Revista Colombiana de Ciencias Pecuarias

¿Técnicos o Intelectuales?: Treinta años pensando el país pecuario

De lector a director

GEPRO: Analizador de Expresión Genética para datos provenientes de microarreglos de DNA

The DNA microarray technology has been widely employed in recent biological research. However, the unprecedented large amount of data produced by the technology has presented inevitable challenges to biological scientists, forcing individual researchers to take extensive training or rely on database specialists for the use of the data. Microsoft Excel® has a number of convenient functions and may be the most widely used spreadsheet package for data storage and manipulation. Therefore, we developed a userfriendly, Excel spreadsheet-based microarray data-managing program. The program, gene expression profiler (GEPRO), is designed to facilitate organizing miocroarray data, performing statistical analysis, and displaying the results. Using GEPRO’s filtering and sorting capabilities, a user can easily identify differentially expressed genes, display the expression profiles of the genes of interest, and present and save the analyzed data in a user-defined way. The versatility and utility of GEPRO should enable bench work researchers to maximize the use of their microarray data. The GEPRO is freely available for noncommercial users at http://www.mc.uky.edu/cls/ko/gepro1.html.

La tecnología de microarreglos de DNA es actualmente empleada de manera amplia en investigación biológica. Sin embargo, el manejo de la enorme cantidad de datos generados por la misma representa un desafió para los investigadores, forzándolos a invertir valioso tiempo en capacitación sobre dicho manejo, o a confiar el uso de la misma a especialistas en bases de datos. El programa Excel® de Microsoft, la hoja de calculo mas ampliamente utilizada a nivel mundial, que cuenta con muchas funciones útiles para almacenamiento y manipulación de datos, fue utilizado por nosotros para desarrollar una aplicación amigable para el manejo de datos generados por microarreglos de DNA. Nuestro programa, llamado “Gene Expression Profiler” (GEPRO), esta diseñado para facilitar la organización de datos de microarreglos, realizar su análisis estadístico, y presentar los resultados. Utilizando la posibilidad de filtrado y ordenamiento de datos que ofrece GEPRO, el usuario puede identificar fácilmente diferentes genes, observar los perfiles de expresión de los genes de interés, así como presentar y guardar los datos de diversas maneras. La versatilidad y utilidad de GEPRO ayuda a los investigadores a maximizar la utilización de sus datos de microarreglos. GEPRO es una aplicación gratuita, disponible para uso no comercial en http://www.mc.uky.edu/cls/ko/gepro1.html.

A Tecnologia dos Mircroarranjos de DNA é muito empregada em pesquisa biológica. Mas o manejo da grande quantidade de dados gerados é um desafio para os pesquisadores, os quais estão sendo forçados a realizar grandes investimentos econômicos e de tempo para sua capacitação ou em confiar em expertos da informática para analisar seus dados. O programa Excel® da Microsoft, amplamente utilizada no mundo foi utilizado para desenvolver uma aplicação amigável para o manejo de dados gerados por Mircroarranjos de DNA. O nosso programa, chamado “Gene Expression Profiler” (GEPRO), está desenhado para facilitar a organização de dados, permite realizar as respectivas análises estatísticas e apresentar os resultados. Utilizando a possibilidade de filtrar e organizar os dados que oferece GEPRO, o usuário pode identificar pares de genes, observarem os perfis da expressão dos genes de interesse, assim como a possibilidade de apresentar e salvar os dados de diferentes formas. A versatilidade e a utilidade do programa, ajuda aos pesquisadores a maximizar a utilização dos dados. GEPRO é uma aplicação gratuita para uso não comercial, disponível em http://www.mc.uky.edu/cls/ko/gepro1.html.

