Actualidades Biológicas

Revista Actualidades Biológicas: 100 editions of scientific communication

La revista Actualidades Biológicas (RAB; ISSN 0304-3584), órgano de comunicación científica del Instituto de Biología, Facultad de Ciencias Exactas y Naturales de la Universidad de Antioquia (UdeA; Medellín), Colombia, en sus 36 años (72 semestres) de actividad se ha especializado en la publicación de estudios o trabajos resultado de la investigación en ciencias biológicas tanto en Colombia como en otros países iberoamericanos. Durante su existencia se pueden distinguir claramente dos períodos: Período I, de junio de 1972 [RAB, 1 (1)] a junio de 1993 [RAB, 19 (67); 42 semestres]; y Período II, de enero de 1998 [RAB, 20 (68)] a diciembre de 2013 [RAB, 35 (99); 30 semestres]. En estos 36 años (72 semestres), la RAB ha publicado 548 artículos [Períodos: I: 262 (47,81%); II: 286 (52,19%)]. Temáticamente, los 286 artículos (19,066 artículos/año; 9,533 artículos/ edición o semestre) publicados en el Período II, han sido categorizados en 42 temáticas biológicas. Geográficamente, los 286 artículos se realizaron o proceden de 13 países. Institucionalmente, de los 286 artículos publicados en el Período II, 95 artículos (33,216%) han sido realizados solamente por investigadores de la UdeA; 48 artículos (16,783%) por investigadores de la UdeA e investigadores de otras instituciones; 143 artículos (50%) por investigadores externos a la UdeA. Los resultados muestran que Actualidades Biológicas a través de su misión de comunicación científica busca la amplitud o diversidad temática y geográfica al igual que la exogamia institucional como lo exigen los requerimientos de las bases o índices bibliográficos informáticos actuales en la red informática mundial digital (WEB).

Actualidades Biológicas (RAB; ISSN 0304-3584) is the scientific journal of the Instituto de Biología, Facultad de Ciencias Exactas y Naturales de la Universidad de Antioquia (UdeA, Medellín), Colombia. In its 36-years (72 semesters) of activity, it has specialized in the publication of studies resulting from biological science research in Colombia and other Ibero-American countries. During its history, two periods may be clearly distinguished: Period I, June 1972 [RAB, 1 (1)] to June 1993 [RAB, 19 (67); 42 semesters); Period II, January 1998 [RAB, 20 (68)] to December 2013 [RAB, 35 (99); 30 semesters). During these 36 years (72 semesters), RAB has published 548 papers [Periods: I: 262 (47.81%); II: 286 (52.19%)]. Thematically, the 286 articles (19.066 articles/year, 9.533 articles/issue or semester) published in Period II, have been categorized into 42 biological topics. Geographically, the 286 articles have been conducted or submitted from 13 countries. Institutionally, of the 286 articles published in Period II: 95 articles (33.216%) were produced solely by researchers from the UdeA; 48 articles (16.783%) were produced by researchers from the UdeA and other institutions; 143 articles (50%) were produced by researches with no affiliation to the UdeA. The results show that Actualidades Biológicas, through its mission of scientific communication, seeks a wide thematic and geographic diversity, and the institutional exogamy that is required currently by the bibliographic databases or indices in scientific WEB pages.

Viability of Basidiomycete fungal strains under different conservation methods: cryopreservation vs. freeze-drying processes

