Biota colombiana

Editorial

The genus Alchornea (Euphorbiaceae) in Antioquia, Colombia

Resumen Se presenta el estudio taxonómico del género Alchornea para el departamento de Antioquia, Colombia, incluyendo 15 especies, tres de las cuales son nuevos registros para el departamento (Alchornea brittonii, A. bogotensis, A. discolor). Se proporciona la caracterización morfológica para el género, una clave para la determinación de las especies, descripciones detalladas, así como notas taxonómicas y de distribución geográfica.

Abstract A taxonomic study of the genus Alchornea in Antioquia, Colombia, is presented. Fifteen species are included, three of which (Alchornea brittonii, A. bogotensis. and A. discolor) are new records for the department. A morphological characterization, a species identification key, full descriptions, and taxonomic and geographic distribution notes of the species are provided.

Wild edible fruits of Colombia: diversity and use prospects

Abstract Wild fruits have been an integral part of the diet of rural inhabitants in tropical America. In Colombia, information on the use of wild fruits appears scattered in the ethnobotanical literature and herbaria collections, limiting the design of conservation and use strategies. This review aims to synthesize information about the wild fruit species used in Colombia. We reviewed herbarium collections and literature references. We recorded 703 species in 76 families, among which Fabaceae (66 species), Arecaceae (58), and Passifloraceae (44) were the most diverse. The genera with more species were Inga (42), Passiflora (42), and Pouteria (21). Most species are widely distributed in tropical America, and only 45 (6.4 %) are endemic to Colombia. The regions with the largest number of species were the Amazon (388), Andes (144), and Pacific (111). Most of the recorded species, 613 (87.2 %), are exclusively wild, whereas 90 (12.8 %) are wild or cultivated. Wild edible fruits have a high potential for agriculture, novel products and nutritional improvement; however, it is vital to create strategies to revalorize their use.

Resumen Los frutos silvestres han sido una parte integral de la dieta de los habitantes rurales del trópico americano. En Colombia, la información acerca del uso de los frutos silvestres se encuentra dispersa en la literatura etnobotánica y en colecciones de herbario, limitando el diseño de estrategias de conservación y uso. Esta revisión tiene como propósito sintetizar información acerca de los frutos silvestres usados en Colombia. Se revisaron colecciones de herbario y referencias de literatura. Se registraron 703 especies en 76 familias, entre las cuales Fabaceae (66 especies), Arecaceae (58) y Passifloraceae (44) son las más diversas. Los géneros con más especies fueron Inga (42), Passiflora (42) y Pouteria (21). La mayoría de las especies tienen amplia distribución en América tropical, y solo 45 (6.4 %) son endémicas de Colombia. Las regiones con el mayor número de especies son Amazonia (388), Andes (144) y Pacífico (111). La mayoría de especies registradas, 613 (87.2 %), son exclusivamente silvestres, mientras que 90 (12.8 %) son silvestres o cultivadas. Los frutos silvestres tienen un alto potencial para la agricultura, para desarrollar productos novedosos y para mejoramiento nutricional; sin embargo, es necesario crear estrategias para revalorizar su uso.

Butterflies associated with forests in Solano, Caquetá, Colombian Amazon (Lepidoptera: Papilionoidea)

Resumen Hicimos un muestreo de las mariposas de algunos bosques del municipio de Solano, departamento de Caquetá, en la Amazonia colombiana. La recolección de mariposas se llevó a cabo durante cuatro días consecutivos en cuatro localidades de estudio, utilizando trampas con atrayentes y redes de búsqueda activa. Cada localidad contó con 12 puntos de muestreo con distancia de 250 m entre puntos, para un recorrido total de tres kilómetros. Se recolectaron 487 individuos, pertenecientes a 110 especies, 80 géneros, 28 tribus, 17 subfamilias y seis familias. Las familias con mayores abundancias y número de especies fueron Nymphalidae, con 68.2 % (75 spp.), Riodinidae 11.8 % (13 spp.) y Pieridae 10 % (11 spp.). La subfamilia mejor representada fue Satyrinae (N=228), destacando la tribu Morphini (N=65). Se destacan el hallazgo de seis especies de Marpesia, la tercera parte de las especies descritas para el género, y el de Gunayan rubricollis, una especie rara en Colombia. La presente investigación confirma la diversidad de mariposas en bosques amazónicos, donde más del 40 % de las especies son indicadoras de buen estado de conservación de los bosques.