Estimación de la degradabilidad efectiva en el rumen mediante métodos numéricos

La estimación correcta de la degradabilidad ruminal efectiva en el rumen (DE) de las distintas fracciones nutricionales de los alimentos es fundamental para el desarrollo de programas eficientes de alimentación para rumiantes. La propuesta clásica para estimar la degradabilidad efectiva en el rumen de la fracción potencialmente degradable (DEb=bKd/(Kd+Kp)), sin embargo, no es correcta ya que se basa en la presunción de que las constantes de la cinética de la degradabilidad (Kd) y del pasaje ruminal (Kp) representan la velocidad de fermentación y de pasaje ruminal, respectivamente, cuando estas realmente representan la relación constante entre la aceleración y la velocidad de degradación y de pasaje. Se propone, entonces, una nueva propuesta coherente con las bases matemáticas de la cinética de la degradación y el pasaje ruminal de la fracción potencialmente degradable en el rumen (b) que requiere el uso de métodos numéricos para despejar el tiempo “t” de la expresión 1 = e-kd*t + e-kp*t, que al reemplazarlo en la expresión b*e-kd*t, permite calcular la DEb. La estimación de la DEb por este método permite obtener datos confiables y coherentes con las bases matemáticas de la cinética de la degradación y el pasaje ruminal de las fracciones nutricionales.

In order to develop efficient feeding programs for ruminants, it is required to make a correct estimation of the effective ruminal degradability (ED) of the nutritional fractions. The classical calculation of ED (DEb=bKd/(Kd+Kp)) lacks precision, because it erroneously assumes that the kinetic constants Kd and Kp represent fermentation velocity and velocity of passage through the rumen, respectively. In reality, Kd actually represents the constant relationship between acceleration and degradation velocity, while Kp represents the relationship between acceleration and velocity of passage. Considering this information, a new proposal is being presented that takes into account the correct mathematical interpretation of the ruminal degradation and passage kinetics.

A estimação confiável da degradabilidade efetiva no rúmen (DE) das diferentes frações nutricionais dos alimentos é fundamental para o desenvolvimento de programas eficientes de alimentação para ruminantes. A proposta clássica para estimar a degradabilide efetiva no rúmen da fração potencialmente degradável (DEb=bKd/(Kd+Kp)), embora não seja corretjá, já que baseia-se na presunção de que as constantes de cinética de degrabilidade (Kd) e da passagem ruminal (Kp) representam a velocidade de fermentação e a passagem ruminal, respectivamente, quando estas realmente representam a relação constante entre a aceleração e a velocidade de degradação e de passagem. Neste trabalho se apresenta uma nova proposta coerente com as bases matemáticas da cinética da degradação e da passagem ruminal da fração potencialmente degradável no rúmen (b) que necessita o uso de métodos numéricos para despejar o tempo “t” da expressão 1 = e-kd*t + e-kp*t, onde a expressão b*e-kd*t, permite calcular a DEb. A estimação da DEb por este método permite obter dados confiáveis e coerentes com as bases matemáticas da cinética da degradação e a passagem ruminal das frações nutricionais.

Frecuencia de infección por Trypanosoma sp. en búfalos de agua (Bubalus bubalis) en cuatro hatos bufaleros de Barrancabermeja, Colombia

En Colombia la industria bufalera se desarrolla principalmente en áreas tropicales y subtropicales, convirtiéndose en un importante recurso económico, que se ve afectado por enfermedades hemoparasitarias, siendo Trypanosoma sp. uno de los principales agentes causales de grandes pérdidas económicas. Se diseñó un estudio descriptivo transversal con el objetivo de determinar la frecuencia de Trypanosoma sp en búfalos de agua a través de pruebas parasitológicas directas en cuatro hatos bufaleros de Barrancabermeja (Magdalena Medio). Fueron seleccionadas cuatro fincas con una población de 1800 búfalos, donde se evaluaron 209 muestras por medio de extendidos de sangre periférica coloreados con la técnica de Giemsa y con gotas gruesas coloreadas con la técnica de Field. A cada búfalo se le realizó evaluación médico-veterinaria y una encuesta donde se consignaron los datos clínicos y epidemiológicos de cada animal. Mediante análisis estadísticos Ji-cuadrado y modelos de regresión logística se encontró asociación estadística significativa entre positividad a la infección y edad de los búfalos, pero con ausencia de signos y síntomas. Se determinó el nivel de concordancia entre la gota gruesa y el extendido de sangre periférica con el Índice Kappa de Cohen obteniéndose un valor de 0.784, que representa una reproducibilidad sustancial entre ambas pruebas para la detección de Trypanosoma sp. en búfalos.

