Services on Demand
Journal
Article
Indicators
Cited by SciELO
Access statistics
Related links
Cited by Google
Similars in SciELO
Similars in Google
Share
Revista Colombiana de Ciencias Hortícolas
Print version ISSN 2011-2173
Abstract
LOPEZ-CANDELO, JOSÉ ENRIQUE; VIAFARA-VEGA, RONALD ANDRÉS and CARDENAS-HENAO, HEIBER. Caracterización molecular por SSR-HRM de germoplasma colombiano cultivado de Capsicum chinense Jacq. (Solanaceae). rev.colomb.cienc.hortic. [online]. 2022, vol.16, n.2, e13363. Epub Feb 18, 2023. ISSN 2011-2173. https://doi.org/10.17584/rcch.2022v16i2.13363.
Este estudio es la primera aproximación al conocimiento de la diversidad genética de poblaciones cultivadas de chile habanero (Capsicum chinense) en Colombia utilizando SSR-HRM. Se caracterizaron tres líneas de chile habanero con ocho marcadores microsatélites utilizando la técnica High-Resolution Melting (HRM). Veintisiete individuos de la línea original HL y 30 de cada línea derivada HL-70 y HL67 fueron genotipificados. Tres microsatélites resultaron monomórficos y cinco polimórficos; sin embargo, se detectó una alta diversidad alélica en el estado homocigoto en los 87 individuos evaluados. El marcador Ng8 diferenció las líneas HL-original y HL-67 de la línea HL-70 a través de sus perfiles de HRM. El análisis de varianza molecular (AMOVA) reveló que el 52% de la variación genética existía dentro de las líneas. La línea HL-67 fue más similar a la línea HL-original que a la línea HL-70, HL-70 registró la mayor diversidad genética con respecto a las líneas derivadas y, por lo tanto, podría ser considerada en un nuevo programa de mejoramiento. En contraste, la línea HL-67, debido a su alta homogeneidad genética, podría potencialmente utilizarse para evaluar diferentes condiciones ambientales en busca de condiciones óptimas para aumentar su productividad y picor. Finalmente, la comparación de los perfiles de HRM obtenidos con los marcadores monomórficos (Ng 33, Ng 18 y Ng 10) nos permitió diferenciar entre las especies C. chinense y C. frutescens, esta diferenciación es difícil debido a la alta similitud morfológica entre estas dos especies y generalmente se evalúa en la etapa de floración, mientras que los perfiles de HRM se pueden realizar en cualquier etapa de la planta.
Keywords : selección artificial; identificación y discriminación de especies cultivadas; diversidad genética de cultivos; utilidad de polimorfismos de nucleótido simple.