Resumo

VALLEJO C., Daniela; GUTIERREZ S., Pablo Andrés  e  MARIN M., Mauricio. Caracterización del genoma de una variante de Potato virus S (PVS) obtenida en brotes de tubérculos de Solanum phureja Juz. et Buk.. Agron. colomb. [online]. 2016, vol.34, n.1, pp.51-60. ISSN 0120-9965.  https://doi.org/10.15446/agron.colomb.v34n1.53161.

El Potato virus S (PVS) es un virus prevalente en los cultivos de papa de Colombia y otros lugares del mundo. Ha sido dividido en dos razas principales denominadas PVSO (Ordinaria) y PVSA (Andina), que representan a su vez dos linajes genéticos divergentes. En este trabajo se obtuvo la secuencia del genoma completo de un aislamiento de PVS denominado PVS_Antio- quia, por secuenciación masiva de nueva generación (Illumina HiSeq-2000) realizada sobre extractos de transcriptoma de tubérculos de Solanum phureja (var. Criolla Colombia). A partir de este genoma se diseñaron primers específicos para la detección por RT-qPCR de variantes colombianas de PVS (RVC y Antioquia), validándose su utilidad en pruebas de detección en tejido foliar y de tubérculos de S. phureja. El genoma de PVS_Antioquia tiene un tamaño de 8.483 nt que codifica para seis ORFs: RdRp (223 kDa), TGBp1-3 (25kDa, 12kDa, 7kDa) CP (32,3 kDa) y NABP (11 kDa), y comparte altos niveles de identidad con el aislamiento PVS_RVC (>95%) de Colombia y tan solo de 81 a 82% con representantes de PVSA y PVSO de diferentes países del mundo. Los primeros diseñados permitieron detectar el virus en 80 y 60% de 15 muestras foliares y 15 de tubérculos, respectivamente, lo que puede indicar la ocurrencia de altos niveles de incidencia de PVS y sus variantes en los cultivos de papa de Antioquia.

Palavras-chave : virus de plantas; carlavirus; técnicas de diagnóstico; ELISA; PCR; papas.

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