In Colombia the buffalo industry is developed mainly in tropical and subtropical areas, becoming an important economic resource, that can be affected by haemoparasite caused diseases, being Trypanosoma sp. one of the causal agents of great economic losses. We design a cross-sectional descriptive study with the objective to determine the frequency of Trypanosoma sp. in water buffaloes through direct parasitological tests in four ranches of Barrancabermeja (Middle Magdalena). Four ranches with a population of 1800 buffaloes were selected, where 209 samples were analyzed evaluating it by thin and thick smears stained with the Giemsa and Field techniques respectively. A medical-veterinary examination and a survey were done to each buffalo where the clinical and epidemiological data of each animal was briefed. By means of statistical analysis Ji-square and models of logistic regression significant statistical association between positivity to Trypanosoma sp. and buffaloes age was found, without symptoms and signs of disease. A value of 0.784 of agreement level was obtained between the thin and thick blood smears tests with Cohen’s Kappa index, that it means a substantial reproducibility between both tests to Trypanosoma sp. diagnosis in buffaloes.

Aindústria bufalera na Colômbia tem-se desenvolvido principalmente nas áreas tropicais e subtropicais, convertendo-se num importante fonte econômica. Entretanto, apresenta perdas econômicas causadas pela presencia de doenças de hemoparasitas, principalmente do agente Trypanosoma sp. Foi realizado um estudo descritivo transversal com o objetivo de determinar a freqüência do Trypanosoma sp em búfalos mediante testes parasitológicos direitos em quatro fazendas de Barrancabermeja (Magdalena Médio) com 1800 búfalos. Foram escolhidos 209 animais nos quais foi tomada uma amostra de sangue periférica coloreada com a técnica de Giemsa e com a técnica de Field. Em todos os búfalos foi realizada uma avaliação medica. Foram feitas as analises mediante o teste de Chi-quadrado e modelos de regressão logística. Foram encontradas diferencias estatísticas significativas entre a positividade e a idade dos animais, mas com ausência de signos e sintomas. Foi determinado o nível de concordância entre a gota grossa e o estendido de sangue periférica com o índice de Kappa de Cohoen de d 0.784, que representa uma reproducividade substancial entre as provas para a determinação de Trypanosoma sp em búfalas

Cinética de la eliminación de fention en leche luego de una aplicación tópica en dos razas de ganado lechero

The mammary excretion of fenthion was determined in cross-bred (Bon x Holstein) and pure Holstein cows following a topical (pour-on) application of a commercial formulation. Two groups of five cows each received a single application at the recommended dosage of 10 mg/kg BW on the withers. Milk samples were collected twice a day, from the morning and afternoon milkings during a 5-day period and analyzed for fenthion and total fat contents. A bi-compartmental analysis was used to describe the pharmacokinetic parameters. Overall fenthion milk concentrations increased progressively to reach maximum peaks (Cmax) of 0.4 ppm and 0.2 ppm at about 33 hr post-treatment in cross-bred and pure Holstein cows, respectively. However, since total residues in milk were strongly correlated with total fat content, for any particular day the concentrations attained in the morning milking were lower than those for the afternoon collection. The elimination half-lives (T1/2) for the two cattle breeds were 52.5 and 59.3 hr for cross-bred and Holstein respectively as indicated by milk concentrations. Fenthion concentrations declined to the maximum residue limit of 0.05 ppm set by the OMS FAO at 8.0, and 6.61 days post application, in cross-bred and pure bred Holstein cows respectively. These results suggest that withdrawal time for milk from lactating dairy cows treated with topical fenthion, could be of 8 days approximately.

