-19. La mediana de edad de los pacientes con Covid-19 fue de 54 años (4163,5), mientras que en paciente con NAC fue de 45,5 años (24-63,5) (p=0,01). Entre los hallazgos más relevantes, el 72,7% de los pacientes con Covid-19 requirió UCI, mientras un 27,3% de los pacientes con NAC necesitó UCI (p<0,001). La mortalidad fue del 25,3 % en los pacientes con NAC, y 33% en pacientes con Covid-19. Discusión: Se encontró una mayor edad en los pacientes con Covid-19 que en NAC, además de una alta prevalencia de antecedentes patológicos como hipertensión arterial y tabaquismo, en concordancia con estudios previos. Los pacientes con Covid-19 presentaron mayor severidad clínica, necesitando en su mayoría hospitalización en UCI, en comparación con los pacientes con NAC. La alta mortalidad observada tanto en Covid-19 como en NAC, podría atribuirse al nivel de complejidad del hospital.

Abstract Introduction: Community-acquired pneumonia (CAP) is one of the most frequent infections worldwide and contributes to a large burden of morbidity, mortality, and economic impact. This study aimed to characterize patients with community-acquired pneumonia (CAP) and Covid-19, in a highly complex hospital in the southwestern region of Colombia. Materials and methods: A retrospective study was conducted on patients with CAP and Covid-19, treated at the Hospital Universitario del Valle (HUV) between January 2020 and January 2021, who met the diagnostic criteria established by the guidelines of the Ministry of Health and Social Protection of Colombia. Descriptive analysis of qualitative variables was performed using absolute and relative frequencies. For quantitative variables, summary measures were used to describe data. Results: A total of 275 patients were included: 75 patients had CAP and 200 had Covid-19. The median age of patients with Covid-19 was 54 years (41-63,5), while that of patients with CAP was 45,5 years (24-63,5) (p=0,01). Among the most relevant findings in patients with Covid-19, 72,7% required ICU admission, whereas 27,3% of patients with CAP required ICU admission (p<0,001). The mortality rate was 25,3% in patients with CAP and 33% in patients with Covid-19. Discussion: Covid-19 patients were older than those with CAP and had a higher prevalence of comorbidities, such as hypertension and smoking, consistent with previous studies. Patients with Covid-19 presented with greater severity, with most of them requiring ICU hospitalization, than patients with CAP. The high mortality observed in both Covid-19 and CAP patients could be attributed to hospital complexity.

Characterization of acute infectious encephalitis due to chikungunya in the pediatric population in 2023

Resumen Introducción: Chikungunya está causada por un arbovirus, trasmitido por mosquitos de la especie Aedes. Puede presentarse como forma clásica o atípica. Manifestaciones atípicas incluyen afectación de muchos órganos vitales; entre ellos, la encefalitis aguda es la forma más frecuente de afectación neurológica. El objetivo de este estudio fue caracterizar los casos de encefalitis por CHIK-V. Materiales y métodos: Descriptivo, prospectivo, observacional, de prevalencia enero a marzo 2023. Pacientes pediátricos, con diagnóstico de CHIK-V por PCR en sangre, y con diagnóstico de encefalitis por PCR-RT y/o alteraciones del LCR. Resultados: De 157 pacientes, 36 (22,9%) con diagnóstico de encefalitis De ellos, 36,6% recién nacidos, 27,7% lactantes menores, 11% lactantes mayores, 25% escolares. 17(47,2%) fueron mujeres. Fiebre en 100%, convulsiones 52,7%, exantema 50%, acrocianosis 30,5%, alteración del sensorio 11%. LCR con hiperproteinorraquia en 63,8%, pleocitosis con predominio de mononucleares en 72,2%. Ambas alteraciones simultáneamente 52,7%. El PCR-RT en LCR fue positivo en 69,4%. Quince (41,6%) ingresaron a unidad de terapia intensiva por choque o alteración encefálica, Siete pacientes recibieron inmunoglobulinas intravenosas, además de la terapia de soporte. No se registró mortalidad. Discusión: La encefalitis por CHIK-V se presentó en 22% de pacientes, afectó principalmente a RN y lactantes menores. Las alteraciones del LCR fueron pleocitosis e hiperproteinorraquia. No se registró mortalidad.