Four basidiomycete fungi, Agaricus blazei Murrill (Agaricomycetideae), Ganoderma lucidum (W.Curt.: Fr.) P. Karst., Grifola frondosa (Dicks.: Fr.) S.F. Gray (Higher Basidiomycetes), and Pleurotus pulmonarius (Fr.) Quél. (Agaricomycetideae) were evaluated using three conservation methods for 12 months, recording their viability in order to establish the best conservation method. Growth kinetics, biomass, and polysaccharide production were studied. The conservation methods implemented included: distilled water at 24 °C; sawdust and rice bran with 10% glycerol at -20 °C; sawdust and rice bran with 10% glycerol at -80 °C; and freeze-drying of biomass with trehalose or skimmed milk. After conducting the analysis of the results after 12 months of conservation, we determined that the distilled water treatment at 24 °C was the best conservation method with the highest percentage of recoverability, at 83.3% during the 12th month, followed by the cryoconservation treatment at 80 °C, where 75% were recovered with no negative effects on biomass and polysaccharide production. The -20 °C and freeze-drying treatments were not effective; with cryoconservation at -20 °C treatment, strain recovery only occurred during the first month and with freeze-drying it was not possible to recover any strains during the entire 12-month period evaluated.

Cuatro hongos basidiomycetes, Agaricus blazei Murrill (Agaricomycetideae), Ganoderma lucidum (W.Curt.: Fr.) P. Karst. y Grifola frondosa (Dicks.: Fr.) S.F. Gray (Higher Basidiomycetes), y Pleurotus pulmonarius (Fr.) Quél. (Agaricomycetideae) fueron evaluados bajo tres métodos de conservación durante 12 meses, observando su viabilidad con el fin de establecer el mejor método de conservación. La cinética de crecimiento, producción de biomasa y polisacáridos fueron estudiados. Los métodos de conservación implementados incluyeron: agua destilada a 24 °C; aserrín y salvado de arroz con glicerol 10% a -20 °C; aserrín y salvado de arroz con glicerol 10% a -80 °C y; liofilización de biomasa con trehalosa o leche desnatada. Luego de realizar el análisis de los resultados de 12 meses de conservación, se determinó que el tratamiento de agua destilada a 24 °C fue el mejor método de conservación con el porcentaje de recuperabilidad más alto un 83,3% en el mes 12, seguido por el tratamiento de crioconservación a - 80 °C donde se recuperó el 75%, sin afectar negativamente la producción de biomasa y polisacáridos. El tratamiento a -20 °C y la liofilización no fueron efectivos; con la crioconservación a -20 °C solo se recuperaron cepas en el primer mes y con la liofilización no fue posible recuperar cepas en el período de 12 meses evaluado.

**Antagonism of Purpureocillium sp. (UdeA0106 strain) with fungi of flowers cultures**

Estudios desarrollados en el grupo BIOMA de la Universidad de Antioquia, mostraron como el hongo Purpureocillium sp. (cepa UdeA0106) puede biocontrolar una plaga conocida como sínfilos (subfilo Myriapoda: clase Symphyla). Este trabajo buscó identificar géneros de hongos anamórficos, aislados de diferentes sustratos (sínfilos y suelos) para determinar la capacidad antagónica de estos, así como de cepas de una colección de hongos biocontroladores sobre Purpureocillium sp. (cepa UdeA0106). A partir de sínfilos se registraron 9 cepas distribuidas en 3 géneros, y en suelo, 17 cepas correspondientes a 10 géneros. Las pruebas de antagonismo consistieron en una prueba in vitro empleando la técnica de cultivo dual en cajas de Petri con agar sabouraud dextrosa (SDA) utilizando 16 cepas: 12 provenientes de los aislamientos y 4 del cepario del grupo BIOMA. Las variables evaluadas fueron el radio de crecimiento en los enfrentamientos y el porcentaje de inhibición del crecimiento radial (PICR) a los 7 y 14 días. El análisis se realizó con un modelo mixto lineal generalizado mediante Proc GLIMMIX SAS® de manera independiente. El hongo Purpureocillium sp. (cepa UdeA0106) fue inhibido por Volutella sp. (Vo.UdeA0109), Paecilomyces sp. aislado 2 (Pa.UdeA0109) y Peyronella sp. (Pe.UdeA0108) (p < 0,001), mientras que el resultado no fue estadísticamente significativo con las cepas Beauveria sp. (Be.UdeA0109), Dendrodochium sp. (De.UdeA0109), Myrothecium sp. (Mi.UdeA0109), Paecilomyces sp. aislado 1 (Pa.UdeA0309), Paecilomyces sp., aislado 3 (Pa.UdeA0209), Lecanicillium sp. (Le.UdeA0109) y Purpureocillium sp. (Hy.UdeA0109). El análisis muestra que pueden presentarse interacciones entre cepas de hongos con resultados no deseados a la hora de realizar actividades de control.