La excreción mamaria de fention se determinó en vacas productoras de leche cruzadas (Bon x Holstein) y Holstein puras, tras la aplicación tópica de una formulación comercial del compuesto. El producto se aplicó a dos grupos de cinco vacas por raza, a la dosis de 10 mg/Kg de peso vivo. Se colectaron muestras de leche dos veces diarias, en el ordeño de la mañana y de la tarde, por un período de cinco días y se midieron los niveles grasa y fention en leche. Se usó un análisis bicompartimental para describir los parámetros farmacocinéticos. Las concentraciones de fention en leche aumentaron progresivamente hasta alcanzar el pico máximo (Cmax) de 0.4 y 0.2 ppm a las 33 horas postratamiento en las vacas cruzadas y Holstein, respectivamente. Sin embargo, a pesar de que los residuos totales del fention se correlacionaron con el contenido de grasa, las concentraciones observadas en el ordeño de la mañana fueron menores que aquellas observadas en el ordeño de la tarde para las muestras de ese mismo día. Los tiempos medios de eliminación t1/2 fueron de 52,5 y 59.3 horas para el cruce y las vacas holstein puras, respectivamente. Las vacas cruzadas y las vacas Holstein puras alcanzaron el nivel máximo de fention permitido por la OMS-FAO (0.05 ppm) a los 8.0 y a los 6.61 días después de la aplicación, respectivamente. Estos resultados sugieren que el tiempo de retiro de la leche de vacas en lactancia tratadas con fention vía dérmica podría ser 8 días aproximadamente.

A excreção mamaria de Fention foi determinada em vacas produtoras de leite dos grupos genéticos: Holandês e Holandês X BON, depois da aplicação dérmica de uma formulação comercial composta. O produto foi aplicado em cinco vacas de cada grupo genético, a uma doses de 10 mg/Kg do peso vivo. Coletaram-se amostras de leite nas ordenhas da amanha e da tarde, durante cinco dias para medir os teores de gordura e de fenthion em leite. Foi realizada uma análises bicompartimental para descrever os parâmetros farmacocinéticos. As concentrações de fenthion em leite aumentaram progressivamente até alcançar o pico máximo (Cmax) de 0.4 y 0.2 ppm as 33 horas postratamento nas vacas cruzadas y Holandês, respectivamente. Embora, os resíduos totais do Fention correlacionaram-se com os teores de gordura, em um dia em particular, as concentrações observadas na ordenha da amanha foram menores que as observadas na ordenha da tarde. Os tempos médios de eliminação t1/2 foram de 52,5 e 59.3 horas para as vacas cruzadas e Holandesas, respectivamente. As vacas cruzadas e Holandesas alcançaram o nível máximo de fenthion permitido pela OMS-FAO (0.05 ppm) aos 8.0 e aos 6.61 dias após da aplicação, respectivamente. Estes resultados sugerem que o tempo de retiro do leite em vacas tratadas com fenthion via dérmica, poderia ser de 8 dias aproximadamente.

Valoración de la citología para el diagnóstico de tumores en caninos

La citología en el diagnóstico veterinario, sigue siendo un procedimiento controvertido en Colombia, país en el cual no se han realizado hasta donde conocemos, estudios sistemáticos que valoren su confiabilidad como prueba diagnóstica. Por tal motivo, se realizó este estudio con el objetivo de comparar la citopatología con la histopatología para el diagnóstico de tumores cutáneos, subcutáneos y de glándula mamaria en caninos. Para tal efecto, se realizó un estudio observacional analítico entre julio y octubre del 2006; en el que estudiaron 42 biopsias y 35 aspirados de masas cutáneas, subcutáneas y mamarias de caninos que fueron recibidos para consulta en cuatro clínicas veterinarias de la cuidad de Medellín. Las muestras se procesaron por métodos histológicos y citológicos rutinarios y se colorearon con hematoxilina- eosina y con wright-giemsa. La evaluación histológica fue realizada por un patólogo veterinario y las citológicas por dos estudiantes de citohistología en práctica profesional. Como resultados se encontró que la Punción Aspiración con Aguja Fina (PAAF) tiene una sensibilidad para determinar malignidad del 76.47%, una especificidad del 93.33%, unos valores predictivos positivos y negativos de 84.3 y 92.86%, respectivamente; así como, una confiabilidad del 84.38%. Se obtuvo una concordancia del 79% entre los resultados obtenidos por PAAF e histopatología. De lo anterior se concluye, que el diagnóstico citológico fue confiable para determinar malignidad en tumores cutáneos, subcutáneos y mamarios en caninos en las condiciones del Laboratorio de Patología Animal de la Universidad de Antioquia.