Abstract Introduction: Chikungunya is caused by an arbovirus transmitted by mosquitoes of Aedes species. It can present as a classic or atypical form. Atypical manifestations include involvement of many vital organs; among them, acute encephalitis is the most common form of neurological involvement. The objective of this study was to characterize CHIK-V encephalitis. Materials and methods: Descriptive, prospective, observational, prevalence between January and March 2023. Pediatric patients with a diagnosis of CHIK-V by PCR in blood and with a diagnosis of encephalitis by PCR-RT and/or CSF alterations. Results: Of 157 patients, 36 (22.9%) were diagnosed with encephalitis. Of these, (36.6%) newborns, (27.7%) minor infants, (11%) older infants, (25%) children. 17 (47.2%) were female. Fever occurred in 100%, convulsions in 52.7%, rash in 50%, acrocyanosis in 30.5%, and sensorium alteration in 11%. CSF showed hyperproteinorrachia in 63.8% of patients, predominantly mononuclear pleocytosis in 72.2% of patients. Both the alterations occurred simultaneously (52.7 %). The PCR-RT rate of positivity in the CSF was 69.4%. Fifteen (41.6%) patients were admitted to the PICU because of shock or brain alterations. Seven patients received intravenous immunoglobulins in addition to the supportive therapy. No mortality was observed in any patient. Discussion: CHIK-V encephalitis occurred in 22% of the patients, mainly affecting newborns and young infants. The CSF alterations included pleocytosis and hyperproteinorrachia. No mortality was recorded.

Intensity and duration of the humoral immune response to the COVID-19 vaccine in healthcare workers, using a quantitative IgG antibody test

Resumen Introducción: La pandemia de COVID-19 ha afectado severamente a la humanidad, causando una alta morbilidad y mortalidad en todos los países del mundo. El objetivo de este estudio fue determinar la intensidad y duración de la respuesta de anticuerpos IgG frente a la vacuna para COVID-19 en trabajadores de la salud. Materiales y métodos: Estudio descriptivo prospectivo longitudinal de evaluación de la respuesta inmune a la vacuna para COVID-19, con cuantificación de anticuerpos IgG para SARS-CoV-2. Se realizaron mediciones a los 4, 8, y 12 meses post vacuna. Resultados: Primera medición (306 trabajadores): mediana de anticuerpos de 770.5 BAU/ml (RIQ: 338.7-2314.2); segunda medición (169 trabajadores): mediana de 185.7 BAU/ml (RIQ: 85.4-418.1); tercera medición (88 trabajadores): mediana de 3270 BAU/ml (RIQ:2480-3270). Mayor respuesta de anticuerpos en los trabajadores con antecedente de COVID-19. Discusión: La vacuna para COVID-19 genera una buena respuesta de anticuerpos, los cuales disminuyen en el tiempo y se recuperan con una dosis de refuerzo. La prueba de anticuerpos IgG cuantitativa contra RBD puede ser un buen correlato de protección.

Abstract Introduction: The COVID-19 pandemic severely affected humanity, causing high morbidity and mortality in all countries worldwide. The objective of this study was to determine the intensity and duration of IgG antibody response to the COVID-19 vaccine in healthcare workers. Materials and methods: A prospective descriptive longitudinal study was conducted to evaluate the immune response generated by a vaccine against COVID-19 by quantifying IgG antibodies to SARS -Cov-2. Measures were taken at 4, 8, and 12 months after vaccination. Results: In the first intake, 306 workers were studied, and the median of antibodies was 770.5 BAU/ml (IQR: 338.7-2314.2), in the second intake 169 workers with a median of 185.7 BAU/ml (IQR: 85.4-418.1), and in the third sample, 88 workers with a median of 3270 BAU/ml (IQR: 2480-3270). A higher antibody response rate was observed in workers with a history of COVID-19. There were no significant differences in antibody responses according to age, sex, job title, or workplace. Discussion: The COVID-19 vaccine generates a good antibody response, but this response decreases over time; therefore, booster doses are required. Quantitative RBD IgG antibody testing may be a good indicator of protection.

