Abstract

BEDOYA, Óscar  and  BUSTAMANTE, Santiago. CNN-PROMOTER, NOVO PROGRAMA PARA A PREDIÇÃO DE PROMOTORES BASEADO EM REDES NEURONAIS. Rev.EIA.Esc.Ing.Antioq [online]. 2011, n.15, pp.153-164. ISSN 1794-1237.

Neste artigo a presenta-se um novo programa para a predição de promotores chamado CNN-Promoter, que toma como entrada sequências de DNA e as classifica como promotor ou não promotor. Desenvolveramse diversos métodos para predizer as regiões promotoras em organismos eucariotas, muitos dos quais se baseiam em modelos de Markov, árvores de decisão e métodos estatísticos. Apesar da variedade de programas existentes para a predição de promotores, precisa-se ainda melhorar os valores de sensibilidade e especificidade. Propõe-se um novo programa que se baseia na estratégia de mistura de experientes usando redes neuronais. Os resultados obtidos nas provas atingem valores de sensibilidade e especificidade de 100 % no treinamento e de 74,5 % de sensibilidade e 82,7 % de especificidade nos conjuntos de validação e prova.

Keywords : Predição de promotores; redes neuronais; estratégia de consenso.

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