Cytology is a controversial diagnostic tool in veterinary medicine. In Colombia there are no studies about its reliability as a diagnostic tool. The porpoise of this study was to compare accuracy of the cytology with respect to histopathology for the diagnosis of mammary, cutaneous and subcutaneous tumors in dogs. We performed an observational analytic study from July to October 2006. In this study 42 biopsies and 35 fine needle aspiration biopsies (FNAB) of canine mammary, cutaneous and subcutaneous tumors were observed. Samples were obtained from four veterinary clinics in Medellin, Colombia. Samples were processed by rutine methods and they were stained with hematoxilin-eosin and Wright-Giemsa stains. Cytology evaluation was performed by a pathologist and the FNAB by cytology students. The FNAB has a high sensibility to determine malignancy (76.47%), a specificity of 93.33%, positive and negative predictive values of 84.38 and 92.86%, respectively. The concordance between the final diagnosis obtained from FNAB and histopathology was 79%. Cytodiagnosis is a reliable tool to determine the malignancy of mammary cutaneous and subcutaneous tumors in dogs in the pathology laboratory of “Universidad de Antioquia”

A citologia no diagnostico veterinário segue sendo um procedimento controvertido na Colômbia, país no qual não se tem realizado estudos sistemáticos que avaliem sua confiabilidade como teste diagnóstico. Por este motivo, foi realizado um estúdio com o propósito de comparar a citologia com a histopatologia para o diagnostico de tumores cutâneos, subcutâneos e da glândula mamaria em cachorros. Para isto foi realizado um estudo observacional analítico de 42 biopsias e 35 aspirados de massas cutâneas, subcutâneas e mamarias de caninos que foram recebidos em consulta em quatro consultórios veterinários de Medellín, Colômbia. As amostras foram processadas por métodos histológicos e citológicos e colorearam-se com hematoxilina - eosina e com wright-giemsa. Foi encontrado que a Punção Aspiração com Agulha Delgada (PAAD) tem sensibilidade para determinar a malignidade de 76.47%, uma especificidade de 93.33%, uns valores preditivos positivos e negativos de 84.3 e 92.86%, respectivamente, com uma confiabilidade de 84.38%. Encontrou-se uma concordância de 79% entre os resultados obtidos pela PAAD e histopatología. Do anterior conclui-se, que o diagnóstico citológico foi confiável para determinar a malignidade em tumores cutâneos, subcutâneos e mamários de caninos em condições de laboratório de Patologia Animal da Universidad de Antioquia.

Asociación de úlcera gástrica y Helicobacter spp en cerdos en Antioquia, Colombia

Los porcinos desarrollan de manera natural y frecuente úlceras gastroesofágicas (UGE) y son colonizados por Helicobacter spp. Dado que en los humanos se demostró la asociación de estos microorganismos con gastritis, úlcera gástrica y adenocarcinoma gástrico, el objetivo de esta investigación fue determinar la asociación entre la úlcera gastroesofágica porcina (UGP) y la colonización por Helicobacter spp en cerdos de Antioquia. Para ello se evaluaron microscópicamente 30 estómagos que presentaron UGE y 30 sin ulceración. El análisis de los resultados se efectuó con un nivel de confiabilidad del 95% mediante la prueba de Chi cuadrado. En este estudio se determinó asociación entre la infección natural con Helicobacter spp. y la presentación de UGP, adicionalmente se discute sobre el potencial zoonótico de estos microorganismos en el departamento de Antioquia.

The pigs develop frequently gastroesophagiculcers (GU) and have been colonized by Helicobacter spp. Asin the human has been communicated the association of these microorganisms with gastritis, gastriculcerand gastric adenocarcinoma, the aim of this investigation was determine the association between the pig gastroesophagic ulcer (GU) and the colonization by Helicobacter spp in Antioquia. We evaluated microscopically 30 stomachs that displayed GU and 30 with outulcer. Analysis of the results was made with alevelo freliability of 95% using the Chi square test. In this study, we show association between the natural infection with Helicobacter spp. and the UG disease, additionally we discuss about the zoonotic potential of these microorganisms in Antioquia.