Intestinal parasites in children and adolescents from rural communities of Manabí, Ecuador

Abstract Introduction: Intestinal parasitosis is a public health problem that affects people of all ages and sexes; however, it occurs mainly in the first few years of life. This study aimed to identify the profile of intestinal parasites in children and adolescents from three rural communities in Manabí, Ecuador. These communities have never been evaluated parasitologically. Materials and methods: An observational, descriptive, prospective, and cross-sectional study was designed, in which fecal samples were collected from children and adolescents, which were processed by direct coproparasitological examination and the concentration method with formalin-gasoline (Ritchie-Frick). Results: Of the 154 individuals studied, 70 were parasitized (45.50%), of which 67.15% presented only one parasitic species. The main species detected were the chromist Blastocystis sp., Endolimax nana, and Entamoeba coli; only Enterobius vermicularis was found in 2.60% of the individuals. In relation to parasitism by age and sex, a higher prevalence of parasitized children aged 6-11 years was observed, without major differences in parasitism by sex (female 42.70% and male 48.10%). A significant association was found between polyparasitism and male sex as well as between parasitism and community, with the Frutillo community having the highest prevalence. Discussion: A medium prevalence of intestinal parasites and a predisposition of these communities to infections caused by protozoa/chromists may be related to the ingestion of contaminated/untreated water.

Resumen Introducción: La parasitosis intestinal es considerada un problema de salud pública que afecta a personas de todas las edades y sexos; pero se presentan principalmente en los primeros años de vida. El objetivo de este estudio fue Identificar el perfil de parásitos intestinales en niños y adolescentes de tres comunidades rurales de Manabí, Ecuador. Dichas comunidades nunca habían sido evaluadas parasitológicamente con anterioridad. Materiales y métodos: Se diseñó una investigación observacional, descriptiva, prospectiva y transversal, donde se recolectaron muestras fecales de niños y adolescentes, las cuales fueron procesadas mediante examen coproparasitológico directo y método de concentración con formol-gasolina (Ritchie-Frick). Resultados: De los 154 individuos estudiados, se observó que 70 de ellos estaban parasitados (45,50%); de estos, el 67,15% presentó una sola especie parasitaria. Predominaron los protozoarios y cromistas sobre las especies de helmintos. Las principales especies detectadas fueron el cromista Blastocystis sp., Endolimax nana y Entamoeba coli; solo se encontró Enterobius vermicularis en 2,60% de los individuos. En relación con el parasitismo por edad y sexo, se determinó una mayor prevalencia de parasitados en los niños de 6 a 11 años (51,60%), sin mayores diferencias de los parasitados por sexo (femenino 42,70% y masculino 48,10%). Se determinó asociación significativa entre las variables poliparasitismo y sexo masculino, así como entre parasitismo y comunidad, siendo la comunidad del Frutillo la de mayor prevalencia. Discusión: Se encontró una mediana prevalencia de parásitos intestinales y una predisposición de estas comunidades a las infecciones producidas por protozoos/ cromistas, posiblemente relacionadas con la ingestión de agua contaminada/no tratada.

