Abstract

MONROY-MENA, Santiago et al. Seleção de genes de referência para análise de transcrição no modelo cravo (Dianthus Caryophyllus L.) - Fusarium oxysporum f. sp. dianthi. Rev.Colomb.Quim. [online]. 2019, vol.48, n.2, pp.5-14.  Epub July 03, 2019. ISSN 0120-2804.  https://doi.org/10.15446/rev.colomb.quim.v48n2.72771.

Neste trabalho foram validados genes de referencia para estudos de transcrição no modelo cravo - Fusarium oxysporum f. sp. dianthi. Genes associados a processos básicos celulares, anteriormente usados como genes de referencia noutros modelos planta-patógeno, foram selecionados e se determinou o efeito, sobre a sua expressão, que apresentava a inoculação com o patógeno. Foi realizado um desenho de iniciadores para os diferentes genes candidatos para verificou a sua presença no genoma de cravos cultivados na Colômbia, e uma transcrição constitutiva em diferentes tecidos da planta com a técnica de transcrição reversa e posterior reação em cadeia da polimerase (RT-PCR). Em seguida, os níveis de transcrição dos genes candidatos foram avaliados por RT-qPCR em caules e raízes de duas variedades com diferentes níveis de resistência à doença, que tinham sido inoculados com o patógeno. A validação estatística realizada por ANOVA y com os programas GeNorm y Normfinder, permitiram determinar que os genes que codificam para uma histona H3 y para o ARNr 18S, não apresentam variação nos seus níveis de expressão por efeito da inoculação, sugerindo que podem ser usados como genes de referencia em estudos de transcrição nesta interação planta-patógeno.

Keywords : cravo; Fusarium oxysporum f. sp. dianthi; RT-qPCR; ARNr 18S; histona.

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