Studies developed in the BIOMA research group of the Universidad de Antioquia showed how the fungus Purpureocillium sp. (strain UdeA0106) may biocontrol a plague known as symphylans (subphylum Myriapoda: class Symphyla). The goal of this study was to identify fungal genera isolated from different substrates (symphylans and soils) and determine their antagonistic capacity, as well a collection of biocontrol strains, over Purpureocillium sp. (strain UdeA0106). Nine fungal strains were isolated from symphylans samples, belonging to 3 genera, and 17 strains were isolated from soil samples, belonging to 10 genera. The antagonism tests consisted of an in vitro test using the dual culture technique in Petri dishes using a sabouraud dextrosa agar (SDA) culture médium, which was conducted on 16 strains: 12 obtained from the isolates and 4 from the collection of the BIOMA research group. The variables evaluated were the growth radius in the confrontations and the percentage of radial growth inhibition (PICR) at 7 and 14 days. Data were analyzed using a generalized linear mixed model using the SAS® Proc GLIMMIX procedure in an independent manner. The fungus Purpureocillium sp. (strain UdeA0106) was inhibited by Volutella sp. (Vo.UdeA0109), Paecilomyces sp. Isolate 2 (Pa.UdeA0109) and Peyronella sp. (Pe.UdeA0108) (p <0,001), while the results of the strains Beauveria sp. (Be.UdeA0109) Dendrodochium sp. (De.UdeA0109), Myrothecium sp. (Mi.UdeA0109), Paecilomyces sp. isolated 1 (Pa.UdeA0309), Paecilomyces sp. isolated 3 (Pa.UdeA0209), Lecanicillium sp. (Le.UdeA0109), and Purpureocillium sp. (Hy.UdeA0109) were not significant. The analyses showed that interactions with undesirable results may occur between fungal strains when conducting control activities.

Spatio-temporal variation of the larvae of three species of migratory fish in the stream bed of the Magdalena river (Colombia), during the 2006-2007 hydrological cycle

En la cuenca media del río Magdalena (Colombia) se tomaron muestras semanales durante el ciclo hidrológico 2006- 2007 para evaluar la variación espacio-temporal de las larvas de tres especies de peces migratorios (Prochilodus magdalenae Steindachner 1879, Pimelodus spp. y Pseudoplatystoma magdaleniatum Buitrago-Suarez y Burr 2007). Para este análisis se consideró la abundancia y la densidad de individuos en cada una de las muestras tomadas en el canal principal del río Magdalena a la altura de Puerto Berrío (Antioquia). Se capturó un total 490 individuos, de los cuales la mayor abundancia la obtuvo Pimelodus spp. (74,7%), seguido de P. magdaleniatum (13,7%) y P. magdalenae (11,6%). Se encontró que la abundancia y la densidad de las larvas entre los sitios muestreados fueron homogéneas y sólo se encontraron diferencias significativas entre los periodos hidrológicos asociadas a la interacción de factores físicos como el aumento en el nivel de agua.

In the middle Magdalena river drainage (Colombia) samples were taken weekly during the 2006-2007 hydrological cycle to assess the spatio-temporal variation of the larvae of three species of migratory fish (Prochilodus magdalenae Steindachner 1879, Pimelodus spp. y Pseudoplatystoma magdaleniatum Buitrago-Suarez y Burr 2007). For this analysis we considered the abundance and density of individuals in each of the samples taken in the main channel of the Magdalena River at Puerto Berrio (Antioquia). A total of 490 individuals were captured, with Pimelodus spp. exhibiting the greatest abundance (74.7%), followed by P. magdaleniatum (13.7%), and P. magdalenae (11.6%). We found that the abundance and density of larvae among sites were homogeneous and significant differences were only encountered between hydrological periods associated with the interaction of physical factors such as an increase in the water level.