Abstract We sampled the butterfly community in the municipality of Solano, department of Caquetá, in Colombian Amazonia. The collection of butterflies was carried out during four consecutive days at four study locations, using bait traps and active search nets. Each location had 12 sampling points, with a distance of 250 m between points, for a total sampling length of three kilometers. We collected 487 individuals belonging to 110 species, 80 genera, 28 tribes, 17 subfamilies and six families. The families with the highest abundance and number of species were Nymphalidae, with 68.2 % (75 spp.), Riodinidae 11.8 % (13 spp.) and Pieridae 10 % (11 spp.). The best represented subfamily was Satyrinae (N=228), particularly the tribe Morphini (N=65). Remarkable findings include six species of Marpesia, one third of the species described for the genus, and Gunayan rubricollis, a rare species in Colombia. The present research confirms the diversity of butterflies in Amazon forests, where more than 40 % of the species are indicators of the forest’s good state of conservation.

An updated reef fish checklist of the southernmost Caribbean reef system, with comments on the lionfish invasion

Abstract Chocó-Darien is an important biogeographic realm, as it is a terrestrial biodiversity hotspot and the southern limit of the Caribbean reefs. However, to date there are no compiled data on the reef fish assemblage of this region. We provide an updated checklist of marine fishes from the Chocó-Darien reef system (Colombia), with comments on their geographic distribution and conservation status. Peer-reviewed studies, unpublished data and in situ visual censuses were surveyed to compose this checklist. A total of 212 reef fish species across 57 families were compiled, eight of which had no previously published records, one of which (Trachinotus falcatus) is recorded for the first time. The most speciose families were Labridae (n = 21), Gobiidae (n = 18) and Serranidae (n = 17). Fourteen threatened species were recorded, including one critically endangered (Epinephelus striatus) and two endangered (Balistes vetula and Scarus coelestinus). This study contributes to fill the knowledge gaps on the reef fish diversity of the Caribbean southern limit and raises concern on the spread of the lionfish invasion into the Chocó-Darién reef system.

Resumen El Chocó-Darién es una importante área biogeográfica, pues es un hotspot de biodiversidad terrestre y el límite sur de los arrecifes del Caribe. Sin embargo, hasta la fecha no existen datos compilados actualizados sobre las especies de peces de arrecife de esta región. En este trabajo proporcionamos una lista actualizada de peces marinos del sistema arrecifal del Chocó-Darién (Colombia), con comentarios sobre su distribución geográfica y estado de conservación. Para la elaboración de esta lista se consultaron publicaciones, datos no publicados y censos visuales in situ. Se recopilaron 212 especies de peces de arrecife de 57 familias. Ocho de estas especies no tenían registros previos publicados, y una de ellas es registrada por primera vez (Trachinotus falcatus). Las familias con mayor número de especies fueron Labridae (n = 21), Gobiidae (n = 18) y Serranidae (n = 17). Se registraron 14 especies amenazadas, entre ellas una en peligro crítico (Epinephelus striatus) y dos en peligro (Balistes vetula y Scarus coelestinus). Este estudio contribuye a complementar las lagunas de conocimiento sobre la diversidad de los peces de arrecife del límite sur del Caribe y plantea la preocupación de la invasión del pez león en el sistema arrecifal del Chocó-Darién.

Water birds of the lower basin of the Sinú river, Colombian Caribbean

Resumen Estudiamos la avifauna acuática del bajo Sinú, en el Caribe colombiano, entre 2009 y 2016. Se establecieron tres estaciones de muestreo por cada una de las cinco principales unidades de paisaje: playas, manglares, salitrales, humedales salobres y humedales dulceacuícolas. En cada una de las estaciones se evaluaron la abundancia, riqueza y diversidad de aves acuáticas, mediante censos semestrales. Se registraron 107 especies de aves acuáticas, de las cuales 14 corresponden a nuevos registros para el bajo Sinú. Los humedales dulceacuícolas albergaron la mayor riqueza y abundancia de aves acuáticas, mientras que los humedales salobres presentaron la mayor diversidad. De lo siete grupos funcionales de aves acuáticas, las vadeadoras presentaron las mayores concentraciones de individuos. Este estudio ratifica la importancia del bajo Sinú para la conservación de las aves del Caribe colombiano, pues los humedales de esta ecorregión ofrecen áreas de alimentación y de reproducción para cinco especies amenazadas.