Short-term outcomes of newborns with SARS-CoV-2 infection

Resumen Introducción: La pandemia por COVID-19 se convirtió en el problema de salud pública más grave de los últimos años. El primer caso presentado en niños se documentó en el mes de enero de 2020 en Shenzhen, China, y a final de mes ya se habían descrito más de 20 casos pediátricos en dicho país. El objetivo de este estudio fue describir las características clínicas, tratamiento y desenlaces tempranos de los recién nacidos con infección por SARS-CoV-2 hospitalizados en la unidad de recién nacidos del Hospital Universitario San Ignacio (HUSI) en Bogotá, Colombia entre el 1 de marzo del año 2020 y el 28 de febrero del año 2022. Materiales y métodos: Estudio observacional descriptivo. Se realizó una revisión retrospectiva de las historias clínicas electrónicas de los recién nacidos con edades comprendidas entre 0 días de vida hasta 28 días de edad corregida con infección por SARS-CoV-2 que requirieron hospitalización en HUSI en el periodo de tiempo establecido. Se creó una base de datos donde se registraron las variables demográficas, características clínicas, paraclínicos, tratamiento y desenlaces de los pacientes en quienes se confirmó la infección. Resultados: De 222 recién nacidos con sospecha de COVID-19, 32 (14%) tuvieron diagnóstico de infección por SARS-CoV-2 y 2 (6%) requirieron re-hospitalización. Los síntomas respiratorios se presentaron en el 40% de los pacientes, seguido de síntomas gastrointestinales en el 28% de los casos. Se presentaron dos muertes neonatales en pacientes que ingresaron remitidos de otras instituciones, uno por COVID-19 grave y el otro por complicaciones en relación con asfixia perinatal. Discusión: Los casos de recién nacidos con infección por SARS-CoV-2 fueron pocos. En este estudio, la identificación temprana de signos de severidad permitió que se proporcionara un manejo adecuado, disminuyendo la estancia hospitalaria y complicaciones en la mayoría de los pacientes.

Abstract Introduction: The coronavirus disease (COVID-19) pandemic has become a serious public health problem in recent years. The first case in a child was documented in January 2020 in Shenzhen, China, and by the end of the month, more than 20 pediatric cases had already been described in that country. This study aimed to describe the clinical characteristics, treatment, and early outcomes of newborns with SARS-CoV-2 infection hospitalized in the newborn unit of the Hospital Universitario San Ignacio (HUSI) in Bogotá, Colombia, between March 1, 2020, and February 28, 2022. Materials and methods: This was a descriptive observational study. A retrospective review of the electronic medical records of newborns aged between 0 and 28 days of life with SARS-CoV-2 infection who required hospitalization at HUSI in the established period was performed. A database was created where the demographic variables, clinical and paraclinical characteristics, treatment, and outcomes of the patients in whom the infection was confirmed were recorded. Results: A total of 222 newborns were suspected to have COVID-19, of which 32 (14%) were diagnosed with SARS-CoV-2 infection and 2 (6%) required rehospitalization. Respiratory symptoms occurred in 40% of patients, followed by gastrointestinal symptoms in 28%. Two neonatal deaths occurred in patients who were admitted from other institutions: one related to severe COVID-19 and the other due to complications related to perinatal asphyxia. Discussion: Few newborns had SARS-CoV-2 infection. In this study, the early identification of signs of severity allowed adequate management, reducing hospital stay and complications in most patients.

Coinfections between Bordetella spp. and respiratory viruses in children under eighteen: systematic review with metaanalysis

Resumen Introducción: Actualmente, se conoce muy poco sobre las asociaciones entre Bordetella spp. y virus respiratorios en la población infantil, coinfecciones que conllevan a mayor estancia hospitalaria, atención en unidad de cuidados intensivos y gravedad en la sintomatología que pueden llegar a generar mortalidades. El objetivo de esta revisión fue analizar las coinfecciones entre Bordetella spp. y virus respiratorios asociados al impacto en la salud de niños menores de 18 años. Materiales y métodos: Revisión sistemática con metaanálisis. Se llevó a cabo una búsqueda en bases de datos (PubMed, Scopus, Springer, ScienceDirect y Cochrane Library), donde se seleccionaron artículos que cumplan con los criterios de selección. Se evaluó la calidad metodológica de la evidencia científica y se extrajo información de variables de interés. Resultados: Se incluyeron 25 artículos procedentes de diversos continentes. La frecuencia de coinfección fue del 16,5 % en el total de los estudios seleccionados. Se realizó análisis secundario para la presencia de apnea con una frecuencia del 20,13 % en las coinfecciones; esta variable no está presente dentro de la definición de caso del programa IRA viral. Discusión: La apnea debe relacionarse en la vigilancia de IRA viral como diagnóstico diferencial en la presencia de VSR. Es de resaltar la importancia de vigilar simultáneamente estos dos eventos de interés en salud pública en Colombia, explorando la necesidad de un diagnóstico diferencial combinado para apoyar la comprensión y estandarización de tratamientos en menores de 18 años.