**Length-mass relationships in the aquatic invertebrate genera Helobdella (Hirudinea: Glossiphoniidae) and Asellus (Crustacea: Asellidae) of an Andean wetland of Colombia**

Existen dificultades para determinar el peso de los macroinvertebrados y conocer así su importancia energética dentro de un ecosistema acuático. Por lo tanto, el objetivo de este estudio fue hallar relaciones matemáticas entre la longitud y la biomasa en dos géneros de invertebrados, representativos en el humedal Jaboque (Engativá) Bogotá D. C., Colombia, que faciliten hallar el peso de los individuos. Para ello, se realizaron cuatro muestreos desde abril de 2009 a enero de 2010. Se obtuvieron ecuaciones para estimar el peso seco a partir de medidas de la longitud total del cuerpo, para los géneros Helobdella y Asellus. Las relaciones halladas entre longitud total y peso seco fueron significativas y explicaron al menos el 69% de la varianza, expresada en los coeficientes de correlación (r² = 0,69 y 0,85). Estos modelos permitirán calcular la biomasa para determinar el crecimiento y la producción secundaria de estos taxones en posteriores estudios de laboratorio o de campo. También podrían ayudar a conocer la importancia de estos organismos en el flujo de energía en los ecosistemas acuáticos, principalmente en los humedales andinos urbanos, donde son muy abundantes.

A major difficulty in the study of macroinvertebrates is the determination of their weight as a measure of the energetic importance of these organisms in an aquatic ecosystem. Therefore, the goal of this study was to find mathematical relationships between the length and biomass of two representative genera of aquatic invertebrates in the Jaboque (Engativá) wetland located in Bogotá, Colombia, to facilitate estimation of the mass of individuals. Four surveys were conducted from April 2009 to January 2010. Equations were derived to estimate dry weight from measurements of total body length for the genera Asellus and Helobdella. The length-mass relationships obtained were significant and explained at least 69% of the variance, expressed as the coefficients of correlation (r² = 0.69 and 0.85). These models will allow for the calculation of biomass, and thereby help determine growth and secondary production of these taxa in subsequent laboratory or field studies. In addition, these equations will help to understand the importance of these organisms to energy flow through consumer pathways in aquatic ecosystems, particularly in urban Andean wetlands, where these organisms are very abundant.

**Edge effect on blue crab population Cardisoma guanhumi (Decapoda: Gecarcinidae) in the mangrove of El Uno Bay, Uraba Gulf (Colombia): an approximation to the folk catchery**

Los impactos que tiene la eliminación de los manglares sobre las comunidades de macroinvertebrados bénticos son inciertos y poco estudiados en Colombia, particularmente en la región Caribe. Este trabajo estudió el efecto de la conversión del manglar a potrero sobre la población del cangrejo azul Cardisoma guanhumi (Decapoda: Gecarcinidae) en el manglar de la bahía El Uno, golfo de Urabá (Colombia). De marzo a abril de 2012, se llevó a cabo un muestreo diario de especímenes en tres coberturas de vegetación diferentes: en el interior del manglar, en el potrero y en el borde (borde antropogénico ocasionado por la deforestación del manglar). Se comparó la distribución, abundancia, peso y tamaño corporal de especímenes de C. guanhumi y la abundancia, diámetro y bioturbación de las madrigueras. Durante Semana Santa se realizaron visitas y entrevistas a los recolectores de cangrejo azul. Se encontró un número de individuos en el interior del manglar (140) mayor que en el potrero (105) y que en el borde (35), e igualmente fue superior el peso corporal y tamaño del cefalotórax en el manglar que en las otras coberturas, las cuales no presentaron diferencias significativas entre sí. En cuanto a las madrigueras no hubo diferencias en su número y sedimentos expulsados (bioturbación) en las distintas coberturas y tampoco hubo una correlación significativa entre el diámetro de la madriguera y la bioturbación. La presión antrópica sobre la población de cangrejos durante el muestreo fue alta, debido a la temporada de caza. En conclusión, se demostró que hay un efecto borde sobre la población de C. guanhumi inducido por la conversión del bosque de manglar a potrero.