Abstract We studied the waterbirds occurring at the lower basin of the Sinú River, in the Colombian Caribbean, from 2009 to 2016. We established three sampling stations in the five main landscape units of the lower Sinú: beaches, mangrove forests, salt flats, brackish marshes and freshwater wetlands. The abundance, richness and diversity of waterbirds were assessed in every station twice yearly. We recorded 107 species of waterbirds, including 14 new species records for that site. Freshwater wetlands held the highest species richness and abundance of waterbirds in the basin, whereas the brackish marshes contained the highest diversity. Wading birds were the functional group with the largest concentrations of individuals. This study confirms the importance of the lower basin of the Sinú River for birds in the Caribbean coast of Colombia, as its wetlands hold feeding and breeding sites for five threatened waterbirds species.

Mammals of the Department of Atlántico, Colombia

Resumen Presentamos el primer listado taxonómico de los mamíferos silvestres del departamento del Atlántico, en la costa Caribe de Colombia. Registramos 92 especies, distribuidas en 11 órdenes, 37 familias y 74 géneros, lo cual representa el 16.5 % de la mastofauna documentada para Colombia. Encontramos tres especies endémicas de Colombia, Cebus versicolor, Saguinus oedipus y Pattonomys semivillosus, 10 especies en alguna categoría nacional de amenaza, 13 especies en alguna categoría global y cuatro categorizadas como Datos Insuficientes. La riqueza de mamíferos es baja, comparada con la de otros departamentos del país, pero podría estar subestimada, debido al bajo esfuerzo de muestreo y la falta de exploración en diversas áreas del departamento.

Abstract We presents the first taxonomic list of wild mammals for the Atlántico department, in the Caribbean coast of Colombia. We recorded 92 species distributed in 11 orders, 37 families, and 74 genera, which represents 16.5 % of the mammal fauna recorded in Colombia. We found three species endemic to Colombia, Cebus versicolor, Saguinus oedipus, and Pattonomys semivillosus, 10 species in some national category of threat, 13 in any global category, and four Data Defficient. The representativeness of mammals is low, compared to other departments in the country, but it might be underestimated, due to low sampling effort and lack of exploration in various areas of the department.

Mammals (Mammalia) of San José del Guaviare, Colombia

Resumen Presentamos los resultados obtenidos durante cuatro años de muestreo de mamíferos en diferentes coberturas vegetales del municipio de San José del Guaviare, Guaviare, Colombia. Entre los años 2012 y 2017 recolectamos información de la diversidad de mamíferos a través del muestreo con redes de niebla, trampas para pequeños y medianos mamíferos, cámaras trampa, observaciones directas, entrevistas e información secundaria. Reportamos 121 especies de mamíferos nativos para el municipio. Registramos una completitud del muestreo de 64 % para murciélagos, 60 % para pequeños mamíferos no voladores y de 100 % para medianos y grandes mamíferos. Destacamos dos novedades geográficas para los marsupiales Marmosa waterhousei y Glironia venusta, y seis novedades en los murciélagos Lonchorhina marinkellei, Phyllostomus latifolius, Glyphonycteris sylvestris, Glyphonycteris daviesi, Glossophaga commissarisi y Myotis keaysi. La riqueza encontrada es comparable con otros inventarios a largo plazo de mamíferos neotropicales, y presenta la mayor diversidad de especies de murciélagos y primates reportados en Colombia. Sin embargo, es necesario seguir realizando muestreos intensivos, ya que la riqueza de grupos como pequeños mamíferos no voladores y murciélagos está aún subestimada.

Abstract We present the results obtained during four years of sampling of mammals in different plant covers of the municipality of San José del Guaviare, Guaviare, Colombia. Between 2012 and 2017 we collected information about diversity of mammals, through capture with mist nets, traps for small and medium mammals, camera traps, direct observations, interviews, and secondary information. We report 121 species of mammals for the municipality. We recorded sampling completeness of 64 % for bats, 60 % for small non-flying mammals, and 100 % for medium and large mammals. We highlight geographical novelties for the marsupials Marmosa waterhousei, Glironia venusta and for the bats Lonchorhina marinkellei, Phyllostomus latifolius, Glyphonycteris sylvestris, Glyphonycteris daviesi, Glossophaga commissarisi and Myotis keaysi. The richness found in this study is comparable with other long-term neotropical inventories and the area has the largest number of bat and primate species reported for any site in Colombia. However, it is necessary to continue with the intensive sampling, because the richness of small non-volant mammals and bats are still underestimated.