Abstract Introduction: Currently, very little is known about the associations between Bordetella spp. and respiratory viruses in the pediatric population, coinfections that lead to longer hospital stays, intensive care unit care, and severity of symptoms that can lead to mortality. The objective of this review was to analyze coinfections between Bordetella spp. and respiratory viruses associated with their impact on the health of children under 18 years of age. Materials and Methods: This study was a systematic review and meta-analysis. A search was carried out in databases (PubMed, Scopus, Springer, ScienceDirect, and Cochrane Library), where articles that met the selection criteria were selected. The methodological quality of the scientific evidence was evaluated and information on the variables of interest was extracted. Results: 25 articles from different continents were included. The frequency of coinfection was 16.5% in all selected studies. Secondary analysis was performed for the presence of apnea with a frequency of 20.13% in coinfections; this variable was not present within the case definition of the viral ARI program. Discussion: Apnea should be considered in the surveillance of viral ARF as a differential diagnosis in the presence of RSV. It is worth highlighting the importance of simultaneously monitoring these two events of public health interest in Colombia and exploring the need for a combined differential diagnosis to support the understanding and standardization of treatments in children under 18 years of age.

Malaria and Leptospirosis Co-infection: Overlapping Tropical Diseases in an Endemic Area. Case Report

Resumen En Colombia, las enfermedades febriles tropicales indiferenciadas son frecuentes y motivo de gran preocupación, siendo la Malaria y la Leptospirosis consideradas de importancia en salud pública nacional. Reportamos un caso clínico de una confección de Malaria-Leptospirosis. Femenina de 21 años, quien consultó inicialmente por un síndrome febril agudo y síntomas generales poco específicos, además de manifestaciones hemorrágicas, con viaje reciente a zona endémica. Diagnóstico inicial de Malaria por P. Vivax, sin mejoría esperada a pesar de inicio de antimaláricos, progresión a dificultad respiratoria, persistencia de anemia y trombocitopenia severa, bajo alta sospecha de hemorragia alveolar, se inicia manejo en contexto de Enfermedad de Weil, serología con IgM por ELISA y MAT positiva para Leptospira, evolución clínica favorable con tratamiento antibiótico. Aunque muy poco frecuente, las infecciones simultáneas son posibles, sus características clínicas compartidas hacen de estas, en nuestra zona, un reto diagnóstico, particularmente en los más comprometidos clínicamente.

Abstract In Colombia, undifferentiated tropical febrile illnesses are common and a matter of great concern, with Malaria and Leptospirosis being considered of national public health importance. We report a clinical case of co-infection with malaria-leptospirosis in a 21- year-old female who initially presented with acute febrile syndrome and nonspecific general symptoms, along with hemorrhagic manifestations, and had recently traveled to an endemic area. The initial diagnosis was Malaria caused by P. Vivax, but there was no expected improvement despite starting antimalarial treatment. The condition progressed to respiratory distress, persistent anemia, and severe thrombocytopenia, with high suspicion of alveolar hemorrhage. Treatment was initiated in the context of Weil's disease, and serological tests using ELISA and MAT showed positive IgM for Leptospira. The patient showed a favorable clinical evolution with antibiotic treatment. Although extremely rare, simultaneous infections are possible, and their shared clinical characteristics make them a diagnostic challenge in our region, particularly in clinically compromised patients.