The potential impacts of mangrove clearing on communities of benthic macroinvertebrates are uncertain and poorly studied in Colombia, particularly in the Caribbean region. This study investigated the effect of mangrove conversion to pasture on the population of blue crab Cardisoma guanhumi (Decapoda: Gecarcinidae) in the El Uno bay mangrove, Uraba Gulf (Colombia). From March to April 2012, we conducted daily sampling of specimens in three different vegetational covers: mangrove interior, pasture and mangrove-pasture edge (an anthropogenic edge produced by mangrove deforestation). We compared the distribution, abundance, weight and body size of C. guanhumi specimens, and the abundance, diameter, and bioturbation of their burrows. Visits and interviews with folk crab harvesters were conducted during Easter Week. We found a higher number of individuals in the mangrove interior (140), compared with the pasture (105) and the edge (35) sites, with individuals from the mangrove interior exhibiting greater weight and size than those in pasture and edge, with no differences documented between the latter two. We found no differences in the number of burrows or amount of removed sediment (bioturbation) among the different cover types, and there was no significant relationship between burrow diameter and bioturbation. We observed a high pressure on this crab population due to folk harvest during the sampling period. In conclusion, we demonstrated the occurrence of an edge effect on the C. guanhumi population promoted by mangrove conversion to pasture.

**On the availability of the name Cuniculus hernandezi Castro, López, and Becerra, 2010 (Rodentia: Cuniculidae)**

En el presente trabajo se argumentan las razones por las cuales el binomio Cuniculus hernandezi Castro, López y Becerra, 2010, no constituye un nombre disponible de acuerdo a la reglamentación del vigente Código Internacional de Nomenclatura Zoológica (ICZN). Entre estas razones se encuentran la carencia de una descripción precisa y la no asignación de un ejemplar tipo. Adicionalmente, resaltamos problemas en el diseño de la investigación en la cual el binomio fue descrito, que afectan las conclusiones acerca de una distinción taxonómica entre las poblaciones de las cordilleras Oriental y Central de Colombia.

In this article we discuss the reasons why the binomen Cuniculus hernandezi Castro, López y Becerra, 2010, is not an available name according to the rules of the current International Code of Zoological Nomenclature (ICZN). Among these reasons are the lack of a precise description of the taxon and the failure to identify a type specimen. In addition, we highlight problems in the research design of the description of the binomen that affect the conclusions regarding the taxonomic distinctiveness between the populations of the Oriental and Central Cordilleras of Colombia.

**Effect of arbustive mycorrhizal associations isolated from a desert environment on the growth of the bean Phaseolus vulgaris under water deficit**