New records of pigmentary abnormalities in two species of birds in Cali, Colombia

Abstract We report two bird species with pigment anomalies, which were seen in Cali, Colombia in 2020. The individuals were, a female Shiny Cowbird (Molothrus bonariensis) with partial leucism, a female Ruddy Ground-Dove (Columbia talpacoti) with partial leucism and a young nestling of the same species, with albinism. The records reported here are the first of partial leucism and albinism for Columbia talpacoti and partial leucism for Molothrus bonariensis in Colombia.

Resumen Reportamos dos especies de aves con anomalías en la pigmentación, que se observaron en Cali, Colombia, en 2020. Los individuos eran una hembra de chamón parásito (Molothrus bonariensis) con leucismo parcial, una hembra de tortolita común (Columbia talpacoti) con leucismo parcial y un polluelo de la misma especie, con albinismo. Estos registros son los primeros de leucismo parcial y albinismo para Columbia talpacoti y de leucismo parcial para Molothrus bonariensis en Colombia.

New records and natural history observations of the brown hairy dwarf porcupine Coendou vestitus (Rodentia: Erethizontidae)

Resumen El puercoespín pardo, Coendou vestitus, se encuentra entre los roedores endémicos más amenazados de Colombia, con presencia corroborada en pocas localidades de la cordillera Oriental, en los departamentos de Boyacá y Cundinamarca. Presentamos registros recientes para tres localidades y observaciones de historia natural, como horarios de actividad y el uso de la cola a manera de soporte durante el desplazamiento. Como parte del conocimiento local se ha identificado el uso de sus púas como defensa ante animales domésticos y el consumo de cañas de chusque (Chusquea sp.), al igual que el uso de las espinas por parte de pobladores de las zonas de registro, relacionado con sus creencias. Nuestros registros, amplían a diez el número de localidades para el flanco occidental de la cordillera Oriental, en la ecorregión Selvas Montanas del Valle del Magdalena. Los registros fueron obtenidos durante el día y la noche, lo que hace necesario estudiar los patrones de actividad de los Coendou, generalizados como nocturnos, y obtener nuevos datos sobre la historia natural de esta especie.

Abstract The brown hairy dwarf porcupine Coendou vestitus is among the most threatened endemic rodent species, with a corroborated presence in few localities in the Eastern Cordillera; departments of Boyacá and Cundinamarca. We present new records for three localities and natural history observations such as the use of the tail as a support during locomotion and activity hours. As part of local knowledge, the use of their quills as defense against domestic animals and the consumption of chusque (Chusquea sp.) has been identified, as well as the use of the quills by local people in the localities of the records related to their beliefs. Our records extend to 10 the number of localities for the western flank of the Eastern Cordillera, in the Magdalena Valley Montane Forests ecoregion. The records were obtained during the day and at night, so it is necessary to study the activity patterns within Coendou, generalized as nocturnal, and obtain new data on the natural history of this species.

Living Collection of the Botanical Garden of Bogotá, Colombia

Resumen El Jardín Botánico de Bogotá José Celestino Mutis tiene una amplia colección de plantas vivas, con la que se promueve la investigación y conservación ex situ de la flora, con énfasis en la región andina, y que es visitada continuamente por la ciudadanía. En años recientes, se fortaleció la sistematización, georreferenciación, enriquecimiento y señalización de los individuos en las diferentes zonas del Jardín. En especial, el desarrollo de bases de datos y la aplicación de tecnologías de la información han permitido la actualización del inventario. La base de datos de la colección abarca 19 546 accesiones georreferenciadas, que corresponden a 184 familias, 723 géneros y 1185 especies de plantas, entre las que están 89 en categorías de amenaza a nivel nacional. Se sugiere continuar con la documentación de nuevos individuos, y aumentar el nivel de determinación taxonómica. Además, seguir con el mantenimiento y mejora de las bases de datos de la Colección Viva y avanzar en su interoperabilidad con otras bases, como las colecciones de referencia, y evaluar estrategias de publicación.