Multidrug-resistant tuberculosis in adolescents: A case report

Resumen La resistencia a los fármacos antituberculosos es cada vez más frecuente y afecta actualmente a la población general en todo el mundo, comprometiendo tanto a casos nuevos de tuberculosis, como a los previamente tratados, se requieren esquemas de tratamiento específicos con varios medicamentos de segunda línea por un periodo largo de tiempo para lograr la conversión bacteriológica, convirtiéndolo en un desafío para los médicos tratantes por cuanto son medicamentos que generan muchos efectos adversos, lo cual impacta negativamente en la adherencia al tratamiento. A continuación, se presenta el caso de una adolescente a quien se le diagnosticó una tuberculosis multirresistente, el cual se manejó de acuerdo con los lineamientos nacionales con dos medicamentos del grupo A y dos medicamentos del grupo B, (por no disponibilidad de Bedaquilina), comprobando resistencia negativa a los fármacos de segunda línea y estableciendo una adherencia y tolerancia adecuada al tratamiento e importante al seguimiento.

Abstract Resistance to anti-tuberculosis drugs is becoming increasingly frequent and currently affects the general population worldwide, compromising both new cases of tuberculosis and those previously treated, requiring specific treatment schemes with several second-line drugs for a long period of time to achieve bacteriological conversion, making it a challenge for treating physicians as these drugs generate many adverse effects that negatively impact adherence to treatment. The following is the case of an adolescent girl diagnosed with multidrug-resistant tuberculosis, which was managed according to national guidelines with two group A drugs and two group B drugs (due to the unavailability of bedaquiline), proving negative resistance to second-line drugs and establishing adequate adherence and tolerance to treatment and, importantly, to follow-up.

Case Report: Mpox virus infection in a patient immunocompromised by human immunodeficiency virus with atypical evolution.

Resumen Mpox es causada por el virus de la viruela símica, un virus de ADN de la familia Poxviridae y el género Orthopoxvirus. En cuanto a su presentación clínica, se han descrito síntomas como fiebre, linfadenopatía y erupción maculopapular que afecta tejidos mucosos, palmas y plantas de los pies. Sin embargo, se han reportado presentaciones atípicas en pacientes con función inmunológica comprometida. Los hombres que tienen sexo con hombres (HSH) están entre las poblaciones más afectadas, siendo el contacto sexual una de las principales formas de transmisión. Se ha estimado que cerca del 28-51% de los HSH infectados con el virus de la viruela símica tienen una infección asociada por el virus de la inmunodeficiencia humana. En este informe, describimos el caso de un paciente con infección por el virus de la inmunodeficiencia humana que adquirió Mpox y tuvo una presentación y curso clínico atípicos. En conclusión, el brote actual de Mpox ha diferido de brotes anteriores en términos de características clínicas, modo de transmisión y población en riesgo. La inmunosupresión es un factor de riesgo para un curso atípico, con mayor duración y desarrollo de complicaciones que conducen a una estancia hospitalaria más prolongada y mortalidad.

Abstract Mpox is caused by the monkeypox virus, a DNA virus of the Poxviridae family and the Orthopoxvirus genus. As far as its clinical presentation is concerned, symptoms such as fever, lymphadenopathy and maculopapular rash affecting mucosal tissues, palms and soles have been described. However, atypical presentations have been reported in patients with impaired immune functions. Men who have sex with men (MSM) are among the most affected populations and sexual contact is one of the main forms of transmission. It has been estimated that close to 28-51% of MSM infected with monkeypox virus have an associated human immunodeficiency virus infection. In this report, we describe the case of a patient with human immunodeficiency virus infection who acquired the Mpox and had an atypical clinical presentation and course. In conclusion, the current Mpox outbreak has differed from previous outbreaks in terms of clinical characteristics, transmission mode and population at risk. Immunosuppression is a risk factor for an atypical course, with longer duration and development of complications that lead to longer hospital stay and mortality.