Los hongos micorrícicos arbusculares (HMA) aumentan la capacidad de las plantas para resistir o tolerar condiciones estresantes como las ocasionadas por la deficiencia de nutrientes, el ataque de patógenos, la presencia de contaminantes químicos y el déficit hídrico. Sin embargo, estos hongos tienen diferentes efectos sobre las plantas. Estos efectos, son regulados por la planta, las condiciones ambientales y el hongo, de tal manera, que aunque no existe especificidad entre los simbiontes, no todas las interacciones micorrícicas terminan siendo mutualistas, así, la búsqueda de hongos micorrícicos arbusculares infectivos y efectivos es primordial para una simbiosis benéfica. En este trabajo se seleccionaron cinco sitios de muestreo ubicados en la Alta Guajira colombiana, en los municipios de Riohacha y Maicao, considerando la comunidad de especies vegetales y las características físicas del suelo. Los hongos se multiplicaron en suelo estéril y una mezcla de especies vegetales (Phaseolus vulgaris, Calendula officinalis, Lolium perenne y Phaseolus vulgaris) usadas como plantas trampa. Después de 10 semanas de multiplicación se seleccionaron dos gremios en función del contenido de esporas. Se evaluaron 6 tratamientos con 7 repeticiones por tratamiento: dos gremios de HMA (G 3 y G 4) y un control sin hongo (C) y bajo dos condiciones de humedad: sin agobio hídrico (SAH) y con agobio hídrico (AH). Se evaluó el efecto de los gremios y la condición de humedad sobre la altura de la planta, área foliar, número de hojas, peso seco radical y diámetro del tallo de la planta de frijol (Phaseolus vulgaris) y el porcentaje de colonización micorrícica (hifas, vesículas y arbúsculos). Cuando las plantas se mantuvieron sin estrés hídrico el gremio que mejores resultados tuvo fue G 3 y para las plantas bajo agobio hídrico el mejor gremio fue G 4. Los hongos micorrícicos nativos de clima desértico pueden ser una alternativa efectiva para usarse en cultivos expuestos a condiciones de sequía.

Arbustive mycorrhizal fungi (HMA) increase the ability of plants to resist or tolerate stressful conditions such as those caused by nutrient deficiency, attack by pathogens, chemical contaminants, and water déficit. However, these fungi have different effects on plants that are regulated by the plant, the fungus and environmental conditions, so that although there is no specificity between symbionts, not all mycorrhizal interactions end up being mutualistic, so the search for effective arbuscular mycorrhizal fungi is essential to insure a beneficial symbiosis. In this study, we selected five sampling sites located in the upper Guajira of Colombian in the municipalities of Riohacha and Maicao, considering the plant community and physical characteristics of the soils. The fungi were multiplied in sterile soil and a mixture of plant species (Phaseolus vulgaris, Calendula officinalis, Lolium perenne y Phaseolus vulgaris) were used as plant traps. After 10 weeks of multiplication, two guilds were selected based on the content of propagules. We evaluated 6 treatments with 7 replicates per treatment: two guilds of HMA (G 3 and G 4) and a control without fungus (C) and two moisture conditions [water overwhelmed (AH) and without water burden (SAH)]. The effects of the guilds and the moisture condition on plant height, leaf area, leaf number, root dry weight, stem diameter of bean plants (Phaseolus vulgaris) and the percentage of mycorrhizal colonization (hyphae, vesicles, and arbuscules) were evaluated. When plants were maintained without hydric stress, the best guild was G 3 and for plants under hydric stress the best guild was G 4. Mycorrhizal fungi native to desert climates may be effective alternatives for use with crops exposed to drought conditions.

Records of centipedes (Chilopoda) and millipedes (Diplopoda) species from Sinaloa, Mexico

Se proporciona un listado de las especies de ciempiés (Chilopoda) y milpiés (Diplopoda) registradas en Sinaloa, México. Actualmente, se sabe que siete especies y una subespecie de ciempiés y una especie de milpiés se distribuyen en este estado mexicano. Dos especies y una subespecie de ciempiés son endémicas del país: Aztekophilus (Thylakiophilus) mexicanus, Scolopendra octodentata y S. viridis genuina. Una especie de milpiés es endémica: Aspidiophon divisum. Se incluyen las localidades de recolecta en Sinaloa.

A checklist of the centipedes (Chilopoda) and millipedes (Diplopoda) species recorded in Sinaloa, Mexico, is provided. Currently, seven species and one subspecies of centipedes and one species of millipedes are known to occur in this state. Two species and one subspecies are endemic to Mexico: Aztekophilus (Thylakiophilus) mexicanus, Scolopendra octodentata, and S. viridis genuina. One millipede species is endemic: Aspidiophon divisum. The checklist includes collecting localities in Sinaloa.