Abstract The José Celestino Mutis Botanical Garden of Bogotá has a wide collection of living plants, with which ex situ research and conservation of flora is promoted, with emphasis on the Andean region, and which is continuously visited by citizens. In recent years, the systematization, georeferencing, enrichment and signaling of individuals in the different areas of the Garden have been strengthened. In particular, the development of databases and the application of information technologies have made it possible to update the inventory. The collection database includes 19 546 georeferenced accessions, corresponding to 184 families, 723 genera and 1185 plant species, among which 89 are in threat categories at the national level. The documentation of new individuals continues, and the level of taxonomic determination increases. In addition, continue with the maintenance and improvement of the living collection databases and advance their interoperability with other databases, such as reference collections, and evaluate publication strategies.

Non-avian reptiles (Reptilia) collection, Museo de Historia Natural of the Universidad de Caldas, Colombia

Resumen El conocimiento de los reptiles en Colombia es aún incompleto, aun cuando el país alberga una alta diversidad de este grupo. En los últimos años, las colecciones regionales han contribuido a llenar vacíos de información sobre la biogeografía, la variación intra e interespecífica y la sistemática de diversos grupos. Presentamos aquí la información de 613 registros depositados en la Colección de Reptiles del Museo de Historia Natural de la Universidad de Caldas. La mayoría de los registros (527) proceden del departamento de Caldas, pero se cuenta con registros de 15 departamentos más. El orden más representativo es Squamata (603 registros). La colección alberga 108 especímenes que han sido referenciados en 20 publicaciones nacionales y extranjeras.

Abstract The knowledge of reptiles in Colombia is still incomplete, although the country harbors a high diversity of this group. In recent years, regional collections have helped to fill information gaps on the biogeography, intra- and interspecific variation, and systematics of several groups. Here we present the information of 613 voucher records deposited in the Reptile Collection of the Museo de Historia Natural of the Universidad de Caldas. Most of the records (527) come from the Department of Caldas, but there are records for 15 additional departments. The best represented order is Squamata (603 records). The collection houses 108 specimens that have been referenced in 20 national and foreign publications.

Reptiles and birds of Distrito de Manejo Integrado Cabo Manglares Bajo Mira-Frontera, Colombian Pacific

Resumen Evaluamos la diversidad de reptiles y aves en el Distrito de Manejo Integrado de Cabo Manglares Bajo Mira-Frontera, en el departamento de Nariño, Colombia, mediante muestreos hechos en noviembre de 2018. Para reptiles se realizaron búsquedas libres delimitadas por tiempo; para aves, se realizaron recorridos libres y puntos de observación. Se obtuvieron 25 registros de reptiles pertenecientes a tres órdenes, 17 familias, 23 géneros y 24 especies. De aves se registraron 179 individuos pertenecientes a 16 órdenes, 40 familias, 106 géneros y 119 especies. Para reptiles se destacan los registros de las tortugas Lepidochelys olivacea, categorizada como Vulnerable, y Chelonia mydas, En Peligro, y las especies Caiman crocodilus y Boa constrictor, incluidas en el apéndice II de CITES. Para las aves se destacan los registros de 31 especies migratorias, y tres especies Casi Amenazadas (Ramphastos ambiguus, Campephilus gayaquilensis, Capito squamatus).

Abstract We evaluated the diversity of reptiles and birds in the Distrito de Manejo Integrado de Cabo Manglares Bajo Mira-Frontera, department of Nariño, Colombia, through samplings carried out in November 2018. We carried out time-constrained searches for reptiles, and free route and observation points for birds. We obtained 25 records of reptiles, belonging to three orders, 17 families, 23 genera and 24 species. For birds, we recorded 179 individuals, belonging to 16 orders, 40 families, 106 genera and 119 species. The records of the turtles Lepidochelys olivacea, categorized as Vulnerable, and Chelonia mydas, Endangered, stand out for reptiles, as well as the species Caiman crocodilus and Boa constrictor, included in Appendix II of CITES. The records of 31 migratory species stand out for birds, as well as three Near Threatened species (Ramphastos ambiguus, Campephilus gayaquilensis, Capito squamatus).