Os suínos desenvolvem de forma natural e freqüente úlceras gastresofágicas (UGE) e são colonizados por Helicobacter spp. O fato que em humanos têm-se encontrado associação destes microorganismos com gastrite, úlceras gástricas e denocarcinoma gástrico. O objetivo desta pesquisa foi determinar a associação entre a úlcera gastresofágica Porcina (UGP) e a colonização por Helicobacter spp en suínos da Antioquia. Para isso foram avaliados microscopicamente 30 estômagos que apresentaram UGE e 30 sem ulceração. A analises estatística teve um nível de confiabilidade de 95%, mediante o teste Chi quadrado. Neste estudo foi determinada a associação entre a infecção natural com Helicobacter spp. E a presencia de UGP. Adicionalmente neste documento, visualiza-se o potencial de zoonoses destes microorganismos na Antioquia-Colômbia

Histiocitosis sistémica maligna en un canino: Reporte de un caso

La histiocitosis sistémica maligna (HSM) es una enfermedad poco común de perros y gatos, caracterizada por proliferación neoplásica de macrófagos en diferentes órganos y sistemas. La enfermedad proliferativa histiocítica, puede presentar masas nodulares en pulmones, hígado y nódulos linfáticos mediastínicos, hay poco compromiso de la dermis y epidermis. Fue llevado un canino hembra de cinco años de edad, a la clínica veterinaria de la Universidad de los Llanos, con depresión, inapetencia, distensión abdominal, hiperventilación, secreción purulenta por la vulva. A la necropsia se encuentra una masa redondeada, multilobulada, dura, hemorrágica de 6 cm de diámetro ubicada en el mediastino craneal; en la cavidad abdominal, metástasis de la neoplasia a hígado y bazo. En el útero se evidenció una secreción purulenta que comprometía en mayor proporción el cuerno izquierdo. Por histopatología se diagnosticó una histiocitosis sistémica maligna, con compromiso de pulmones, hígado, nódulos linfoides, bazo y piómetra en útero.

The malignant systemic histiocytoses is a disease slightly common of dogs and cats, that has been characterize by the neoplasic proliferation of macrofhages in different organs and systems. The proliferative histiocytic disease can present nodular masses in lungs, liver, and lymphatic mediastines nodules, the dermis and epidermis are not very compromised. To the Veterinary Clinic of the Universidad de los Llanos arrived a female canine of 5 years old with depression, lack of appetite, abdominal distension, hyperventilation, purulent secretion by the vulva. With the necropsy was found a circular, multilobuled, hard, hemorrhagic mass with a diameter of 6 cm located in the cranial mediastine; in the abdominal cavity, metastases of the neoplasm to the liver and spleen. In the uterus was noticed a greater purulent secretion in the left horn. By histopathology the diagnostic was a Malignant Systemic Histiocytoses, the lungs, liver, lymph nodes and arm were affected. In the uterus was diagnosticing a pyometra.

Ahistocitose sistêmica maligna (HSM) é uma doença pouco comum em cachorros e gatos, caracterizada pela proliferação neoplásica de macrófagos em diferentes órgãos e sistemas. A doença proliferativa histiocítica, pode apresentar massas nodulares em pulmões, fígado e nódulos linfáticos mediastínicos e pouco afeta a dermes e epidermes. Uma fêmea de cinco anos de idade foi atendida na Clínica Veterinária da Universidad de los Llanos, com depressão, inapetência, distensão abdominal, hiperventilação, secreção purulenta pela vulva. Na necropsia, a fêmea apresentou uma massa redondeada, multilobulada dura, hemorrágica de 6 cm de diâmetro no mediastino cranial; na cavidade abdominal, metástase da neoplasia no fígado e bazo. No útero evidencio-se uma secreção purulenta, em maior proporção no corno esquerdo. Por histopatología foi diagnosticado uma histocitose sistêmica maligna, com compromisso de pulmões, fígado, nódulos linfóides, bazo y piometra no útero.

Carimagua: La investigación y el desarrollo en ecosistemas de baja fertilidad