Services on Demand
Journal
Article
Indicators
Cited by SciELO
Access statistics
Related links
Cited by Google
Similars in SciELO
Similars in Google
Share
Revista Colombiana de Química
Print version ISSN 0120-2804
Abstract
ALVARADO, Magda E; GONZALEZ, Camila A; WASSERMAN, Moisés and RUBIANO, Claudia C. Estudo preliminar da enzima ubiquitina carboxi-terminal hidrolasa 14 (UBP6) em Giardia intestinalis: análise bioinformática estrutural e perfil transcricional durante encistamento. Rev.Colomb.Quim. [online]. 2014, vol.43, n.2, pp.32-40. ISSN 0120-2804. https://doi.org/10.15446/rev.colomb.quim.v43n2.53122.
Este artigo apresenta uma abordagem combinada com dois objetivos. A primeira é analisar a sequência informou da enzima ubiquitina carboxil-terminal hidrolase 14 de Giardia intestinalis (UBP6) através de métodos computacionais para encontrar os componentes relacionados com a sua função hipotética. A segunda é para determinar se o gene de codificação da proteína é expressa em G. intestinalis e, se for o caso, também determinar o seu padrão de transcrição ao longo do ciclo de vida do parasita. Foi estabelecido que a proteína pertence à família de deubiquitinases Cys-dependentes e mais especificamente para proteases específicas de ubiquitina (USPs por ubiquitin specific proteases). Além disso, o centro catalítico com a tríade completo, bem como as características típicas do motivo USP também foram identificados. Uma vez que os resultados computacionais sugerem que a enzima poderia ser funcional, a transcrição reversa acoplada a PCR foi utilizado como uma primeira abordagem para determinar se, de facto, o gene codificante é expressa no parasita. Curiosamente, verificou-se não só que o gene é expresso, mas também que há uma variação de transcrição ao longo do ciclo de vida do parasita. Estes dois elementos são o ponto de partida para estudos posteriores, uma vez que tentativas sugerem que esta enzima pode estar envolvida no refill de proteínas que ocorre durante o parasita encistamento. Embora preliminares, este estudo é o primeiro relatório relativo ao estudo de uma enzima deubiquitinadora específica no parasita intestinalis.
Keywords : Deubiquitinases; ubiquitina; Giardia intestinalis; encistamento.